Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465719
• Subject: NM_001159568.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1345
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74

Query   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC  148

Query  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA  222

Query  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296
            .|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296

Query  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370

Query  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA  444

Query  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA  518

Query  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT  592

Query  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT  666

Query  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA  740

Query  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct  741  CAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACA  814

Query  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTC  888

Query  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCT  962

Query  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---  1033
            .|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  963  GCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  1036

Query 1034  ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1089
                              |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1110

Query 1090  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGG  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGG  1184

Query 1164  TGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAA  1237
            ||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  TGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAA  1258

Query 1238  GACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCC  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCC  1332

Query 1312  CCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGG  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGG  1406

Query 1386  ACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1431