Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465719
• Subject: NM_001159570.2
• Aligned Length: 1423
• Identities: 1097
• Gaps: 257

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAG-----GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  69
                    |.|     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  66

Query   70  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  140

Query  144  ACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCT  217
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  141  GCAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCT  214

Query  218  TGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAG  291
            ||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  215  TGAAAAGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAG  288

Query  292  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGA  365
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  289  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGA  362

Query  366  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGA  439
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  363  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGA  436

Query  440  TGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTC  513
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  437  TGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTC  510

Query  514  TGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTC  587
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  511  TGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTC  584

Query  588  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACC  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  585  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACC  658

Query  662  ACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGA  735
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  659  ACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGA  732

Query  736  GACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCC  809
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  733  GACAACAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCC  806

Query  810  GGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGC  883
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  807  AGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGC  880

Query  884  TCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACA  957
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  881  TCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACA  954

Query  958  ATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG  1031
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  ATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCG  1028

Query 1032  AGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAAC  1105
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  AGCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAAC  1102

Query 1106  ACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAAT  1178
            |||||||||||||||||||||       || .||||  ||.|||                      |||||.||
Sbjct 1103  ACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--AGTGGA----------------------ATGGGCAT  1145

Query 1179  GAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGA  1245
            ||.||||| .||       ||  |||..||||       |.|||                              
Sbjct 1146  GAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT-------ATATG------------------------------  1179

Query 1246  CCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCA  1319
                                                                                      
Sbjct 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179

Query 1320  CCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTA  1393
                                                                                      
Sbjct 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179

Query 1394  TGGACATTCATGCCCAA  1410
                             
Sbjct 1180  -----------------  1179