Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465905
- Subject:
- NM_001305981.2
- Aligned Length:
- 3818
- Identities:
- 3194
- Gaps:
- 191
Alignment
Query 1 ATGGAGCCGCCCGGCGGGAGACAGGGGCCCGGCCGCGGGACCCGGGACAAGAAGAAGGGCCGGAGCCCAGATGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTGCCCTCGGCGGGCGGCGACGGCGGCAAATCTAAGAAATTTCTGGAGAGATTTACCAGCATGAGAATTAAGA 148
|.|||.| |.|| .|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1 --------------------ATGGCAG-------ACGA----GCTGGAGAGATTTACCAGCATGAGGATTAAGA 43
Query 149 AGGAGAAGGAAAAGCCCAATTCTGCTCATAGAAATTCTTCTGCATCATATGGGGATGATCCCACAGCACAGTCA 222
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 44 AGGAGAAAGAAAAGCCCAATTCTGCTCATAGAAACTCCTCTGCATCGTACGGAGATGACCCCACTGCTCAGTCA 117
Query 223 TTGCAAGATGTTTCAGATGAACAAGTGCTGGTTCTCTTTGAACAGATGCTGCTGGATATGAACCTGAATGAGGA 296
|||||.||..|.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TTGCAGGACATCTCAGACGAGCAAGTTCTTGTCCTCTTTGAGCAGATGCTGGTGGATATGAACCTGAATGAGGA 191
Query 297 GAAACAGCAACCTTTGAGGGAGAAGGACATCATCATCAAGAGGGAGATGGTGTCCCAATACTTGTACACCTCCA 370
|||.|||||.||||||.|.|||||||||||..||||||||||||||||||||||.|||||..||.||||.||||
Sbjct 192 GAAGCAGCAGCCTTTGCGAGAGAAGGACATTGTCATCAAGAGGGAGATGGTGTCGCAATATCTGCACACTTCCA 265
Query 371 AGGCTGGCATGAGCCAGAAGGAGAGCTCTAAGTCTGCCATGATGTATATTCAGGAGTTGAGGTCAGGCTTGCGG 444
||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 266 AGGCTGGCATGAACCAGAAAGAGAGCTCTAGGTCTGCCATGATGTACATCCAGGAGCTGAGGTCGGGCTTGCGG 339
Query 445 GATATGCCTCTGCTCAGCTGCCTGGAGTCCCTTCGTGTGTCTCTCAACAACAACCCTGTCAGTTGGGTGCAAAC 518
|||||||..|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 340 GATATGCACCTGCTTAGCTGCCTTGAGTCCCTTCGAGTCTCTCTCAACAATAACCCTGTCAGTTGGGTGCAGAC 413
Query 519 ATTTGGTGCTGAAGGCTTGGCCTCCTTATTGGACATTCTTAAACGACTTCATGATGAGAAAGAAGAGACTGCTG 592
||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 414 ATTTGGTGCTGAGGGCCTAGCCTCCTTATTGGACATCCTCAAACGACTCCATGATGAGAAAGAGGAGACTTCTG 487
Query 593 GGAGTTACGATAGCCGGAACAAGCATGAGATCATTCGCTGCTTGAAAGCTTTTATGAACAACAAGTTTGGAATC 666
|.|..|||||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 488 GAAACTACGACAGCCGAAACCAGCATGAGATTATCCGCTGTTTGAAGGCTTTCATGAACAACAAGTTTGGAATC 561
Query 667 AAGACCATGTTGGAGACAGAAGAAGGAATCCTACTGCTGGTCAGAGCCATGGATCCTGCTGTTCCCAACATGAT 740
||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 562 AAAACTATGTTGGAGACGGAAGAAGGAATCCTACTGCTGGTCAGAGCCATGGATCCTGCTGTTCCCAATATGAT 635
Query 741 GATTGATGCAGCTAAGCTGCTTTCTGCTCTTTGTATTCTACCGCAGCCAGAGGACATGAATGAAAGGGTTTTGG 814
||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|
Sbjct 636 GATTGATGCAGCAAAGCTGCTGTCTGCCCTCTGTATCCTGCCGCAGCCGGAGGACATGAATGAACGAGTTCTAG 709
Query 815 AGGCAATGACAGAAAGAGCTGAGATGGATGAAGTGGAACGTTTCCAGCCGCTGCTGGATGGATTAAAAAGTGGA 888
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 710 AGGCAATGACAGAGAGAGCTGAAATGGATGAGGTCGAACGCTTCCAGCCACTTCTGGACGGATTAAAAAGTGGG 783
