Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466045
• Subject: NM_183022.3
• Aligned Length: 2003
• Identities: 1425
• Gaps: 448

Alignment

Query    1  ATGCTGAGCGGAGCGGCTGGGGCTGCGCGGCGTGGCGGAGCAGCGCTCGCTCCCTCGCTCACTCGCTCGCTCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGGGACACACGCAGGGGCTGACAGCTGTGCTGGTGCTGATAAGGGAAGCCACAAGGAGACGATCGAGGAGAGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACAAGCGGCAGCAGAGGCAGCAGCGGCAGAGGCAGCACCAGGGCTGCGGAGCTGCTGGGAGTGGGAGTGACTCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCCACCTCGGGCCCCCACCCTGTCCCTGTCCTCTTCCCGCTTGCCCTGAGTTTAGAAGAGCAGCCGCTGCCACC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACTGCCACTCGGGAGGGCACCAGGGCTGCTGGCTAGGGAGGGACAGGGCAGGGAGGCTCTGGCCAGTCCCAGCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCCGGGGACAGATGCCGATCGAGATTGTGTGCAAAATCAAATTTGCTGAGGAGGATGCGAAACCCAAGGAGAAG  444
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -----------ATGCCGATCGAGATTGTGTGCAAAATCAAATTTGCTGAGGAGGATGCAAAACCCAAGGAGAAG  63

Query  445  GAGGCAGGGGATGAGCAGAGCCTCCTCGGGGCTGTT-----GCCCCTGGAGCAGCCCCCCGAGACCTGGCCACC  513
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|     |||     |||||||||.||.||||||||||||
Sbjct   64  GAGGCAGGGGATGAACAGAGCCTCCTGGGGGCTGCTCAGGGGCC-----AGCAGCCCCTCGGGACCTGGCCACC  132

Query  514  TTTGCCAGCACCAGCACCCTGCATGGACTGGGCCGGGCCTGTGGCCCAGGCCCCCACGGACTGCGCAGAACCCT  587
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  133  TTTGCCAGCACCAGCACTCTGCATGGGCTGGGCCGGGCCTGTGGCCCTGGCCCCCATGGACTGCGCAGAACCCT  206

Query  588  GTGGGCACTGGCCCTACTCACCTCGCTGGCTGCCTTCCTGTACCAGGCGGCTGGCCTGGCCCGGGGCTACCTGA  661
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||..||||||||.||||||||||||
Sbjct  207  GTGGGCACTGGCCCTACTCACCTCACTGGCTGCCTTTCTGTACCAGGCAGCCAGCCTGGCCAGGGGCTACCTGA  280

Query  662  CCCGGCCTCACCTGGTGGCAATGGACCCCGCTGCCCCAGCCCCAGTGGCGGGCTTCCCGGCTGTCACCCTCTGC  735
            ||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  281  CCCGGCCTCACCTGGTAGCCATGGACCCTGCTGCCCCAGCCCCAGTGGCGGGTTTTCCGGCTGTCACCCTCTGC  354

Query  736  AATATCAACCGCTTCCGGCATTCGGCACTCAGCGATGCCGACATCTTCCACCTGGCCAATCTGACAGGGCTGCC  809
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  AACATCAACCGCTTCCGGCACTCGGCACTCAGCGATGCTGATATCTTCCACCTGGCCAATCTGACAGGGCTGCC  428

Query  810  CCCCAAAGACCGGGATGGGCACCGTGCGGCTGGCCTGCGCTACCCAGAGCCTGACATGGTAGACATCCTCAACC  883
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  CCCCAAAGACCGGGACGGGCACCGTGCAGCTGGCCTTCGCTATCCAGAGCCTGACATGGTAGACATCCTCAACC  502

Query  884  GCACTGGCCACCAGCTCGCCGACATGCTTAAGAGCTGCAACTTCAGTGGGCATCACTGCTCCGCCAGCAACTTC  957
            ||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  503  GCACTGGCCACCAGCTTGCTGACATGCTCAAGAGCTGCAACTTCAGTGGGCACCACTGCTCCGCCAGCAACTTC  576

Query  958  TCTGTGGTCTATACTCGCTATGGGAAGTGTTACACCTTCAACGCGGACCCGCGGAGCTCGCTGCCCAGCCGGGC  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|.|||.||.||||||||..||||
Sbjct  577  TCTGTGGTCTATACTCGCTATGGGAAGTGTTACACCTTTAATGCAGATCCTCAGAGTTCACTGCCCAGTAGGGC  650

Query 1032  AGGGGGCATGGGCAGTGGCCTGGAGATCATGCTGGACATCCAGCAGGAGGAGTACCTGCCCATCTGGAGGGAGA  1105
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  651  AGGCGGCATGGGTAGTGGCCTGGAGATCATGCTAGACATCCAGCAGGAGGAATACCTACCCATATGGAGGGAGA  724

