Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465520
• Subject: NM_001302339.1
• Aligned Length: 1123
• Identities: 959
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGTCCCCGTGTCCTCCCCAGCAGAGCAGGAACAGGGTGAT-ACAGCTGTCCACTT-CAGAGCTAGGAGAGATG  72
            |||.|||||||||||||.|||||||.|||||||| |||.|| ||||||| ||..|| ..|||||.|||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCCGTGTCCTCCTCAGCAGAACAGGAACA-GGTTATCACAGCTG-CCTGTTGGGGAGCTTGGAGAGATG  72

Query   73  GAACTGACTTGGCAGGAGATCATGTCCATCACCGAGCTGCAGGGTCTGAATGCTCCAAGTGAGCCATCATTTGA  146
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.||||||||||.||||.|||||
Sbjct   73  GAACTGACTTGGCAAGAGATCATGTCCATTACTGAGCTGCAGGGTCTAAATGTTCCAAGTGAGACATCTTTTGA  146

Query  147  GCCCCAAGC-CCCAGCTCCATACCTTGGACCTCCACCACCCACAACTTACTGCCCCTGCTCAATCCACCCAGAT  219
            |||.||||| |||| |.|||||||.|||.||.|..|||||..||||.||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  147  GCCTCAAGCACCCA-CCCCATACCCTGGGCCACTGCCACCTCCAACATATTGCCCCTGTTCAATTCATCCAGAT  219

Query  220  TCTGGCTTCCCACTTCCTCCACCACCTTATGAGCTCCCAGCATCCACATCCCATGTCCCAGATCCCCCATACTC  293
            .|.||||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|..||||||||
Sbjct  220  GCAGGCTTCTCCCTTCCCCCACCATCTTATGAGCTCCCAGCATCTACTCCCCATGTCCCAGAACTACCATACTC  293

Query  294  CTATGGCAACATGGCCATACCAGTCTCCAAGCCACTGAGCCTCTCAGGCCTGCTCAGTGAGCCGCTCCAAGACC  367
            ||||||.||..|.|||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||||||||||.||||||.||||.|||||
Sbjct  294  CTATGGTAATGTAGCCATACCAGTGTCAAAGCCACTTACCCTTTCAGGCCTGCTCAATGAGCCCCTCCCAGACC  367

Query  368  CCTTAGCCCTCCTGGACATTGGGCTGCCAGCAGGGCCACCTAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCCGACTCAGGA  441
            .||||||.||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  368  ACTTAGCTCTCCTGGACATTGGGCTGCCAGTGGGGCAACCCAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCTGACTCAGGA  441

Query  442  TTATCCCTCAACTATAGCGATGCTGAATCTCTTGAGCTGGAGGGGACAGAGGCTGGTCGGCGGCGCAGCGAATA  515
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|..||||||||..|||||.|.|||||.||
Sbjct  442  TTATCCCTCAACTACAGTGATGCAGAATCTCTTGAGCTAGAGGGTATGGAGGCTGGCAGGCGGAGGAGCGAGTA  515

Query  516  TGTAGAGATGTACCCAGTGGAGTACCCCTACTCACTCATGCCCAACTCCTTGGCCCACTCCAACTATAC-CTTG  588
            .|..||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|||||||||| ||| 
Sbjct  516  CGCGGACATGTACCCAGTGGAGTATCCTTACTCACTTATGCCCAATTCTTTGGCCCATCCCAACTATACTCTT-  588

Query  589  CCAGCTGCTGAGACCCCCTTGGCCTTAGAGCCCTCCTCAGGCCCTGTGCGGGCTAAGCCCACTGCACGGGGGGA  662
            |||.|..|||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.|||||||||||..|||..||.|||||
Sbjct  589  CCACCCACTGAGACACCCTTGGCCTTAGAGTCATCCTCCGGTCCAGTTCGGGCTAAGCCTGCTGTCCGTGGGGA  662

Query  663  GGCAGGGAGTCGGGATGAACGTCGGGCCTTGGCCATGAAGATTCCTTTTCCTACGGACAAGATTGTCAACTTGC  736
            |||||||||||||||.||.||.||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  663  GGCAGGGAGTCGGGACGAGCGGCGAGCCCTGGCCATGAAGATTCCTTTCCCTACGGACAAGATAGTTAACTTGC  736

Query  737  CGGTAGATGACTTTAATGAGCTATTGGCAAGGTACCCGCTGACAGAGAGCCAGCTAGCGCTAGTCCGGGACATC  810
            ||||||||||||||||||||.|.||||||..|||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  737  CGGTAGATGACTTTAATGAGTTGTTGGCACAGTATCCGCTAACGGAGAGCCAGCTGGCTCTAGTTCGGGACATC  810

Query  811  CGACGACGGGGCAAAAACAAGGTGGCAGCCCAGAACTGCCGCAAGAGGAAGCTGGAAACCATTGTGCAGCTGGA  884
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  CGTCGACGGGGCAAGAACAAGGTGGCAGCCCAAAACTGTCGCAAGAGAAAACTGGAAACCATTGTGCAGCTGGA  884

Query  885  GCGGGAGCTGGAGCGGCTGACCAATGAACGGGAGCGGCTTCTCAGGGCCCGCGGGGAGGCAGACCGGACCCTGG  958
            |||.||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  885  GCGAGAGCTGGAGCGGCTGAGCAGTGAAAGGGAGCGGCTTCTCAGAGCCCGAGGGGAGGCTGACCGCACTCTGG  958

Query  959  AGGTCATGCGCCAACAGCTGACAGAGCTGTACCGTGACATTTTCCAGCACCTTCGGGATGAATCAGGCAACAGC  1032
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  959  AGGTCATGCGCCAACAGCTGGCAGAGCTGTACCATGATATTTTCCAGCATCTTCGGGATGAATCTGGCAACAGT  1032

Query 1033  TACTCTCCTGAAGAGTACGCGCTGCAACAGGCTGCCGATGGGACCATCTTCCTTGTGCCCCGGGGGACCAAGAT  1106
            |||||.||.||.||.||.|..||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1033  TACTCACCAGAGGAATATGTACTGCAACAGGCTGCTGATGGTGCCATCTTTCTGGTACCCCGTGGAACCAAAAT  1106

Query 1107  GGAGGCCACAGAC  1119
            ||||||.|||||.
Sbjct 1107  GGAGGCTACAGAT  1119