Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466028
- Subject:
- XM_011536147.2
- Aligned Length:
- 2174
- Identities:
- 2120
- Gaps:
- 40
Alignment
Query 1 ATGAGCC---TGG--ACTGCACCAGCCATATCGCGCTGGGTGCCG-CTTC---------GCCA----------- 48
|||||.| ||| ||.|.||||| .||||.|.| ||.| ||||
Sbjct 1 ATGAGTCAGATGGAAACAGGACCAG-----------AGGGTTCAGTCTGCAGCCCACAGGCCAAACCCACCAAA 63
Query 49 ---GCGCCCGAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA 119
||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 TCTGCTCTGCAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA 137
Query 120 TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 138 TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG 211
Query 194 ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA 285
Query 268 AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC 359
Query 342 ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA 433
Query 416 AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 434 AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG 507
Query 490 AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC 581
Query 564 ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA 655
Query 638 TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA 729
Query 712 GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG 803
Query 786 TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG 877
Query 860 TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 878 TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC 951
Query 934 AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCACAGCCCTCCTTAGGGG 1007
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 952 AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCGCAGCCCTCCTTAGGGG 1025
Query 1008 CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA 1099
Query 1082 GCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAAGCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGG 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 GCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAAGCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGG 1173
Query 1156 TTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCAGAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACA 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 TTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCAGAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACA 1247
Query 1230 CCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTGTTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAAT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTGTTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAAT 1321
Query 1304 TTCTGGATCAGCTCTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC 1377
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TTCTGGATCAGCTTTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC 1395
Query 1378 GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA 1469
Query 1452 CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC 1543
Query 1526 AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT 1617
Query 1600 ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA 1691
Query 1674 GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC 1765
Query 1748 TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA 1821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA 1839
Query 1822 CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA 1913
Query 1896 AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG 1987
Query 1970 TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988 TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA 2061
Query 2044 TTGATCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA 2117
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062 TTGGTCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA 2135
Query 2118 CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT 2145
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136 CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT 2163