Query 1106  CAAATGAGACGTCGTTTGAGGCAGGTATTCGGGTGCAGATCCACAGCCAGGAGGAGCCGCCCTACATCCACCAG  1179
            ||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CAAACGAGACGTCATTCGAGGCAGGGATCCGGGTGCAGATCCACAGCCAGGAGGAGCCGCCCTACATCCACCAG  798

Query 1180  CTGGGGTTCGGGGTGTCCCCAGGCTTCCAGACCTTTGTGTCCTGCCAGGAACAGCGGCTGACCTACCTGCCCCA  1253
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  799  CTGGGGTTTGGCGTGTCCCCAGGCTTCCAGACTTTTGTGTCCTGCCAGGAACAGCGGCTAACTTATCTGCCCCA  872

Query 1254  GCCCTGGGGCAACTGCCGCGCAGAGAGTGAGCTCAGGGAGCCTGAGCTTCAGGGCTACTCGGCCTACAGTGTGT  1327
            |||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  873  GCCTTGGGGCAACTGCCGGGCGGAAAGCGAGCTCAGGGAGCCTGAGCTTCAGGGCTACTCAGCCTATAGTGTGT  946

Query 1328  CTGCCTGCCGGCTGCGCTGTGAAAAGGAGGCCGTGCTTCAGCGCTGCCACTGCCGGATGGTGCACATGCCA---  1398
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  947  CTGCCTGCCGACTGCGCTGTGAGAAGGAGGCCGTGCTTCAGCGCTGCCACTGCCGGATGGTGCACATGCCAGGC  1020

Query 1399  ------------------------------------------------------GACTCCCTGGGTGGGGGCCC  1418
                                                                  ||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1021  AACGAGACCATCTGCCCACCAAATATCTACATTGAATGTGCCGACCACACACTGGACTCCCTTGGTGGGGGCTC  1094

Query 1419  TGAGGGCCCGTGCTTCTGCCCCACCCCCTGCAACCTGACACGCTATGGGAAAGAGATCTCCATGGTCAGGATCC  1492
            .||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1095  CGAGGGCCCATGCTTCTGCCCTACACCCTGCAACCTGACTCGTTACGGCAAAGAGATCTCCATGGTCAAGATCC  1168

Query 1493  CCAACAGGGGCTCAGCCCGGTACCTGGCGAGGAAGTACAACCGCAACGAGACCTACATACGGGAGAACTTCCTG  1566
            |||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1169  CCAACAGGGGCTCAGCCAGATACCTGGCAAGGAAGTACAACCGCAATGAGACCTATATAAGGGAGAACTTCTTG  1242

Query 1567  GTCCTAGATGTCTTCTTTGAGGCCCTGACCTCTGAAGCCATGGAGCAGCGAGCAGCCTATGGCCTGTCAGCCCT  1640
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  GTCCTGGATGTCTTTTTCGAAGCCCTAACTTCTGAAGCCATGGAACAGCAAGCCGCCTATGGCCTGTCAGCCCT  1316

Query 1641  GCTGGGAGACCTCGGGGGACAGATGGGCCTGTTCATTGGGGCCAGCATCCTCACGTTGCTGGAGATCCTCGACT  1714
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1317  GCTGGGGGACCTTGGGGGACAGATGGGCCTGTTCATTGGGGCTAGCATCCTCACCTTGCTGGAGATCCTTGACT  1390

Query 1715  ACATCTATGAGGTGTCCTGGGATCGACTGAAGCGGGTATGGAGGCGTCCCAAGACCCCCCTGCGGACCTCCACT  1788
            |||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||||.|||.|.||.|||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1391  ACATCTATGAGGTCTCCTGGGATCGGCTCAAGAGGGTGTGGCGACGGCCCAAGACCCCACTGCGGACATCCACC  1464

Query 1789  GGGGGCATCTCCACTTTGGGGCTTCAGGAGCTGAAGGAACAGAGTCCCTGCCCGAGCCTGGGCCGAGCGGAGGG  1862
            |||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||.||.|||||
Sbjct 1465  GGGGGCATCTCCACTCTGGGGCTGCAGGAGCTGAAGGAACAGAGTCCCTGTCCAAGCCGGGGCCGTGCTGAGGG  1538

Query 1863  TGGGGGGGTCAGCAGTCTGCTCCCCAATCACCACCACCCCCACGGTCCCCCAGGAGGTCTCTTTGAAGATTTTG  1936
            ||||||||..|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||
Sbjct 1539  TGGGGGGGCTAGCAGCCTGCTTCCCAACCATCACCACCCTCACGGCCCCCCAGGAAGCCTCTTTGAAGACTTTG  1612

Query 1937  CTTGC  1941
            |||||
Sbjct 1613  CTTGC  1617