Query 889 ACCACTATTGCACTGAAGGTTGGATGCCTACAGCTGATCAATGCTCTCATCACACCAGCGGAGGAACTTGACTT 962
|||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 784 ACCTCTATTGCCCTCAAAGTGGGATGCCTACAGCTCATCAATGCTCTCATCACTCCAGCTGAGGAACTGGACTT 857
Query 963 CCGAGTTCACATCAGAAGTGAACTGATGCGTTTGGGGCTACATCAGGTGTTGCAGGACCTTCGAGAGATTGAAA 1036
|||||||||||||.|||||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 858 CCGAGTTCACATCCGAAGTGAGCTGATGCGCCTGGGGCTGCATCAGGTGTTGCAGGAGCTTCGAGAGATTGAAA 931
Query 1037 ATGAAGATATGAGAGTGCAACTAAATGTGTTTGATGAACAAGGGGAAGAGGATTCCTATGACCTGAAGGGACGG 1110
||||||||||||.|||.||.||....||||||||||||||||||||.||.||||.||.|||.||||||||||||
Sbjct 932 ATGAAGATATGAAAGTACAGCTGTGCGTGTTTGATGAACAAGGGGATGAAGATTTCTTTGATCTGAAGGGACGG 1005
Query 1111 CTGGATGACATTCGCATGGAGATGGATGACTTTAATGAAGTCTTTCAGATTCTCTTAAACACAGTGAAGGATTC 1184
||||||||.||.|||||||||||||||||||||..||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1006 CTGGATGATATCCGCATGGAGATGGATGACTTTGGTGAAGTTTTTCAGATTATTTTAAACACAGTGAAAGATTC 1079
Query 1185 AAAGGCAGAGCCACACTTCCTTTCCATCCTGCAGCACTTACTCTTGGTCCGAAATGACTATGAGGCCAGACCTC 1258
|||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||..|.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1080 AAAGGCAGAGCCACACTTCCTGTCTATCTTGCAGCATCTCCTGTTGGTCCGAAATGATTATGAAGCCAGGCCAC 1153
Query 1259 AGTACTATAAGTTGATTGAAGAATGTATTTCCCAGATAGTTCTGCACAAGAACGGGGCTGATCCTGACTTCAAG 1332
||||||||||..||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 1154 AGTACTATAAACTGATTGAAGAATGTGTTTCTCAGATAGTTCTACACAAAAATGGAACTGATCCTGACTTCAAG 1227
Query 1333 TGCCGGCACCTCCAGATTGAGATTGAGGGATTAATTGATCAAATGATTGATAAGACAAAGGTGGAGAAATCTGA 1406
|||||.|||||.||||||||.||||||.||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1228 TGCCGACACCTGCAGATTGATATTGAGAGATTGGTTGATCAAATGATTGATAAAACAAAGGTGGAAAAATCTGA 1301
Query 1407 AGCCAAAGCTGCAGAGCTGGAAAAGAAGTTGGACTCAGAGTTAACAGCCCGACATGAGCTACAGGTGGAAATGA 1480
.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||
Sbjct 1302 GGCCAAAGCTACAGAGCTGGAAAAAAAGTTGGATTCAGAATTAACAGCGCGGCACGAGTTACAAGTAGAAATGA 1375
Query 1481 AAAAGATGGAAAGTGACTTTGAGCAGAAGCTTCAAGATCTTCAGGGAGAAAAAGATGCACTGCATTCTGAAAAG 1554
||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||..||.|||||||||||
Sbjct 1376 AAAAGATGGAAAATGACTTTGAGCAGAAACTTCAGGATCTTCAAGGAGAAAAGGATGCCTTGGATTCTGAAAAG 1449
Query 1555 CAGCAAATTGCCACAGAGAAACAGGACCTGGAAGCAGAGGTGTCCCAGCTCACAGGAGAGGTTGCCAAGCTGAC 1628
|||||.||..|..||.|||||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1450 CAGCAGATCACTGCACAGAAACAAGACCTGGAGGCAGAGGTGTCCAAGCTGACAGGAGAGGTTGCCAAGCTGTC 1523
Query 1629 AAAGGAACTGGAAGATGCCAAGAAAGAAATGGCTTCCCTCTCTGCGGCAGCTATTACTGTACCTCCTTCTGTTC 1702
|||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||| |||.|...|||..|.|||||||||.
