Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465829
• Subject: XM_011515017.3
• Aligned Length: 1811
• Identities: 1695
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  ATGGCATCTACTTGGGCTATCCAGGCCCACATGGACCAGGATGAACCTTTGGAAGTAAAGATAGAGGAAGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATCTACTTGGGCTATCCAGGCCCACATGGACCAGGATGAACCTTTGGAAGTAAAGATAGAGGAAGAGAA  74

Query   75  ATATACCACCAGACAGGATTGGGACCTGCGTAAAAACAACACCCATAGCAGAGAGGTCTTCCGTCAGTACTTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATATACCACCAGACAGGATTGGGACCTGCGTAAAAACAACACCCATAGCAGAGAGGTCTTCCGTCAGTACTTCA  148

Query  149  GACAGTTCTGCTACCAGGAGACATCTGGTCCCCGTGAGGCTTTGAGCCGACTCCGAGAACTTTGCCATCAGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GACAGTTCTGCTACCAGGAGACATCTGGTCCCCGTGAGGCTTTGAGCCGACTCCGAGAACTTTGCCATCAGTGG  222

Query  223  CTGAGGCCAGAGACCCACACCAAAGAACAGATTCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACCATCCTACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGAGGCCAGAGACCCACACCAAAGAACAGATTCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACCATCCTACC  296

Query  297  TGAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGCAGGAGCAGCATCCAGAGAGTGGGGAGGAGGTGGTGACTGTGCTGGAGGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGGAGCTCCAGGCCTGGGTGCAGGAGCAGCATCCAGAGAGTGGGGAGGAGGTGGTGACTGTGCTGGAGGATT  370

Query  371  TAGAGAGAGAACTGGATGAACCAGGAGAGCAGGTCTCAGTCCACACTGGGGAACAGGAAATGTTCTTGCAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAGAGAGAACTGGATGAACCAGGAGAGCAGGTCTCAGTCCACACTGGGGAACAGGAAATGTTCTTGCAGGAG  444

Query  445  ACGGTACGTCTACGAAAAGAAGGAGAACCCAGTATGTCCCTCCAGTCCATGAAAGCCCAGCCAAAGTATGAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGGTACGTCTACGAAAAGAAGGAGAACCCAGTATGTCCCTCCAGTCCATGAAAGCCCAGCCAAAGTATGAATC  518

Query  519  TCCAGAACTTGAATCCCAACAGGAGCAAGTTTTAGATGTTGAGACTGGAAATGAGTATGGGAATTTAAAGCAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGAACTTGAATCCCAACAGGAGCAAGTTTTAGATGTTGAGACTGGAAATGAGTATGGGAATTTAAAGCAAG  592

Query  593  AAGTTTCTGAAGAAATGGAACCACATGGGAAGACATCCAGTAAATTTGAAAATGATATGTCCAAGTCTGCTAGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTTTCTGAAGAAATGGAACCACATGGGAAGACATCCAGTAAATTTGAAAATGATATGTCCAAGTCTGCTAGG  666

Query  667  TGTGGAGAAACTCGTGAACCTGAAGAAATAACAGAAGAGCCCTCTGCTTGCTCCAGAGAAGATAAACAACCTAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGGAGAAACTCGTGAACCTGAAGAAATAACAGAAGAGCCCTCTGCTTGCTCCAGAGAAGATAAACAACCTAC  740

Query  741  CTGTGATGAAAATGGAGTAAGCCTGACTGAGAACTCTGACCATACTGAACATCAGAGAATCTGTCCAGGAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGATGAAAATGGAGTAAGCCTGACTGAGAACTCTGACCATACTGAACATCAGAGAATCTGTCCAGGAGAAG  814

Query  815  AATCTTACGGATGTGATGACTGTGGAAAAGCTTTTAGTCAGCACTCACACCTCATAGAACATCAGAGGATCCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATCTTACGGATGTGATGACTGTGGAAAAGCTTTTAGTCAGCACTCACACCTCATAGAACATCAGAGGATCCAT  888

