Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000465566
Subject:
NM_001243042.1
Aligned Length:
1101
Identities:
896
Gaps:
90

Alignment

Query    1  ATGGTGGTCATGGCACCCCGAACCCTCTTCCTGCTACTCTCGGGGGCCCTGACCCTGACCGAGACCTGGGCGGG  74
            |||..|||||||||.||||||.|||||.|||||||.||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCAGCGCCGCCGTGTCCCGGCCCAGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCATGG  148
            ||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|..|||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACTCGGCGTGTCCGAGGATGGAGCCGCGGGCGCCG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||...||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG  222

Query  223  TGGGTGGAGCGGGAGGGGCCAGAGTATTGGGAAGAGGAGACACGGAACACCAAGGCCCACGCACAGACTGACAG  296
            ||||||||||.|||||||||.|||||||||||...||||||||.||||..||||..|||.||||||.|||||.|
Sbjct  223  TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAACTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGACCG  296

Query  297  AATGAACCTGCAGACCCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCAGTTCTCATACCCTCCAGTGGATGATTG  370
            |.|||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||.|||||||||.|||||..||
Sbjct  297  AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTATG  370

Query  371  GCTGCGACCTGGGGTCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGGTATGAACAGTATGCCTACGATGGCAAGGATTACCTC  444
            ||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||..||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  371  GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC  444

Query  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCAGCGGACACTGCGGCTCAGATCTCCAAGCGCAAGTGTGAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||||..|||||
Sbjct  445  GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAGGC  518

Query  519  GGCCAATGTGGCTGAACAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCACAGATACCTGGAGA  592
            ||||..||.|||.||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA  592

Query  593  ACGGGAAGGAGATGCTGCAGCGCGCGGACCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCACCCTGTCTTTGACTATGAG  666
            ||||||||||||.||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||
Sbjct  593  ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATGAG  666

Query  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCATACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA  740

Query  741  CCAGACCCAGGACGTGGAGCTCGTGGAGACCAAGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814
            |||||||||||||...|||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG  814

Query  815  TGGTGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCATGAGGGGCTGCCGGAGCCCCTCATGCTG  888
            ||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||..||||||||||..|||
Sbjct  815  TGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCCTG  888

Query  889  AGATGGAAGCAGTCTTCCCTGCCCACCATCCCCATCATGGGTATCGTTGCTGGTCTGGTTGTCCTTG------C  956
            ||.|||.|||..|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||.|      .
Sbjct  889  AGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTGGTTGTCCT  962

Query  957  AGCTGTAGTCACTGGAGCTGCGGTCGCTGCTGTGCTGTGGAGGAAGAAGAGCTCAGAT----------------  1014
            ||||   |||..||||||||.||||.|.|||.||.||||.||||.|||||||||||.|                
Sbjct  963  AGCT---GTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCT  1033

Query 1015  -----------------------------------------------------------------  1014
                                                                             
Sbjct 1034  GCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCACTTGTAAAGCC  1098