Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465586
- Subject:
- NM_001098168.1
- Aligned Length:
- 2898
- Identities:
- 2507
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCTAG 74
Query 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG 148
|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTTCACCACGCGCACGGCCCAGTGCCGGAACACCGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG 148
Query 149 TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|.||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 149 TTCTCTACAAAATGAAGAAATCTGTGAAGGCAATCAATATCTCTGGGCTGGCACACGTGGAGAACGAGGAACAG 222
Query 223 TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT 296
|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 223 TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTCGGTGGCAACTGTGTGTGCAGAGATGATCCAGACTTAGGAAGCGCGTTTCT 296
Query 297 GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT 370
|||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 297 GAAGTTCTCTGTGTTCACCAAGGAGTTGACGGCACTCTTCAAAAACCTGATTCAGAACATGAACAACATCATCT 370
Query 371 CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA 444
|.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 CGTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAAGGAGATCTGAAAGGAGTAAAAGGGGATCTGAAAAAGCCCTTTGATAAA 444
Query 445 GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAAATAGAAAAGGAGAAAAAGGAGCATGCCAAGCTCCACGGGAT 518
Query 519 GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA 592
||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 519 GATTCGTACTGAAATAAGCGGGGCTGAGATTGCAGAGGAGATGGAGAAGGAAAGACGGTTCTTCCAGCTGCAGA 592
Query 593 TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA 666
||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 TGTGTGAGTACCTGCTGAAGGTCAATGAAATCAAGGTGAAAAAGGGAGTGGATTTGCTTCAGAATCTGATCAAG 666
Query 667 TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC 740
||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 667 TACTTTCACGCCCAGTGCAATTTTTTCCAGGATGGATTGAAAGCAGTAGAAAGCCTCAAGCCTTCCATCGAGAC 740
Query 741 GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA 814
|||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|..|.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 741 GCTCTCCACGGACCTCCACACCATCAAACAGGCCCAGGATGAGGAACGGCGACAGCTGATACAACTTCGAGATA 814
Query 815 TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG---------GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT 879
|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||| |||||.|||.||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 815 TTTTGAAGTCAGCATTGCAGGTGGAACAGAAAGAGTCTAGGAGAGACTCACAACTTCGCCAAAGTACAGCCTAC 888
Query 880 AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG 953
|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|.|||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 AGCTTACATCAACCTCAGGGAAACAAGGAGCATGGAACAGAGAGGAACGGGAACCTCTACAAGAAGAGCGATGG 962
Query 954 GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA 1027
||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 963 GATCCGGAAAGTGTGGCAGAAGAGGAAGTGTTCCGTTAAAAATGGCTTCCTCACCATCTCCCACGGCACTGCCA 1036
Query 1028 ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC 1101
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1037 ACCGGCCACCTGCCAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAATCCTGAGGAGAAGAAGTGTTTCGAC 1110
Query 1102 CTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT 1175
||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CTCATATCACATGACAGGACGTACCACTTCCAAGCGGAAGACGAACAAGAATGTCAGATATGGATGTCTGTACT 1184
Query 1176 GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC 1249
|||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGAACAGCAAGGAAGAAGCTCTGAACAACGCCTTTAAGGGTGATGACAACACTGGAGAAAATAACATCGTCC 1258
Query 1250 AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG 1323
||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 AAGAGCTGACCAAGGAGATCATCTCGGAGGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTGTGCTGCGACTGTGGGGCA 1332
Query 1324 CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT 1397
||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1333 CCAGATCCGACGTGGCTCTCTACCAACCTGGGCATCCTGACTTGCATCGAGTGCTCTGGGATCCACCGGGAGCT 1406
Query 1398 GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA 1471
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1407 GGGGGTTCATTACTCCAGGATGCAGTCCCTGACATTAGATGTATTGGGAACGTCTGAGCTTCTGCTTGCCAAGA 1480
Query 1472 ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA 1545
