Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465661
• Subject: XM_017319143.1
• Aligned Length: 1703
• Identities: 1360
• Gaps: 196

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGC  726
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCGAACTTCCGCAAACACCTGCGC  732

Query  727  ATGGTCGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAG  800
            |||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  ATGGTTGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAG  806

Query  801  CGACCCCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCA  874
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  807  CGACCCCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCA  880

Query  875  CGCTGGACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAA  948
            |.|||||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.
Sbjct  881  CCCTGGATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAG  954

Query  949  GGCTTCGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCG  1022
            ||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  955  GGCTTCTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCG  1028

Query 1023  CCGGGATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGA  1096
            |.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1029  CAGAGATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAA  1102

Query 1097  TAGAGAGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGC------------  1158
            ||||||.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||            
Sbjct 1103  TAGAGAAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGTAGAAGCA  1176

Query 1159  --------------------------------------------------------------------------  1158
                                                                                      
Sbjct 1177  GCCTTTCCTTTCCTCCCCAGGAAAAGAGGGCAGTGTGGTATGGGTAGGGCCCCAAGATCTTACTCAGTGTGGGC  1250

Query 1159  --------------------------------------------------------------------------  1158
                                                                                      
Sbjct 1251  GTGTCCATGTGGTACATTTGTGGACGACATGCACACGCCTCATCCTAGCCTCCCCCTAGCACTCCTGAGGCCTG  1324

Query 1159  --------------CAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTG  1218
                          |||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  ACCGTGACCTCTTTCAGGGCGGCCCTGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTG  1398

Query 1219  GAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAA  1292
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1399  GAGAAGGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAA  1472

Query 1293  CGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCC  1366
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCC  1546

Query 1367  TCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACG  1440
            |||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1547  TCATGACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACC  1620

Query 1441  TACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCT  1514
            |||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1621  TACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCT  1694

Query 1515  G  1515
            |
Sbjct 1695  G  1695