Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465661
• Subject: XM_006498201.1
• Aligned Length: 1604
• Identities: 1273
• Gaps: 187

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGC----------------------  704
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                      
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCCATCTCGGTATTCAGGGGCTAC  732

Query  705  -----------------------------------------------------GAACTTCCGCAAACACCTGCG  725
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GCGGAGAGGAAGCGTCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCG  806

Query  726  CATGGTCGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGA  799
            ||||||.|||||.|||.||||||||||||||                                           
Sbjct  807  CATGGTTGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAG-------------------------------------------  837

Query  800  GCGACCCCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGC  873
                                                           |||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  838  -----------------------------------------------AGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGC  864

Query  874  ACGCTGGACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGA  947
            ||.|||||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||
Sbjct  865  ACCCTGGATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGA  938

Query  948  AGGCTTCGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCC  1021
            .||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  939  GGGCTTCTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCC  1012

Query 1022  GCCGGGATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAG  1095
            ||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1013  GCAGAGATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAA  1086

Query 1096  ATAGAGAGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCC  1169
            |||||||.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1087  ATAGAGAAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGGCGGCCC  1160

Query 1170  TGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACT  1243
            |||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1161  TGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACT  1234

Query 1244  TCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTAC  1317
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235  TCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCATCCACATCATGGGCTGCTAC  1308

Query 1318  ATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTT  1391
            ||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||
Sbjct 1309  ATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTT  1382

Query 1392  CGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCC  1465
            .|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1383  TGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCC  1456

Query 1466  TGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1515
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1457  TGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1506