||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||..||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1481 ATATCGGGAATGCAGGCTTTAATGAAATTATGGAGTGTTGCCTACCGTCTGAGGACCCAGTCAAGCCCAACCCA 1554
Query 1546 GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA 1619
|||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1555 GGCAGTGACATGATTGCAAGGAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATGGAGAGGAGATATGCACGGAAAAAGCA 1628
Query 1620 CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG 1693
.||.||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629 TGCCGACACCGCGGCGAAGCTCCACAGCCTTTGCGAGGCCGTCAAGACCAGAGACATTTTTGGGTTACTCCAAG 1702
Query 1694 CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC 1767
|||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1703 CTTATGCTGATGGTGTGGACCTGACAGAGAAAATCCCACTGGCCAATGGGCATGAGCCAGATGAGACAGCCCTC 1776
Query 1768 CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT 1841
||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777 CATCTTGCAGTCAGATCTGTGGACCGGACTTCCCTTCACATTGTAGACTTCCTGGTCCAGAACAGTGGGAACCT 1850
Query 1842 GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT 1915
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1851 GGATAAACAGACAGGCAAGGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACAGACAATGCTGAGTGCCTCAAGC 1924
Query 1916 TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC 1989
|.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1925 TCCTCCTGCGGGGAAAAGCCTCCATTGAGATAGCCAATGAGTCAGGAGAGACCCCGTTGGACATTGCTAAGCGG 1998
Query 1990 CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA 2063
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1999 CTCAAGCACGAACACTGTGAGGAACTGCTCACTCAGGCCTTGTCGGGGCGGTTTAACTCCCATGTTCACGTCGA 2072
Query 2064 ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC 2137
.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||.||||
Sbjct 2073 GTATGAATGGCGGCTGCTGCACGAGGACCTGGATGAGAGCGACGACGATGTGGACGAGAAGCTACAGCCTAGTC 2146
Query 2138 CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT 2211
|||||||.|||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||.||||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2147 CCAACCGACGGGAGGACCGGCCTGTTAGCTTCTACCAGCTGGGGTCCAGCCAGTTTCAGTCCAATGCTGTGTCT 2220
Query 2212 TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGA-GGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA 2284
||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||| ||||||| ..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTGGCCAGAGATACTGCAAACCTCACCAAGGACAAGCAGAGGGGCTTT-GGGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA 2293
Query 2285 CTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCG 2358
|.||.||||||.||||||||||||||||.||..||.|||||.|...|.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2294 CCTATGGAGCCATCCTGAGTGGCAGCCCGCCCTCCTCCCAGTCAATACCCCCCAGCACCACCAGCGCACCCCCG 2367
Query 2359 CTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGC-G 2431
||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||.|||| ||.| |
Sbjct 2368 CTCCCACCTCGGAATGTTGGCAAAGATCCCCTGACCACCACACCACCCCCTCCTGTGGCTAAGA----CATCAG 2437
Query 2432 TAA---TGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAG-CCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCT 2501
.|| |.||||||.|||.||||||||||||| ||| |||..|||||||.||||||||.||.||||||.||.||
Sbjct 2438 GAACTCTAGAAGCCATGAACCAGCCGAGCAAGTCCT-CCCAACCTGGGACCTCACAGAGCAAGCCCCCGCCCCT 2510
Query 2502 GCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCA 2575
|||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||..|.|||.||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 2511 GCCACCTCAGCCACCCAGCCGCCTGCCTCAGAAGAAACCAGCTTCCGGGACTGACAAGCCAACCCCGCTGACCA 2584
Query 2576 ACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTC 2649
|||||||.||.|||||||||||| ||||||..|||||||||||||||.||.||||.|
Sbjct 2585 ACAAAGGACAGCCGAGAGGACCT------------------GAAGCTTCGGGTCCTCTGTCCAACGCCATGGCC 2640
Query 2650 CTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTA 2723
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2641 CTGCAGCCCCCAGCACCCATGCCTAGGAAGTCACAGGCGACCAAGTCAAAGCCCAAGCGAGTGAAAGCACTCTA 2714
Query 2724 TAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGG 2797
.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2715 CAACTGCGTGGCTGACAACCCAGACGAGCTGACTTTCTCTGAGGGCGACGTGATCATTGTGGATGGGGAAGAGG 2788
Query 2798 ACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCAC 2871
|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2789 ATCAGGAGTGGTGGATCGGCCACATCGATGGAGAGCCCAGCCGCAAAGGAGCGTTTCCCGTATCGTTTGTGCAC 2862
Query 2872 TTTATCGCTGAC 2883
|||||.||||||
Sbjct 2863 TTTATTGCTGAC 2874