Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465559
• Subject: XM_006531966.3
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1361
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74
            |||||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74

Query   75  CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA  148
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct   75  CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA  148

Query  149  AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC  222
            |||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC  222

Query  223  GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA  296
            ||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA  296

Query  297  CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC  370

Query  371  AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC  444
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC  444

Query  445  CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG  518
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG  518

Query  519  CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG  592
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  519  CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG  592

Query  593  TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG  666
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  593  TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG  666

Query  667  CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT  740
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct  667  CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT  740

Query  741  GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA  811
            ||||   |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  741  GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA  814

Query  812  TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC  885
            ||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||..
Sbjct  815  TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGGGCGGATGTCTGCTCAGGAGAAT  888

Query  886  ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA  959
            ..|||..|||||||.||||||.||||||||||..||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GTACCTGTCATGAATGGCGTCGCAGGCCCGGACAGCGAGGACTACAACCCCTGGGCTGACCGAAAGGCTGCCCA  962

Query  960  GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  1033
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCCAAATCCCTGTCTCCCCCGCAGTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  1036

Query 1034  AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACAGCCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCA  1107
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||   |.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCA---CTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCA  1107

Query 1108  GCCGGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCT  1181
            ||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 1108  GCTGGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCT  1181

Query 1182  CCTGAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGA  1255
            .|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1182  GCTGAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGA  1255

Query 1256  GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1256  GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGA  1329

Query 1330  CTGCACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCC  1403
            .||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1330  TTGCATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCC  1403

Query 1404  ACCCCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACA  1477
            .||.||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.|||||||
Sbjct 1404  CCCTCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACA  1477

Query 1478  GTGTGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAGTGGCAGCGGCACG  1551
            |.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..|||||||           ||
Sbjct 1478  GCGTGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAG-----------CG  1540

Query 1552  CTGGTGTCCACAGTG---------  1566
            |.|.||||.| ||||         
Sbjct 1541  CGGATGTCGA-AGTGGCCAGATTT  1563