Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465661
• Subject: XM_006498203.3
• Aligned Length: 1529
• Identities: 1273
• Gaps: 112

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGC  726
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGC  732

Query  727  ATGGTCGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAG  800
            |||||.|||||.|||.||||||||||||||                                            
Sbjct  733  ATGGTTGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAG--------------------------------------------  762

Query  801  CGACCCCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCA  874
                                                          |||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  763  ----------------------------------------------AGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCA  790

Query  875  CGCTGGACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAA  948
            |.|||||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.
Sbjct  791  CCCTGGATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAG  864

Query  949  GGCTTCGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCG  1022
            ||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  865  GGCTTCTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCG  938

Query 1023  CCGGGATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGA  1096
            |.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  939  CAGAGATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAA  1012

Query 1097  TAGAGAGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCT  1170
            ||||||.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1013  TAGAGAAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGGCGGCCCT  1086

Query 1171  GGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTT  1244
            ||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1087  GGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACTT  1160

Query 1245  CTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACA  1318
            |||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  CTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCATCCACATCATGGGCTGCTACA  1234

Query 1319  TTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTC  1392
            |||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||.
Sbjct 1235  TTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTTT  1308

Query 1393  GAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCT  1466
            |||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1309  GAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCCT  1382

Query 1467  GTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1515
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1383  GTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1431