Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465946
- Subject:
- NR_135467.2
- Aligned Length:
- 1714
- Identities:
- 1313
- Gaps:
- 400
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GAGGAGGCTCTGGCAGCCTGGGCAGGGAGGCGGCGGGGGGCCGCGGAGCCGCTGGCCATCGATTCTCCCCGCCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGTGACGCCGTCCTTAGCCCTGCGACCCCCAGCGCGTCCCGGGCCTGCGCCTCCGCCCCGCCGCGCAGCGCACG 148
Query 1 ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCCCGGCCTCCGCCGGCAGGT 222
Query 75 AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA 296
Query 149 CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT 370
Query 223 CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC 444
Query 297 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG 518
Query 371 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 592
Query 445 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 666
Query 519 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 740
Query 593 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 814
Query 667 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 888
Query 741 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 962
Query 815 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGAT--------------------------------------- 849
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTGAATATGGTAATTTTTATGGCTTACTACCAGCATTT 1036
Query 850 -------------GGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCA 910
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTTTAAGTAAAGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGGAAAGATGGAATTCTTGTTAGCA 1110
Query 911 ACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGC 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCTGCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGC 1184
Query 985 ATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCT 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCAAGGACTTCCGCGACTTGCAGCT 1258
Query 1059 GGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACC 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAGGATGAAGAAGAGGAGGAGGACC 1332
Query 1133 CCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAA 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATATCCTATATACAGTTCCATAGAA 1406
Query 1207 GCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGA 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAATATGGATGAACAGTGGTTTGGA 1480
Query 1281 CACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC---------------------------------------- 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTACTGAAAACCACATGCATCTTGATGCGATCGCACTTTCTGAA 1554
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1555 GAAGGAAGGATCCCAAATGCCCCTCCAGTTCTGGTTCACCTGTACCTTCTATGAAGGAGAATTCGTCATGTCAT 1628
Query 1315 -------------------------------------------------------------------------- 1314
Sbjct 1629 TCAACACTCGTGAGGCCAGGAAGCTATTAAAGGGATGTTTCAAGCTGTTTCTAGCACATTCCAAAATAAATGAG 1702
Query 1315 ------------ 1314
Sbjct 1703 GAGGGAAGAGTC 1714