Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465580
• Subject: NM_001300821.3
• Aligned Length: 1848
• Identities: 1831
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG  74

Query   75  GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG  148

Query  149  ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222

Query  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT  296

Query  297  TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG  370

Query  371  TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT  444

Query  445  TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA  518

Query  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG  592

Query  593  ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC  666

Query  667  AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG  740

Query  741  GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT  814

Query  815  CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC  888

Query  889  CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA  962

Query  963  TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG  1036

Query 1037  ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT  1110

Query 1111  GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184

Query 1185  ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA  1258

Query 1259  CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAA---------------ATGCACGAAGG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||
Sbjct 1259  CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAGTAAGTCAGACCAGGATGCACGAAGG  1332

Query 1318  AGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACC  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACC  1406

Query 1392  TCCCAAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTT  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCCAAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTT  1480

Query 1466  CTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCT  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCT  1554

Query 1540  CCAGCTCAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGG  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGCTCAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGG  1628

Query 1614  CCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGAGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAG  1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGCGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAG  1702

Query 1688  ATGGCAAAAAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCTAAGTTC  1761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  ATGGCAAAAAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCCAAGTTC  1776

Query 1762  AGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA  1848