Query  889  ACTGGAGATAGACCCTACAAATGCGAAGAATGTGGAAAAGCTTTCCGTGGGAGAACTGTGCTTATTCGACACAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGGAGATAGACCCTACAAATGCGAAGAATGTGGAAAAGCTTTCCGTGGGAGAACTGTGCTTATTCGACACAA  962

Query  963  AATAATACACACTGGAGAGAAACCGTATAAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTTGGCCGGTGGTCAGCTCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATAATACACACTGGAGAGAAACCGTATAAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTTGGCCGGTGGTCAGCTCTTA  1036

Query 1037  ACCAACATCAGAGACTTCACACAGGAGAAAAACACTATCACTGTAATGACTGTGGCAAAGCCTTTAGTCAGAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCAACATCAGAGACTTCACACAGGAGAAAAACACTATCACTGTAATGACTGTGGCAAAGCCTTTAGTCAGAAA  1110

Query 1111  GCAGGCCTCTTTCACCATATCAAGATCCACACAAGAGACAAACCTTATCAGTGCACTCAGTGTAATAAAAGTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGGCCTCTTTCACCATATCAAGATCCACACAAGAGACAAACCTTATCAGTGCACTCAGTGTAATAAAAGTTT  1184

Query 1185  TAGTCGGCGTTCCATACTTACTCAGCATCAAGGAGTTCATACCGGCGCCAAGCCGTATGAGTGCAACGAGTGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGTCGGCGTTCCATACTTACTCAGCATCAAGGAGTTCATACCGGCGCCAAGCCGTATGAGTGCAACGAGTGTG  1258

Query 1259  GAAAAGCCTTTGTTTATAACTCATCCCTTGTTTCCCATCAGGAAATCCACCACAAAGAAAAATGCTATCAGTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAAAAGCCTTTGTTTATAACTCATCCCTTGTTTCCCATCAGGAAATCCACCACAAAGAAAAATGCTATCAGTGT  1332

Query 1333  AAGGAATGTGGGAAATCCTTCAGTCAGAGTGGCCTTATTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGGGAAAAACCCTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAATGTGGGAAATCCTTCAGTCAGAGTGGCCTTATTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGGGAAAAACCCTA  1406

Query 1407  CAAATGTGACGTATGTGAAAAAGCCTTTATTCAAAGGACAAGTCTTACAGAACATCAGCGAATTCACACTGGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAATGTGACGTATGTGAAAAAGCCTTTATTCAAAGGACAAGTCTTACAGAACATCAGCGAATTCACACTGGAG  1480

Query 1481  AAAGACCCTATAAATGTGATAAGTGTGGGAAGGCGTTTACTCAAAGATCAGTCCTCACGGAACATCAGAGAATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAGACCCTATAAATGTGATAAGTGTGGGAAGGCGTTTACTCAAAGATCAGTCCTCACGGAACATCAGAGAATC  1554

Query 1555  CACACTGGAGAGAGGCCCTACAAGTGTGATGAGTGTGGGAATGCCTTCCGAGGAATCACCAGCCTCATTCAGCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACACTGGAGAGAGGCCCTACAAGTGTGATGAGTGTGGGAATGCCTTCCGAGGAATCACCAGCCTCATTCAGCA  1628

Query 1629  TCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAGCCCTACCAATGTGATGAGTGTGGAAAAGCCTTCAGACAGAGGAAGAAGA  1702
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 1629  TCAGAGAATCCACACTGGGGAGAAGCCCTACCAATGTGATGAGTGTGGAAAAGCCTTCAGACAGAGG-------  1695

Query 1703  CCAGCTACAAGGAAATACTTCTGAAAAATCACTCTGAACCCCAAGCTGGAGTGAATCTTCTCCTGAGCTCTCTC  1776
                                                                                      
Sbjct 1696  --------------------------------------------------------------------------  1695

Query 1777  ATTCCAGAATGGCAATCTTGTTCAGGAGAGATCTC  1811
                                               
Sbjct 1696  -----------------------------------  1695