Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465586
• Subject: XM_011510404.2
• Aligned Length: 3051
• Identities: 2880
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG  74

Query   75  CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGG------------------------  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct   75  CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGTGAGGCGGCCTGCGCGGCGGC  148

Query  125  ---------AGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC  189
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGGCCGCAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGC  222

Query  190  TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATG  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  223  TCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATG  296

Query  264  CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCA  370

Query  338  AAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGA  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGA  444

Query  412  GTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAA  518

Query  486  GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGA  592

Query  560  TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAA  666

Query  634  AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAA  740

Query  708  AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAACGCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATG  814

Query  782  AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAGGACTCC  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAGGACTCC  888

Query  856  CAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGG  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAATTCGTCAGAGCACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGG  962

Query  930  CAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTC  1036

Query 1004  TGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAAC  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGACCATATCCCATGGTACCGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAAC  1110

Query 1078  CCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGA  1151
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGACCTCATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGA  1184

Query 1152  ATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATGTCAAATATGGATGTCTGTGCTGCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACA  1258

Query 1226  ATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAAT  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATACTGGAGAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAAT  1332

Query 1300  GACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGA  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGA  1406

Query 1374  GTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAA  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAA  1480

Query 1448  CATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCT  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCT  1554

Query 1522  GAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGA  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGA  1628

Query 1596  GAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGA  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGA  1702

Query 1670  GAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGA  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGA  1776

Query 1744  CATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTT  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CATGAGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTT  1850

Query 1818  TTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGA  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGA  1924

Query 1892  CCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAG  1965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAG  1998

Query 1966  ACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAG  2039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAG  2072

Query 2040  ATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACA  2113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACA  2146

Query 2114  TGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAAC  2187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAAC  2220

Query 2188  CAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGAGGGCTTTCAT  2261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCTTTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAGGGCTTTCAT  2294

Query 2262  GCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCC  2335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCC  2368

Query 2336  CCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG--------------------------  2383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 2369  CCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCTCCTCTGCTAACACC  2442

Query 2384  --------------------------------------------------------------------------  2383
                                                                                      
Sbjct 2443  CTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGTGTGGACGGTGGAAGCCGGCAGCGATCTTCGTCAGATCCGCCAGCTGTCCA  2516

Query 2384  -----------------------------------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGA  2422
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCCACCGCTGCCCCCTCTTCGCGTGACATCTACCAATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGA  2590

Query 2423  CGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCA  2496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCAAGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCA  2664

Query 2497  CCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACT  2570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCTCTGCCCCCACAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACT  2738

Query 2571  GACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTA  2644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTA  2812

Query 2645  TGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCG  2718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCG  2886

Query 2719  CTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGA  2792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CTCTATAACTGTGTGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGA  2960

Query 2793  GGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTG  2866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GGAGGACCAGGAGTGGTGGATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTG  3034

Query 2867  TGCACTTTATCGCTGAC  2883
            |||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGCACTTTATCGCTGAC  3051