Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465885
• Subject: XM_006538195.3
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1066
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGCACTTCAACCTCTCCAGCTGCCATGCTCCTCCGGAGGCTGCGGCGACTGTCCTGGGGCAGCACTGCTGT  74
            ||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGACCACGTCAACCTCTCCAGCTGCCATGCTTCTCCGGAGGCTTCGGCGACTCTCCTGGGGCAGCACAGCTGT  74

Query   75  CCAGCTCTTCATCCTAACAGTGGTGACGTTTGGCCTGCTGGCCCCCCTGGCCTGTCACCGACTTCTACACTCTT  148
            .|||||||||||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct   75  GCAGCTCTTCATTCTAACCGTGGTGACATTTGGCTTACTGGCCCCGCTGGCCTGCCACCGGCTCCTCCACTCAT  148

Query  149  ACTTCTATCTGCGCCATTGGCATCTGAACCAAATGAGCCAAGAGTTCCTGCAGCAAAGCTTGAAAGAGGGTGAG  222
            |.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ATTTCTATCTGCGTCATTGGCATCTAAACCAGATGAGCCAGGACTTCCTGCAGCAGAGCCTGAAGGAGGGGGAA  222

Query  223  GCTGCCCTCCACTATTTTGAGGAGCTTCCCTCTGCCAATGGCTCAGTGCCCATTGTCTGGCAGGCCACCCCCCG  296
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GCTGCCCTTCACTACTTTGAAGAGCTGCCCTCTGCCAATGGGTCTGTGCCCATCGTCTGGCAGGCCACTCCCCG  296

Query  297  GCCCTGGCTGGTGATCACCATCATCACTGTGGACAGGCAGCCTGGCTTCCACTACGTCCTGCAGGTTGTGTCCC  370
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||.|.|||||.||.||||
Sbjct  297  CCCCTGGCTGGTGATTACCATAATCACTGTGGATAGGCAGCCTGGCTTTCATTATGTCTTACAGGTAGTATCCC  370

Query  371  AGTTCCACCGGCTTCTTCAGCAATGTGGCCCCCAGTGCGAGGGGCACCAACTCTTCCTGTGCAACGTGGAGCGT  444
            |||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  371  AGTTCCATCGGCTTCTGCAGCAGTGCGGCCCCCAGTGTGAAGGGCACCAGCTCTTCCTGTGCAATGTGGAACGG  444

Query  445  AGTGTGAGCCATTTTGATGCCAAGTTGCTCTCCAAGTATGTCCCTGTGGCCAATCGCTATGAGGGCACTGAGGA  518
            ||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  AGTGTGAGCCATTTTGATGCTAAGCTGCTCTCTAAGTACGTCCCTGTGGCCAACCGCTACGAGGGCACCGAAGA  518

Query  519  TGATTATGGTGATGACCCTTCGACCAACTCGTTTGAGAAAGAGAAGCAGGACTATGTCTATTGCCTGGAGTCAT  592
            .|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CGATTACGGTGATGACCCTTCCACTAACTCATTTGAGAAAGAGAAGCAAGACTATGTGTATTGCCTGGAGTCAT  592

Query  593  CCCTGCAGACCTACAACCCAGACTACGTCCTGATGGTAGAAGACGATGCTGTACCAGAAGAGCAGATCTTCCCA  666
            |.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||.|.||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  CGCTGCAAACCTACAATCCAGACTATGTCCTGATGGTGGAGGATGATGCTATTCCAGAAGAACAGATCTTCCCA  666

Query  667  GTCTTGGAGCACCTTCTGCGGGCTCGCTTCTCTGAGCCACATCTCAGAGATGCCCTTTATCTCAAGCTGTATCA  740
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  GTATTGGAGCACCTCCTGCGTGCTCGCTTCTCTGAGCCACACCTCCAAGATGCCCTGTATCTAAAGCTCTATCA  740

Query  741  CCCCGAGAGGCTCCAGCACTACATCAATCCAGAGCCCATGCGGATCCTGGAATGGGTTGGTGTAGGCATGTTGC  814
            |||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||
Sbjct  741  CCCAGAGAGGCTACAGCACTACATCAACCCAGAGCCTATGCGGATCCTGGAGTGGGTTGGTGTGGGCATGCTGC  814

Query  815  TGGGGCCCTTACTAACCTGGATATACATGAGGTTTGCCAGCCGCCCAGGGTTTAGCTGGCCTGTAATGCTCTTC  888
            |||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  815  TGGGGCCTGTGCTAACCTGGATCTACATGAGGTTTGCCTGCCGCCCAGGCTTCAGCTGGCCTGTCATGCTTTTC  888

Query  889  TTCTCCCTGTATAGCATGGGTCTGGTGGAGCTGGTGGGTCGGCACTATTTCCTGGAACTGCGGCGGCTGAGTCC  962
            ||||..||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  TTCTGTCTCTACAGCATGGGGCTGGTGGAACTGGTGGGCCGACACTATTTTCTGGAACTGCGGCGCCTGAGTCC  962

Query  963  TTCCCTGTACAGTGTGGTTCCTGCCTCTCAGTGTTGCACCCCAGCCATGCTCTTCCCGGCACCTGCGGCCCGCC  1036
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||.
Sbjct  963  CTCCTTGTACAGTGTGGTTCCTGCCTCTCAGTGTTGTACCCCGGCTATGCTCTTCCCTGCCCCTGCTGCCCGCA  1036

Query 1037  GGACCCTCACCTACCTGTCCCAAGTGTACTGCCACAAGGGCTTTGGCAAGGACATGGCACTGTACTCGCTGTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1037  GGACCCTCACCTACCTGTCCCAGGTGTACTGCCACAAGGGCTTTGGCAAAGACATGGCACTGTACTCTCTGCTG  1110

Query 1111  AGGGCCAAGGGAGAGAGGGCCTATGTAGTGGAGCCGAACCTCGTGAAACACATCGGGCTCTTCTCCAGTCTCCG  1184
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  AGAGCCAAGGGGGAGAGGGCCTATGTGGTGGAGCCCAACCTTGTGAAACACATTGGGCTCTTCTCCAGCCTACG  1184

Query 1185  GTACAACTTTCATCCCAGTCTCCTC  1209
            ||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1185  GTACAATTTTCATCCCAGCCTACTG  1209