Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465719
• Subject: XM_006498871.3
• Aligned Length: 1480
• Identities: 1100
• Gaps: 311

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGCGCAAAGG----  12
                                                                      ||     |||.|    
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAAT-----AAACGAGAA  69

Query   13  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  TACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGC  143

Query   87  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGC  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  GCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGC  217

Query  161  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGAC  234
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct  218  ACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGAC  291

Query  235  GCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  308
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  GCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCC  365

Query  309  CCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  382
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCA  439

Query  383  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAA  456
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  440  AGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAA  513

Query  457  GTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAG  530
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  GTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAG  587

Query  531  CTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  604
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAG  661

Query  605  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCA  678
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  662  AACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCA  735

Query  679  ACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCA  752
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  736  ACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCA  809

Query  753  AGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAAC  826
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  810  AGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAAC  883

Query  827  GCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACA  900
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACA  957

Query  901  CATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAA  974
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  958  CACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAA  1031

Query  975  CTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAG  1048
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  CTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGTGAGCCAAGGAG  1105

Query 1049  CAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCT  1122
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  CAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCT  1179

Query 1123  GCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA-----  1190
            ||||       || .||||  ||.|||                      |||||.||||.||||| .||     
Sbjct 1180  GCAG-------GACCCATG--AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGAT  1221

Query 1191  --GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATA  1262
              ||  |||..||||       |.|||                                               
Sbjct 1222  GGGC--AGTGGCACT-------ATATG-----------------------------------------------  1239

Query 1263  TTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGT  1336
                                                                                      
Sbjct 1240  --------------------------------------------------------------------------  1239

Query 1337  CAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
                                                                                      
Sbjct 1240  --------------------------------------------------------------------------  1239