Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000465689
Subject:
NM_023138.5
Aligned Length:
1206
Identities:
1046
Gaps:
8

Alignment

Query    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCATCCCCTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGTTACCGGCACTCACTATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCCAC  74

Query   75  CAGCGAGGGCGCCTCCGAGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGACGAGCAGC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CAGCGAGGGCGCCTCTGAGGCAAACCTGGTGGACCTCCAGAAGAAGCTGGAAGAGCTGGACCTGGATGAGCAGC  148

Query  149  AGAAGAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGTCGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGG  222
            |.|.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAAGGAAGCGGCTGGAGGCCTTCCTTACCCAGAAGGCTAAGGTCGGTGAGCTCAAGGACGACGACTTTGAGAGG  222

Query  223  ATCTCAGAGCTGGGCGCGGGCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATCATGGC  296
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|.||.|||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTCAGAGCTGGGTGCCGGCAATGGCGGAGTGGTCACCAAGGCCCGGCATAGGCCGTCAGGCCTCATCATGGC  296

Query  297  CAGGAAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCATCCGGAACCAGATCATCCGCGAGCTGCAGGTCCTGCACG  370
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CAGAAAGCTGATCCACCTGGAGATCAAACCGGCCGTGCGCAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTGCTGCACG  370

Query  371  AATGCAACTCGCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGTGACGGGGAGATCAGCATTTGCATGGAA  444
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  AGTGCAACTCGCCCTACATCGTGGGCTTCTATGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAG  444

Query  445  CACATGGATGGCGGCTCCCTGGACCAGGTGCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGAGATCCTGGGGAAAGT  518
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||.|||||||.||
Sbjct  445  CACATGGATGGTGGCTCACTGGACCAGGTACTGAAGGAGGCCAAGCGGATTCCTGAAGACATCTTGGGGAAGGT  518

Query  519  CAGCATCGCGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACCGAGATGTGAAGCCCT  592
            ||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCATTGCGGTGCTCCGGGGCCTGGCCTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACAGAGATGTGAAGCCCT  592

Query  593  CCAACATCCTCGTGAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTCATAGACTCC  666
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  CCAACATCCTGGTGAACTCTCGCGGGGAGATTAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTGATCGACTCC  666

Query  667  ATGGCCAACTCCTTCGTGGGCACGCGCTCCTACATGGCTCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCA  740
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  ATGGCCAACTCGTTTGTAGGGACGCGCTCCTACATGTCCCCAGAGCGGCTGCAGGGCACCCACTACTCTGTGCA  740

Query  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGCCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCCGGA--GGAAGGTACCCCATCCCCCCGCCCG  812
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||   |  ||.|||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGGCTGTCGCTGGTGGAGCTGGCC---ATCGGGAGGTATCCCATTCCCCCACCTG  811

Query  813  ACGCCAAAGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCGGCCCGTGGTCGACGGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCG  886
            |.|||||.||.||.|||||||.||||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.||.||.||..||||.
Sbjct  812  ATGCCAAGGAACTAGAGGCCAGCTTTGGCCGGCCTGTGGTGGACGGGGCAGACGGAGAACCCCATAGTGTCTCC  885

Query  887  CCTCGGCCGAGGCCCCCCGGGCGCCCCGTCAG---CGGTCACGGGATGGATAGCCGGCCTGCCATGGCCATCTT  957
            ||..||||.||||||||.||.||||||.||||   .|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  886  CCGAGGCCCAGGCCCCCTGGACGCCCCATCAGTGTAGGTCATGGGATGGACAGCCGACCGGCCATGGCCATCTT  959

Query  958  TGAACTCCTGGACTATATTGTGAACGAGCCACCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCAGG  1031
            |||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||
Sbjct  960  TGAGCTGCTGGACTACATAGTGAACGAGCCACCTCCCAAGCTGCCCAGTGGTGTGTTCAGCTCAGACTTCCAGG  1033

Query 1032  AGTTTGTCAATAAATGCCTCATCAAGAACCCAGCGGAGCGGGCGGACCTGAAGATGCTCACAAACCACACCTTC  1105
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||.||||.|..||||||.|||||
Sbjct 1034  AGTTTGTGAATAAATGTCTCATTAAGAACCCAGCAGAGCGAGCAGATCTGAAGCTGCTGATGAACCACGCCTTC  1107

Query 1106  ATCAAGCGGTCCGAGGTGGAAGAAGTGGATTTTGCCGGCTGGTTGTGTAAAACCCTGCGGCTGAACCAGCCCGG  1179
            ||||||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||||||||.||||.|.|||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 1108  ATCAAGCGCTCTGAGGGGGAGGAAGTGGACTTCGCCGGCTGGCTGTGCAGAACCCTGCGGCTGAAGCAGCCCAG  1181

Query 1180  CACACCCACGCGCACCGCCGTG  1201
            ||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1182  CACACCCACGCGGACTGCAGTG  1203