Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465719
• Subject: XM_006720526.3
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1144
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296
                                                      .|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  32

Query  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  106

Query  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  180

Query  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  254

Query  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  328

Query  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  402

Query  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  476

Query  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  550

Query  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  624

Query  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  698

Query  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---  1033
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  699  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  772

Query 1034  ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  1089
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG  846

Query 1090  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGG  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGG  920

Query 1164  TGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAA  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  TGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACAGCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAA  994

Query 1238  GACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCC  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  GACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCC  1068

Query 1312  CCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGG  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  CCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGG  1142

Query 1386  ACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1410
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143  ACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1167