Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465583
- Subject:
- NM_001159736.1
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1454
- Gaps:
- 402
Alignment
Query 1 ATGGCGGCAGCTCCGCCGCTTTCCAAGGCCGAGTATCTGAAGCGTTACTTGTCCGGGGCAGATGCCGGCGTCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCAGCTCCGCCGCTTTCCAAGGCCGAGTATCTGAAGCGTTACTTGTCCGGGGCAGATGCCGGCGTCGA 74
Query 75 CCGGGGATCTGAGTCCGGTCGCAAGCGTCGCAAAAAGCGGCCGAAGCCTGGCGGGGCCGGCGGCAAGGGAATGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGGGGATCTGAGTCCGGTCGCAAGCGTCGCAAAAAGCGGCCGAAGCCTGGCGGGGCCGGCGGCAAGGGAATGC 148
Query 149 GGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGATGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGATTGTGGATGATGATGTGAGCTGGACAGCTATCTCCACAACCAAACTAGAAAAGGAGGAAGAGGAAGATGAT 222
Query 223 GGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCGTTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAGATTTGCCTGTGGTGGCAGAGTTTGTGGATGAGCGGCCAGAAGAGGTAAAGCAGATGGAGGCCTTTCGTTC 296
Query 297 CAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATACCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGTGCCAAATGGAAGCTTCTGGGAGGCCACAACGAAGACCTACCCTCAAACAGACATTTTCGTCACGATACCC 370
Query 371 CGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACCCCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGATTCATCTCCTAGGAGGGTCCGTCATGGTACCCCAGATCCATCTCCTAGGAAGGACCGTCATGACACCCCG 444
Query 445 GATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCAGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTCAGA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATCCATCTCCTAGGAGGGCCCGTCATGACACCCCGGATCCTTCTCCCCTCAGAGGGGCTCGTCATGACTCAGA 518
Query 519 CACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATTCTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACATCTCCTCCCAGGAGGATCCGTCATGACTCCTCAGACACTTCACCCCCAAGGAGGGCCCGTCATGATTCTC 592
Query 593 CAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTCAGGTGCATCTCCTAGGAGAGTCCGTCATGATTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATCCTTCTCCCCCAAGGAGGCCTCAGCATAATTCTTC---------------------------------- 632
Query 667 CCAGATCCCTCTCCTCCTAGGCGAGCCCGTCATGGTTCCTCAGATATCTCTTCCCCCAGAAGGGTCCATAACAA 740
Sbjct 633 -------------------------------------------------------------------------- 632
Query 741 CTCCCCTGACACATCTAGGAGGACTCTTGGCTCTTCAGACACACAGCAACTCAGAAGGGCCCGTCATGACTCCC 814
Sbjct 633 -------------------------------------------------------------------------- 632
Query 815 CTGATTTGGCTCCTAATGTCACTTATTCCCTGCCCAGAACCAAAAGTGGTAAAGCCCCAGAAAGAGCCTCTAGC 888
Sbjct 633 -------------------------------------------------------------------------- 632
Query 889 AAGACTTCTCCACATTGGAAGGAGTCAGGAGCCTCCCATTTGTCATTCCCAAAGAACAGCAAATATGAGTATGA 962
Sbjct 633 -------------------------------------------------------------------------- 632
Query 963 CCCTGACATCTCTCCTCCACGAAAAAAGCAAGCAAAATCCCATTTTGGAGACAAGAAGCAGCTTGATTCCAAAG 1036
||
Sbjct 633 ------------------------------------------------------------------------AG 634
Query 1037 GTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGATTCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 635 GTGACTGCCAGAAAGCAACTGATTCAGACCTTTCTTCTCCACGGCATAAACAAAGTCCAGGGCACCAGGATTCT 708
Query 1111 GATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAGGAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 GATTCAGATCTGTCACCTCCACGGAATAGACCTAGACACCGGAGCTCTGATTCTGACCTCTCTCCACCAAGGAG 782
Query 1185 GAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGGCTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 783 GAGACAGAGGACCAAATCTTCTGATTCTGACCTGTCCCCGCCTCGAAGGAGTCAGCCTCCTGGAAAGAAGGCTG 856
Query 1259 CACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAGGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 CACACATGTATTCTGGGGCTAAAACTGGGTTGGTGTTAACTGACATACAGCGAGAACAGCAGGAGCTCAAGGAA 930
Query 1333 CAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGGTCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 CAGGATCAAGAAACCATGGCATTTGAAGCTGAATTTCAATATGCTGAAACCGTATTTCGAGATAAGTCTGGTCG 1004
Query 1407 TAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGCTGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 TAAGAGGAATTTGAAACTCGAACGTTTAGAGCAAAGGAGGAAAGCAGAAAAGGACTCAGAGAGAGATGAGCTGT 1078
Query 1481 ATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAGATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 ATGCCCAGTGGGGAAAAGGGCTTGCCCAGAGCCGGCAACAGCAACAAAATGTGGAGGATGCAATGAAAGAGATG 1152
Query 1555 CAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGGGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 CAAAAGCCTCTGGCCCGCTATATTGATGACGAAGATCTGGATAGGATGCTAAGAGAACAGGAAAGAGAGGGGGA 1226
Query 1629 CCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACAGTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227 CCCTATGGCCAACTTCATCAAGAAGAATAAGGCCAAGGAGAACAAGAATAAAAAAGTGAGACCTCGCTACAGTG 1300
Query 1703 GTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAATGGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 GTCCAGCACCTCCTCCCAACAGATTTAATATCTGGCCTGGATATCGCTGGGACGGAGTGGACAGATCCAATGGA 1374
Query 1777 TTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGTTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 TTTGAACAGAAGCGCTTTGCCAGGCTTGCCAGCAAGAAGGCAGTGGAGGAACTTGCCTACAAATGGAGTGTTGA 1448
Query 1851 GGATATG 1857
|||||||
Sbjct 1449 GGATATG 1455