Sbjct 1524 AAAAGAACTAGAAGATGCCAAGAATGAAATGGCTTCTCTCTCT------GCTGTGGTTGTTGCACCTTCTGTTT 1591
Query 1703 CTAGTCGTGCTCCTGTTCCCCCTGCCCCTCCTTTACCTGGTGACTCTGGCACTATTATTCCA------------ 1764
||||..|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1592 CTAGCAGTGCTGCTGTTCCCCCTGCCCCTCCTCTGCCTGGTGACTCTGGCACTGTTATTCCACCTCCCCCACCC 1665
Query 1765 CCACCACCTGCTCCTG--GGGATAGTACCAC--TCCTCCTCCTCCTCCTCC---TCCT------CCTCCTCCAC 1825
|||||.|||..||||| ||..|.||.|||| ||| |||||||..||||| |.|| |||||.||.|
Sbjct 1666 CCACCTCCTCTTCCTGGAGGTGTGGTCCCACCATCC-CCTCCTCTGCCTCCAGGTACTTGTATCCCTCCACCTC 1738
Query 1826 CTCCTTTGCCTGGGGGTGTTTGCAT--CTCCTCACCCCCTTCTTTACCTGGAGGTACTGCTATCTCTCCACCCC 1897
|||||||.|||||.||||.|||.|| |.||||.||||| ..||.|||||..||.||||.|||.|||||||.|
Sbjct 1739 CTCCTTTACCTGGAGGTGCTTGTATACCCCCTCCCCCCC--AGTTGCCTGGCAGTGCTGCCATCCCTCCACCTC 1810
Query 1898 CTCCTTTGTCTGGGGATGCTACCATCCCTCCACCCCCTCCTTTGCCTGAGGGTGTTGGCATCCCTTCACCCTCT 1971
|||||.|..||||.|.||||.|||||||.|||||.||.||||||||||.||.|..||.||||||..||||..|.
Sbjct 1811 CTCCTCTACCTGGAGTTGCTTCCATCCCCCCACCTCCCCCTTTGCCTGGGGCTACTGCCATCCCCCCACCTCCC 1884
Query 1972 TCTTTGCCTGGAGGTACTGCCATCCCCCCACCTCCTCCTTTGCCTGGGAGTGCTAGAATCCCCCCACCACCACC 2045
.||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||..||.|..|.||.||.||||||||.||
Sbjct 1885 CCTTTGCCTGGGGCTACTGCCATCCCCCCACCTCCCCCTTTGCCTGGAGGTACAGGTATACCACCACCACCTCC 1958
Query 2046 TCCTTTGCCTGGGAGTGCTGGAATTCCCCCCCCACCTCCTCCCTTGCCTGGAGAAGCAGGAATGCCACCTCCTC 2119
||||||||||||.||||.|||..|| ||||||||.||||||||||||||||.|.|||||.||||.|||||.|
Sbjct 1959 TCCTTTGCCTGGAAGTGTTGGCGTT---CCCCCACCCCCTCCCTTGCCTGGAGGACCAGGACTGCCTCCTCCCC 2029
Query 2120 CTCCCCCTCTTCCTGGTGGTCCTGGAATCCCTCCACCTCCTCCATTTCCCGGAGGCCCTGGCATTCCTCCACCT 2193
|||||||| |||||.||||..||||||||||||||||||
Sbjct 2030 CTCCCCCT------------------------------------TTTCCTGGAGCACCTGGCATTCCTCCACCT 2067
Query 2194 CCACCCGGAATGGGTATGCCTCCACCTCCCCCATTTGGATTTGGAGTTCCTGCAGCCCCAGTTCTGCCATTTGG 2267
|||||.||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 CCACCTGGTATGGGCGTGCCTCCACCTCCCCCCTTTGGATTTGGGGTTCCTGCGGCCCCAGTTCTGCCATTTGG 2141
Query 2268 ATTAACCCCCAAAAAGCTTTATAAGCCAGAGGTGCAGCTCCGGAGGCCAAACTGGTCCAAGCTTGTGGCTGAGG 2341
