Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465719
• Subject: XM_006498865.3
• Aligned Length: 1625
• Identities: 1336
• Gaps: 223

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAG-----GTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  69
                    |.|     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGTTTCTGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATG  66

Query   70  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  TACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCAC  140

Query  144  ACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCT  217
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  141  GCAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCT  214

Query  218  TGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAG  291
            ||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  215  TGAAAAGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAG  288

Query  292  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGA  365
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  289  CTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGA  362

Query  366  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGA  439
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  363  CATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGA  436

Query  440  TGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTC  513
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  437  TGATACAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTC  510

Query  514  TGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTC  587
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  511  TGCCACCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTC  584

Query  588  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACC  661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  585  CAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACC  658

Query  662  ACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGA  735
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  659  ACGATGACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGA  732

Query  736  GACAACAGCAGTGAGCA---------------------------------------------------------  752
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  733  GACAACAGCAGTGAGCAAGGCGCTTCGGAGACTGAGGCTGACCATTTACTATTGTGGAAGCCCATGACTGATCG  806

Query  753  --------------------------------------------------------------------------  752
                                                                                      
Sbjct  807  CACAGGATGCGTTTCAGTGCAAATGTCAAGAGAAGATAGAGAAGAAAGCAGAGAGGGAAAACACTCTCCACAAC  880

Query  753  ----------------------------------------------------------AGGGGATGGTTTAGAC  768
                                                                      |||.|||||.||||||
Sbjct  881  CACTTGAAAACATCATCATTCCCTGTCAGCCGCCCTTTCGTGGGGAAAGCGAAGCTGGAGGCGATGGGTTAGAC  954

Query  769  AACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGG  842
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  AACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGG  1028

Query  843  CATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCG  916
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1029  CATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAG  1102

Query  917  AAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCC  990
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1103  AAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCC  1176

Query  991  AGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCA  1043
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||
Sbjct 1177  AGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCA  1250

Query 1044  AGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCC  1117
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  AGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCC  1324

Query 1118  GGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAG  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1325  GGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCAATGGGAATGGGTATGGCCCAG  1398

Query 1192  CCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTT  1265
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  CCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTT  1472

Query 1266  GCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAG  1339
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  GCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAG  1546

Query 1340  CACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  CACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1617