Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465661
• Subject: XM_017319140.1
• Aligned Length: 1778
• Identities: 1360
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGC----------------------  704
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                      
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCCATCTCGGTATTCAGGGGCTAC  732

Query  705  -----------------------------------------------------GAACTTCCGCAAACACCTGCG  725
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GCGGAGAGGAAGCGTCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCG  806

Query  726  CATGGTCGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGA  799
            ||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CATGGTTGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGA  880

Query  800  GCGACCCCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGC  873
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  881  GCGACCCCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGC  954

Query  874  ACGCTGGACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGA  947
            ||.|||||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||
Sbjct  955  ACCCTGGATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGA  1028

Query  948  AGGCTTCGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCC  1021
            .||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1029  GGGCTTCTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCC  1102

Query 1022  GCCGGGATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAG  1095
            ||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1103  GCAGAGATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAA  1176

Query 1096  ATAGAGAGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGC-----------  1158
            |||||||.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||           
Sbjct 1177  ATAGAGAAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGTAGAAGC  1250

Query 1159  --------------------------------------------------------------------------  1158
                                                                                      
Sbjct 1251  AGCCTTTCCTTTCCTCCCCAGGAAAAGAGGGCAGTGTGGTATGGGTAGGGCCCCAAGATCTTACTCAGTGTGGG  1324

Query 1159  --------------------------------------------------------------------------  1158
                                                                                      
Sbjct 1325  CGTGTCCATGTGGTACATTTGTGGACGACATGCACACGCCTCATCCTAGCCTCCCCCTAGCACTCCTGAGGCCT  1398

Query 1159  ---------------CAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGT  1217
                           |||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  GACCGTGACCTCTTTCAGGGCGGCCCTGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGT  1472

Query 1218  GGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGA  1291
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1473  GGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGA  1546

Query 1292  ACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACC  1365
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1547  ATGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACC  1620

Query 1366  CTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGAC  1439
            ||||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1621  CTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGAC  1694

Query 1440  GTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCC  1513
            .|||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1695  CTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCC  1768

Query 1514  TG  1515
            ||
Sbjct 1769  TG  1770