Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465803
• Subject: XM_006503346.3
• Aligned Length: 1466
• Identities: 1083
• Gaps: 262

Alignment

Query    1  ATGCCGAAGGTGAAGGCGCTGCAGTGCGCCCTGGCGCTGGAGATCAGCTCAGTAACTTGCCCAGGAGTCGTGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAAGACATAGAGGACATCTATCTTAGCATCTGTGTGTTTGGCCAATACAAAAAGACACAATGTGTCCCAGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTTTTCCCCTGGTCTTCAATGCCAGAATGGTGTTTGAAAAGGTGTTCCCGGACGCAGTAGATCCTGGAGATGTG  222
                                                     .||..|||.|.|||.|.||||||          
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGCGCCCTGGCGCTGGAGATCC----------  23

Query  223  GTTACACAGCTTGAATATGATACAGCAGTGTTCGAGTTGATACAGCTAGTTCCACCAGTGGGTGAAACACTGTC  296
                    |||   .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   24  --------GCT---CTATGATACAGCAGTGTTTGAGTTGATACAGCTAGTTCCACCAGTGGGAGAAACACTGTC  86

Query  297  TACGTATGACGAAAATACACGAGATTTCATGTTTCCGGGTCCAAACCAAATGTCTGGACACCATGATTCAAACC  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  TACCTATGATGAAAATACACGAGATTTCATGTTCCCGGGTCCAAACCAAATGTCTGGACACCATGATTCAAACC  160

Query  371  GCCAGGTTACCATGAGGAGGATTTCTGGCCTTCGAGGAAATGCTCCAAGGCTGGAATTTTCTACGACTTCAGTG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  161  GCCAGGTTACCATGAGGAGGATTTCTGGCCTAAGAGGAATTGCTCCAAAGCTGGAATTTTCTACAACTTCAGTG  234

Query  445  ATTACTGAATGTCTGATAAGTTCAAGGAAATGCCACACTCAGGATAAATTTATTTACCATTTGGCTCCAGTTGA  518
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||
Sbjct  235  ATCACTGAATGTCTGATAAGCTCAAGGAAGTGCCGCACTCAGGATAAATTTACTTACCATTCAGCTCCAGTTGA  308

Query  519  AAAATCACATGGCAGACTGCAAAACAGAACATCAAGATCACAAAAGAAAAAATCCAAGTCACCTGAGAGAAGTA  592
            ||||||.||.||||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  309  AAAATCCCACGGCAGACTGCAATGCAGAACATCAAGATCACAGAAGAAAAAGTCCAAGTCACCCGAGAGGAGTA  382

Query  593  AATACTGTATAAATGCAAAAAACTACGAACAGCCTACAATTTCTTCAAAATCACACTCTCCATCTCCCTACACA  666
            ||||.||.|||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  AATATTGCATAAACACCAAGAACTACGAACAGCCTACGATTTCCTCAAAGTCACACTCTCCATCTCCCTACACA  456

Query  667  AAAAGACGCATGTGTGAGCTATCTGAAGACACCAGGCGGCGGCTGGCCCATTTAAATCTGGGACCCTATGAGTT  740
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  457  AAAAGACGGATGTGTGAGCTTTCCGAAGACACTCGGCGGCGGCTGGCCCATTTAAATCTGGGACCCTATGAATT  530

Query  741  CAAAAAAGAAACAGATAAACCTCCATTTGTGATTAGACATGTTGATCCCCCAAGTCCCAGGGCTGATACTTTAT  814
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.|.|||.|
Sbjct  531  CAAAAAGGAAACAGATAAGCCTCCATTTGTGATTAGACATGTTGATCCCCCGAGTCCCAGAACTGACAATTTTT  604

Query  815  TGGGATCTTCTGGAAGAGACTGTGAAAGAGATGGAT-GGTCAAGGGTGCACAATGATCATTCTCATCTTGGCTG  887
            |.|||||..||||.||||||||||||.||||||||| |||| |||.||||||..||||||.|||||.|||||||
Sbjct  605  TTGGATCACCTGGCAGAGACTGTGAACGAGATGGATGGGTC-AGGATGCACAGCGATCATCCTCATATTGGCTG  677

Query  888  CTGCCGACCCAAGGATTATAAGGTTATCAGGACACCCCATGGGAGAGACTTCGATGA-CTCTTTAGAAAAATGT  960
            ||||.||.|||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|| |.|||| ||||..|||
Sbjct  678  CTGCAGATCCAAGGACTACAAGGTTATCAGGTCACCACATGGGAGAGACTTTGAGGATCCCTTT-GAAAGGTGT  750

Query  961  GAAGAGTATTTGAGCCCAAGGTCGTGTAGTAAGCCCCGGCATTCAGCGAGGACCTTGCTAGTCCATTCAGCACC  1034
            ||.||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||.||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  751  GAGGAATATTTGAGCCCAAGGACATGTAGCAAGCCCCAGCATTCTGCAAGGACCTTACTAGTCCATTCAGCACC  824

Query 1035  CTCAACAATGCCAAAGCATTCTCCAAGCCCTGTGTTAAATAGAGCTTCTCTCAGGGAAAGATTTCATTCTGATT  1108
            .|||||||..||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  825  TTCAACAACACCAAAGCATTGTGCAAGCCCTGTGCTAAATAGAGCCTCTCTCAGGGAAAGATTCCACTCTGATT  898

Query 1109  GGTGTTCACCTTCAAACTGCGATGAGATCCATGACCGG------------------------------------  1146
            |||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||                                    
Sbjct  899  GGTGTTCACCTCCGAACTGTGATGAGATCCATGACCGGGTAAAAGATGTCTTGAAATCACATCAAGCTCATGCA  972

Query 1147  ------------GATGAGAGAGACCTAGAGAAAGATGATGAACTGGAACTGAAAAGAAGTCTTTTATGTAGAGA  1208
                        |||||||||||||.|||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  973  AGACATTTATGTGATGAGAGAGACCCAGAGAGAGAAGACGAACTGGAACTGAAAAGAAGTCTTTTATATAGAGA  1046

Query 1209  CTCTGCCTATGACAGTGACCCCGAGTATAGCTCATGTCAGCAGCCACGTGGCACTTTCCATTTGGATGACGGTG  1282
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||.|||.||||||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1047  CTCTGCTTATGACAGTGACCCTGAGTATAGCTCCTTTCAGCGGCCGCGTGGCTCTTTCCATTTGGATGATGGCG  1120

Query 1283  AATACTGGTCCAACAGGGCAGCCTCTTATAAGGGAAAATCCCACCGACCCATCTTTGAGAACAGCATGGACAAG  1356
            |||.||||||||||||.||||||||||.|||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  AATGCTGGTCCAACAGAGCAGCCTCTTGTAAAGGGAAATCCCACCGACCCGTCTTTGAGAACAGCATGGACAAG  1194

Query 1357  ATGTACAGGAACTTATACAAAAAGGCCTGTAGTTCTGCTTCACATACACAGGAAAGCTTC  1416
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1195  ATGTACAGGAACTTATACAAAAAAGCCTGTAGTTCTGTTTCTCATACACAGGAAAGCTTC  1254