Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465580
• Subject: NM_145625.3
• Aligned Length: 1833
• Identities: 1650
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCTAACAGACTTTCTGGCTGAGGATGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACCATCTCCCTAACGGACTTTCTAGCTGAGGATGG  74

Query   75  GGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAG  148
            .||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  AGGAACTGGTGGAGGAAGCACCTATGTCCCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACAGACGATCTGGAAGGAG  148

Query  149  ATGTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222
            ||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTGTCAACAACTTGGCATAGTAACGATGATGACGTGTACAGGGCGCCTCCAATTGACCGTTCCATCCTTCCC  222

Query  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCAATATTGACCGGAGCCGTCTTCCCAAGTCGCCACCCTACACTGCTTT  296

Query  297  TCTAGGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCGAGGATTAAATATCAGTGCAG  370
            .|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  CCTAGGGAATCTGCCCTATGATGTGACAGAAGACTCCATTAAGGATTTCTTTAGAGGATTAAATATCAGCGCTG  370

Query  371  TGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAGAGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGAT  444
            |.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACGCTTACCACGGGAACCCAGCAATCCAGACAGGTTGAAAGGTTTCGGCTACGCAGAATTTGAGGACCTGGAT  444

Query  445  TCCCTGCTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGAGTGGACGTTGCTGATCA  518
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  TCTCTGCTCAGTGCTCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCGTGTGGATGTTGCTGATCA  518

Query  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTTTTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AGCACAGGATAAAGACAGGGATGACCGTTCTTTTGGTCGAGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGACACAG  592

Query  593  ACTGGAGGGCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGATGATAGCTTTGGAGAC  666
            ||||||||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGGAGGGCCCGTCCCACCACAGACAGTTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGCGATGATAGCTTTGGAGAC  666

Query  667  AAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCG  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||.|
Sbjct  667  AAGTATCGAGATCGTTACGATTCAGACCGGTATCGGGATGGGTATAGGGACGGATATCGGGACGGCCCACGCAG  740

Query  741  GGATATGGATCGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGATAGAGGCTATGATT  814
            .||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|
Sbjct  741  AGACATGGACCGCTATGGGGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGACCGAGGCTATGACT  814

Query  815  CCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTGGGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGAC  888
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  CCAGGATAGGCAGTGGCAGAAGGGCATTTGGAAGTGGGTACCGGAGAGATGATGACTACAGAGGAGGTGGGGAC  888

Query  889  CGCTATGAAGACCGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTCTCGGGATGATTA  962
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCTATGAAGACCGCTATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGGGATGACTACTCTCGGGATGATTA  962

Query  963  TAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCAAAGACCCAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATG  1036
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||||.||.||||||||.||..||||||||||.||||
Sbjct  963  TAGGCGTGATGACAGAGGTCCCCCCCAGAGACCCAGACTGAACCTCAAGCCTCGAAGCGCTCCTAAGGAGGATG  1036

Query 1037  ATTCCTCTGCTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAGCCTGTTGACACAGCT  1110
            |..||||.||.||.|||||||||||||..||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCCTCCGCCAGCACCTCCCAGTCCAGCCGGGCAGCCTCCATCTTTGGAGGGGCGAAGCCTGTTGACACAGCT  1110

Query 1111  GCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAAGGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184
            |||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAGGGAAAGAGAAGTAGAGGAGCGGCTACAGAAGGAGCAGGAGAAGCTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAA  1184

Query 1185  ACTAGAACGACGGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGGGAACGGTCGAGGA  1258
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 1185  ACTAGACCGCCGGCCCCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAAAGAGAACGGTCAAGGA  1258

Query 1259  CAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCACATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG  1332
            ||||||||||||||||.||.||||||.||||..||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGGAAGTGAGTCATCGCAGACTGGGGCCTCAGCCACATCTGGCAGAAATACACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAG  1332

Query 1333  TCTCTAGAAAATGAAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCCAAACCTGATCA  1406
            |||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1333  TCTCTAGAAAATGAAACCCTCAATAAAGAAGAAGACTGTCACTCTCCAACCTCTAAGCCTCCTAAACCTGACCA  1406

Query 1407  GCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTC  1480
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407  GCCTCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAATGCGTGGGTGAAGCGAAGCTCTAACCCTCCTGCCC  1480

Query 1481  GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCTCAACCATCT  1554
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||..||.||..||
Sbjct 1481  GATCTCAGAGCTCAGACACAGAGCAGCCGTCCCCTACAAGTGGTGGAGGGAAAGTAGCTGCAGTCCAGCCCCCT  1554

Query 1555  GAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGGGATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTC  1628
            ||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||.||||.|.||..||||.||.||||||||.||||.|.||.
Sbjct 1555  GAGGAAGGACCATCAAGAAAAGATGGAAATAAAGTGGATGTGGTGGGTGCCACACAAGGCCAAGCTGGAAGCTG  1628

Query 1629  TAGCCGTGGTCCAGGAGACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAAAAGGATC  1702
            .|||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1629  CAGCCGTGGTCCCGGGGATGGAGGGAGCAGAGACCACTGGAAGGACTTGGATAGGAAGGATGGCAAAAAAGATC  1702

Query 1703  AAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAATCCAGCTTCTAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAG  1776
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1703  AAGACTCCAGATCTGCGCCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAGAACCCAGCCTCTAAGTTCAGCTCTGCAAGCAAG  1776

Query 1777  TATGCTGCTCTCTCTGTTGATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA  1833
            ||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||..|||||||.||.||.|...|.||.
Sbjct 1777  TACGCTGCTCTGTCTGTGGATGGCGAGGATGAGGATGAGGGCGACGACTGCACTGAG  1833