Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465661
• Subject: XM_005266062.5
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1425
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296

Query  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370

Query  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444

Query  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518

Query  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592

Query  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666

Query  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCCG  740

Query  741  GAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACCCCACCCCCA  814
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  741  GAGGGTGAAGGCCCAG----------------------------------------------------------  756

Query  815  TGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGCC  888
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  --------------------------------AGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGCC  798

Query  889  TTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCACC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  TTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCACC  872

Query  963  AAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  AAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCCT  946

Query 1037  CCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCTG  1020

Query 1111  AACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  AACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCT  1094

Query 1185  CCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  CCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGA  1168

Query 1259  GCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  GCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCC  1242

Query 1333  AATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  AATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGA  1316

Query 1407  GCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  GCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCC  1390

Query 1481  AGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  AGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1425