Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465946
- Subject:
- XM_017028421.1
- Aligned Length:
- 1314
- Identities:
- 1029
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 ATGCTTCTGCCGGGACGCGCACGCCAACCGCCGACGCCCCAGCCCGTGCAGCATCACGGCCTCCGCCGGCAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGAGCCGCCGGGGCAGCTCCTGCGCCTCTTCTACTGCACTGTCCTGGTCTGCTCCAAAGAGATCTCAGCGCTCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCGACTTCTCTGGTTACCTAACCAAACTCCTGCAAAACCACACCACCTATGCCTGTGATGGGGACTATTTGAAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTACAGTGCCCTCGGCATTCTACGATAAGTGTCCAATCGGCATTTTATGGGCAAGATTACCAAATGTGTAGTTC 296
|||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGTGTAGTTC 11
Query 297 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 CCAGAAGCCTGCCTCCCAGAGGGAAGACAGCTTAACCTGTGTGGCAGCCACCACCTTCCAGAAGGTGCTGGACG 85
Query 371 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 AATGCCAGAACCAGCGGGCCTGCCACCTCCTGGTCAATAGCCGTGTTTTTGGACCTGACCTTTGTCCAGGAAGC 159
Query 445 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 AGTAAATACCTCCTGGTCTCCTTTAAATGCCAACCTAATGAATTAAAAAACAAAACCGTGTGTGAAGACCAGGA 233
Query 519 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 GCTGAAACTGCACTGCCATGAATCCAAGTTCCTCAACATCTACTCTGCGACCTACGGCAGGAGGACCCAGGAAA 307
Query 593 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 GGGACATCTGCTCCTCCAAGGCAGAGCGGCTCCCCCCTTTCGATTGCTTGTCTTACTCAGCTTTGCAAGTCCTA 381
Query 667 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 TCCCGAAGGTGCTATGGGAAGCAGAGATGCAAAATCATCGTCAACAATCACCATTTTGGAAGCCCCTGTTTGCC 455
Query 741 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 AGGCGTGAAAAAATACCTCACTGTGACCTACGCATGTGTTCCCAAGAACATACTCACAGCGATTGATCCAGCCA 529
Query 815 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 TTGCTAATCTAAAACCTTCTTTGAAGCAGAAAGATGGTATAAACTTCGACCCAAGCGGATCGAAGGTTCTGAGG 603
Query 889 AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 AAAGATGGAATTCTTGTTAGCAACTCTCTGGCAGCCTTTGCTTACATTAGAGCCCACCCGGAGAGAGCTGCCCT 677
Query 963 GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 GCTGTTCGTGTCCAGTGTCTGCATCGGCCTGGCCCTCACACTGTGCGCCCTGGTCATCAGAGAGTCCTGTGCCA 751
Query 1037 AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 AGGACTTCCGCGACTTGCAGCTGGGGAGGGAGCAGCTGGTGCCAGGAAGTGACAAGGTCGAGGAGGACAGCGAG 825
Query 1111 GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 GATGAAGAAGAGGAGGAGGACCCCTCTGAGTCTGATTTCCCAGGGGAACTGTCGGGGTTCTGTAGGACTTCATA 899
Query 1185 TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TCCTATATACAGTTCCATAGAAGCTGCAGAGCTCGCAGAAAGGATTGAGCGCAGGGAGCAAATCATTCAGGAAA 973
Query 1259 TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 TATGGATGAACAGTGGTTTGGACACCTCGCTCCCAAGAAACATGGGCCAGTTCTAC 1029