|||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2142 ATTAACCCCCAAAAAAGTTTATAAGCCAGAGGTGCAGCTCCGGAGGCCAAACTGGTCCAAGTTTGTGGCTGAGG 2215
Query 2342 ACCTCTCCCAGGACTGCTTCTGGACAAAGGTGAAGGAGGACCGCTTTGAGAACAATGAACTTTTCGCCAAACTT 2415
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2216 ACCTTTCCCAGGACTGCTTCTGGACAAAGGTGAAGGAGGACCGCTTTGAGAACAATGAACTTTTTGCCAAACTT 2289
Query 2416 ACCCTTACCTTCTCTGCCCAGACCAAGACTTCCAAAGCCAAGAAGGATCAAGAAGGTGGAGAAGAAAAGAAATC 2489
||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 ACCCTTGCCTTCTCCGCCCAGACCAAGACTTCTAAAGCCAAGAAGGATCAAGAAGGTGGAGAAGAAAAGAAATC 2363
Query 2490 TGTGCAAAAGAAAAAAGTAAAAGAGTTAAAGGTGTTGGATTCAAAGACAGCCCAGAATCTCTCAATCTTTTTGG 2563
|||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 TGTTCAAAAGAAGAAAGTAAAAGAGCTGAAAGTGCTGGATTCAAAGACAGCGCAGAATCTCTCAATCTTTTTGG 2437
Query 2564 GTTCCTTCCGCATGCCCTATCAAGAGATTAAGAATGTCATCCTGGAGGTGAATGAGGCTGTTCTGACTGAGTCT 2637
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2438 GTTCATTCCGCATGCCCTATCAAGAGATAAAGAACGTTATCCTGGAGGTGAATGAGGCTGTTCTCACAGAGTCT 2511
Query 2638 ATGATCCAGAACCTCATTAAGCAAATGCCAGAGCCAGAGCAGTTAAAAATGCTTTCTGAACTGAAGGATGAATA 2711
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2512 ATGATCCAGAACCTCATTAAACAGATGCCAGAGCCAGAGCAGCTAAAGATGCTCTCTGAACTGAAGGAGGAGTA 2585
Query 2712 TGATGACCTGGCTGAGTCAGAGCAGTTTGGCGTGGTGATGGGCACTGTGCCCCGACTGCGGCCTCGCCTCAATG 2785
.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2586 CGATGATCTGGCTGAGTCAGAGCAGTTTGGTGTGGTGATGGGCACAGTGCCCCGCCTTCGGCCTCGCCTCAACG 2659
Query 2786 CCATTCTCTTCAAGCTACAATTCAGCGAGCAAGTGGAGAATATCAAGCCAGAGATTGTGTCTGTCACTGCTGCA 2859
||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 2660 CCATCCTCTTCAAGCTACAGTTCAGTGAGCAAGTTGAGAACATCAAGCCAGAGATCGTGTCTGTCACCGCCGCA 2733
Query 2860 TGTGAGGAGTTACGTAAGAGTGAGAGCTTTTCCAATCTCCTAGAGATTACCTTGCTTGTTGGAAATTACATGAA 2933
||.||.|||.|.|||||||||||||.|||.||||..|||||.|||.|.||..||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 2734 TGCGAAGAGCTGCGTAAGAGTGAGAACTTCTCCAGCCTCCTGGAGCTCACACTGCTGGTCGGAAACTATATGAA 2807
Query 2934 TGCTGGCTCCAGAAATGCTGGTGCTTTTGGCTTCAATATCAGCTTCCTCTGTAAGCTTCGAGACACCAAGTCCA 3007
|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..
