Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465520
• Subject: XM_006520569.2
• Aligned Length: 1192
• Identities: 959
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGTC  5
                                                                                 |||.|
Sbjct    1  ATGGTCAGATCAGGTTGCAGGAATCCTTTGTGCTTGTGGAGACCTGGGGCCATCAGCTGGCACAGTAGGATGCC  74

Query    6  CCCGTGTCCTCCCCAGCAGAGCAGGAACAGGGTGAT-ACAGCTGTCCACTT-CAGAGCTAGGAGAGATGGAACT  77
            ||||||||||||.|||||||.|||||||| |||.|| ||||||| ||..|| ..|||||.||||||||||||||
Sbjct   75  CCCGTGTCCTCCTCAGCAGAACAGGAACA-GGTTATCACAGCTG-CCTGTTGGGGAGCTTGGAGAGATGGAACT  146

Query   78  GACTTGGCAGGAGATCATGTCCATCACCGAGCTGCAGGGTCTGAATGCTCCAAGTGAGCCATCATTTGAGCCCC  151
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.||||||||||.||||.||||||||.|
Sbjct  147  GACTTGGCAAGAGATCATGTCCATTACTGAGCTGCAGGGTCTAAATGTTCCAAGTGAGACATCTTTTGAGCCTC  220

Query  152  AAGC-CCCAGCTCCATACCTTGGACCTCCACCACCCACAACTTACTGCCCCTGCTCAATCCACCCAGATTCTGG  224
            |||| |||| |.|||||||.|||.||.|..|||||..||||.||.||||||||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct  221  AAGCACCCA-CCCCATACCCTGGGCCACTGCCACCTCCAACATATTGCCCCTGTTCAATTCATCCAGATGCAGG  293

Query  225  CTTCCCACTTCCTCCACCACCTTATGAGCTCCCAGCATCCACATCCCATGTCCCAGATCCCCCATACTCCTATG  298
            ||||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|..|||||||||||||
Sbjct  294  CTTCTCCCTTCCCCCACCATCTTATGAGCTCCCAGCATCTACTCCCCATGTCCCAGAACTACCATACTCCTATG  367

Query  299  GCAACATGGCCATACCAGTCTCCAAGCCACTGAGCCTCTCAGGCCTGCTCAGTGAGCCGCTCCAAGACCCCTTA  372
            |.||..|.|||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||||||||||.||||||.||||.|||||.||||
Sbjct  368  GTAATGTAGCCATACCAGTGTCAAAGCCACTTACCCTTTCAGGCCTGCTCAATGAGCCCCTCCCAGACCACTTA  441

Query  373  GCCCTCCTGGACATTGGGCTGCCAGCAGGGCCACCTAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCCGACTCAGGATTATC  446
            ||.||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  442  GCTCTCCTGGACATTGGGCTGCCAGTGGGGCAACCCAAGCCCCAAGAAGACCCAGAATCTGACTCAGGATTATC  515

Query  447  CCTCAACTATAGCGATGCTGAATCTCTTGAGCTGGAGGGGACAGAGGCTGGTCGGCGGCGCAGCGAATATGTAG  520
            |||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|..||||||||..|||||.|.|||||.||.|..|
Sbjct  516  CCTCAACTACAGTGATGCAGAATCTCTTGAGCTAGAGGGTATGGAGGCTGGCAGGCGGAGGAGCGAGTACGCGG  589

Query  521  AGATGTACCCAGTGGAGTACCCCTACTCACTCATGCCCAACTCCTTGGCCCACTCCAACTATAC-CTTGCCAGC  593
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||..|||||||||| ||| |||.|
Sbjct  590  ACATGTACCCAGTGGAGTATCCTTACTCACTTATGCCCAATTCTTTGGCCCATCCCAACTATACTCTT-CCACC  662

Query  594  TGCTGAGACCCCCTTGGCCTTAGAGCCCTCCTCAGGCCCTGTGCGGGCTAAGCCCACTGCACGGGGGGAGGCAG  667
            ..|||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.|||||||||||..|||..||.||||||||||
Sbjct  663  CACTGAGACACCCTTGGCCTTAGAGTCATCCTCCGGTCCAGTTCGGGCTAAGCCTGCTGTCCGTGGGGAGGCAG  736

Query  668  GGAGTCGGGATGAACGTCGGGCCTTGGCCATGAAGATTCCTTTTCCTACGGACAAGATTGTCAACTTGCCGGTA  741
            ||||||||||.||.||.||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  737  GGAGTCGGGACGAGCGGCGAGCCCTGGCCATGAAGATTCCTTTCCCTACGGACAAGATAGTTAACTTGCCGGTA  810

Query  742  GATGACTTTAATGAGCTATTGGCAAGGTACCCGCTGACAGAGAGCCAGCTAGCGCTAGTCCGGGACATCCGACG  815
            |||||||||||||||.|.||||||..|||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  811  GATGACTTTAATGAGTTGTTGGCACAGTATCCGCTAACGGAGAGCCAGCTGGCTCTAGTTCGGGACATCCGTCG  884

Query  816  ACGGGGCAAAAACAAGGTGGCAGCCCAGAACTGCCGCAAGAGGAAGCTGGAAACCATTGTGCAGCTGGAGCGGG  889
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  885  ACGGGGCAAGAACAAGGTGGCAGCCCAAAACTGTCGCAAGAGAAAACTGGAAACCATTGTGCAGCTGGAGCGAG  958

Query  890  AGCTGGAGCGGCTGACCAATGAACGGGAGCGGCTTCTCAGGGCCCGCGGGGAGGCAGACCGGACCCTGGAGGTC  963
            |||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  959  AGCTGGAGCGGCTGAGCAGTGAAAGGGAGCGGCTTCTCAGAGCCCGAGGGGAGGCTGACCGCACTCTGGAGGTC  1032

Query  964  ATGCGCCAACAGCTGACAGAGCTGTACCGTGACATTTTCCAGCACCTTCGGGATGAATCAGGCAACAGCTACTC  1037
            |||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1033  ATGCGCCAACAGCTGGCAGAGCTGTACCATGATATTTTCCAGCATCTTCGGGATGAATCTGGCAACAGTTACTC  1106

Query 1038  TCCTGAAGAGTACGCGCTGCAACAGGCTGCCGATGGGACCATCTTCCTTGTGCCCCGGGGGACCAAGATGGAGG  1111
            .||.||.||.||.|..||||||||||||||.|||||..|||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1107  ACCAGAGGAATATGTACTGCAACAGGCTGCTGATGGTGCCATCTTTCTGGTACCCCGTGGAACCAAAATGGAGG  1180

Query 1112  CCACAGAC  1119
            |.|||||.
Sbjct 1181  CTACAGAT  1188