Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000465924
Subject:
NM_006001.3
Aligned Length:
1350
Identities:
1303
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGCCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCGGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  AGCCAATAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370
            .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC  518

Query  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC  666

Query  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACAGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888
            |.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAATCAAATGGTCAAGTATGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962
            ||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGACCATAAGTT  1184
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT  1184

Query 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGGCT  1332

Query 1333  GAAGAAGGCGAAGAATAC  1350
            ||||||||.|||||||||
Sbjct 1333  GAAGAAGGTGAAGAATAC  1350