Sbjct 2808 TGCGGGCTCCAGGAATGCTGGTGCTTTCGGCTTCAATATCAGCTTCCTTTGTAAGCTTCGAGACACCAAGTCTG 2881
Query 3008 CAGATCAGAAGATGACGTTGTTACACTTCTTGGCTGAGTTGTGTGAGAATGACTATCCCGATGTCCTCAAGTTT 3081
||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||
Sbjct 2882 CAGATCAGAAGATGACTCTGTTGCATTTCTTGGCTGAGTTATGTGAGAATGACCACCCCGAAGTCCTCAAGTTT 2955
Query 3082 CCAGACGAGCTTGCCCATGTGGAGAAAGCCAGCCGAGTTTCTGCTGAAAACTTGCAAAAGAACCTAGATCAGAT 3155
||.||.||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.|||.||||.||||.|.||||||||||
Sbjct 2956 CCTGATGAGCTTGCCCATGTAGAGAAAGCCAGCAGAGTCTCTGCTGAGAACCTGCAGAAGAGCTTAGATCAGAT 3029
Query 3156 GAAGAAACAAATTTCTGATGTGGAACGTGATGTTCAGAATTTCCCAGCTGCCACAGATGAAAAAGACAAGTTTG 3229
||||||.||.|||.|.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 3030 GAAGAAGCAGATTGCGGACGTGGAGCGCGATGTTCAGAATTTCCCAGCTGCCACTGACGAGAAGGACAAGTTTG 3103
Query 3230 TTGAAAAAATGACCAGCTTTGTGAAGGATGCACAGGAACAGTATAACAAGCTGCGGATGATGCATTCTAACATG 3303
||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 3104 TTGAGAAGATGACCAGCTTTGTGAAGGATGCACAGGAACAGTATAACAAACTACGGATGATGCACTCCAACATG 3177
Query 3304 GAGACCCTCTATAAGGAGCTGGGCGAGTACTTCCTCTTTGACCCCAAGAAGTTGTCTGTTGAAGAATTTTTCAT 3377
||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 3178 GAGACCCTCTATAAGGAGCTAGGTGACTACTTCGTCTTTGACCCTAAGAAGTTGTCTGTAGAGGAATTCTTTAT 3251
Query 3378 GGATCTTCACAATTTTCGGAATATGTTTTTGCAAGCAGTCAAGG------AGGAGCCGCCCGGCGGGAGACAGA 3445
||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||| ||.|| ||.|||||.|||||
Sbjct 3252 GGATCTGCACAACTTTAGGAATATGTTTTTGCAAGCAGTCAAGGAAAACCAGAAG-----CGCCGGGAAACAGA 3320
Query 3446 AGAAAAGATGAGGCGAGCAAAACTAGCCAAGGAGAAGGCAGAGAAGGAGCGGCTAGAGAAGCAGCAGAAGAGAG 3519
||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 3321 AGAAAAGATGCGGAGAGCAAAATTAGCCAAGGAGAAGGCAGAAAAAGAGCGACTGGAGAAGCAGCAGAAGCGCG 3394
Query 3520 AGCAACTCATAGACATGAATGCAGAGGGCGATGAGACAGGTGTGATGGACAGTCTTCTAGAAGCCCTGCAGTCA 3593
||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3395 AGCAGCTCATCGACATGAACGCAGAGGGGGATGAGACAGGTGTGATGGACAGTCTTCTAGAAGCTCTGCAGTCA 3468
Query 3594 GGGGCAGCATTCCGACGGAAGAGAGGGCCCCGTCAAGCCAACAGGAAGGCCGGGTGTGCAGTCACATCTCTGCT 3667
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3469 GGGGCAGCATTCCGACGGAAGAGAGGGCCCCGGCAGGTCAACAGGAAGGCTGGGTGTGCAGTCACATCTCTGCT 3542
Query 3668 AGCTTCGGAGCTGACCAAGGATGATGCCATGGCTGCTGTTCCTGCCAAGGTGTCCAAGAACAGTGAGACATTCC 3741
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||..|||||..|||||||.|||||...|.|||
Sbjct 3543 AGCCTCGGAGCTGACCAAGGATGATGCCATGGCTCCTGGTCCTGTTAAGGTACCCAAGAAAAGTGAAGGAGTCC 3616
Query 3742 CCACAATCCTTGAGGAAGCCAAGGAGTTGGTTGGCCGTGCAAGC 3785
||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3617 CCACAATCCTGGAAGAAGCCAAGGAGCTGGTTGGCCGTGCAAGC 3660