Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466052
• Subject: XM_011248346.2
• Aligned Length: 2691
• Identities: 2096
• Gaps: 396

Alignment

Query    1  ATGGACTGGCAGCCAGACGAGCAGGGCCTGCAGCAGGTCCTGCAGCTGCTCAAAGACTCACAGTCGCCCAACAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCCACTCAGCGCATCGTGCAGGATAAACTCAAACAACTCAATCAGTTTCCTGACTTCAACAACTACCTGATTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCGTCCTGACCAGACTCAAGTCAGAAGATGAGCCAACGCGCTCTCTCAGTGGCCTCATCCTCAAGAACAACGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAGGCACACTATCAGAGCTTCCCACCCCCTGTGGCAGACTTCATCAAACAGGAGTGTCTCAACAACATTGGCGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGCCTCCTCGCTCATCCGAGCCACCATTGGCATTCTCATCACCACCATCGCTTCCAAGGGTGAGCTGCAGATGT  370
                                                                                  ||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGT  4

Query  371  GGCCCGAGCTGCTGCCCCAGCTCTGCAACCTGCTTAACTCGGAGGATTACAACACTTGTGAGGGAGCCTTTGGA  444
            ||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct    5  GGCCAGAGCTGCTGCCTCAGCTGTGCAACCTGCTCAACTCAGAGGATTATAATACCTGTGAGGGAGCCTTTGGA  78

Query  445  GCCCTGCAGAAGATCTGTGAAGACTCATCAGAGCTTCTGGACAGTGACGCCCTCAACAGGCCCCTCAACATCAT  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  GCCCTACAGAAGATCTGTGAAGACTCCTCGGAGCTTTTGGATAGTGATGCTCTCAACAGGCCCCTCAACATCAT  152

Query  519  GATCCCCAAGTTCCTGCAGTTCTTCAAGCACTGCAGTCCCAAGATCCGGTCCCACGCCATCGCCTGCGTGAACC  592
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  153  GATCCCTAAATTCCTGCAGTTTTTCAAGCACTGCAGCCCTAAGATCCGGTCCCACGCCATCGCCTGTGTGAACC  226

Query  593  AGTTCATCATGGACCGGGCCCAGGCGCTGATGGACAATATTGACACCTTCATCGAGCACCTATTTGCCCTGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||.|||||
Sbjct  227  AGTTCATCATGGACCGGGCCCAAGCGCTGATGGACAACATTGACACTTTCATTGAGCACCTGTTTGCCTTGGCT  300

Query  667  GTGGATGATGACCCCGAGGTGCGGAAGAATGTGTGCCGTGCCCTGGTGATGCTTCTGGAAGTGCGGATTGACAG  740
            ||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct  301  GTGGATGATGACCCTGAGGTGAGAAAGAACGTGTGCCGGGCCCTTGTGATGCTTTTGGAAGTGCGAATTGACAG  374

Query  741  GCTCATCCCCCACATGCACAGCATCATCCAGTACATGCTGCAGAGGACCCAGGACCATGATGAGAACGTTGCCC  814
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  375  GCTCATCCCTCACATGCACAGCATCATCCAGTACATGCTGCAGAGGACCCAGGACCATGATGAGAACGTGGCCC  448

Query  815  TTGAGGCCTGTGAGTTCTGGCTGACGCTGGCCGAGCAGCCCATCTGCAAGGAAGTCCTGGCCTCCCATCTGGTC  888
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  449  TGGAGGCCTGTGAGTTCTGGCTGACGCTAGCCGAGCAGCCCATCTGCAAGGAAGTCCTGGCCTCTCATCTGGTC  522

Query  889  CAGTTGATCCCCATCTTGGTGAATGGGATGAAGTACTCGGAAATTGACATCATCCTGCTCAAGGGGGATGTGGA  962
            |||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  523  CAGTTGATCCCTATCCTCGTGAATGGGATGAAGTACTCTGAAATTGACATCATCCTTCTTAAGGGGGATGTGGA  596

Query  963  GGAGGATGAGGCTGTCCCCGACAGTGAGCAGGACATCAAGCCACGCTTCCACAAGTCACGCACGGTCACACTGC  1036
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.||.
Sbjct  597  GGAGGACGAGGCGGTACCTGACAGTGAGCAGGACATCAAGCCCCGGTTCCACAAGTCACGCACAGTGACATTGA  670

Query 1037  CCCACGAGGCTGAGCGGCCTGATGGCTCCGAGGACGCGGAGGATGACGATGATGATGATGCTCTGTCCGACTGG  1110
            |.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||.||||.||||||
Sbjct  671  CTCACGAGGCTGAGCGGCCTGATAGCTCTGAGGATGCTGAGGACGACGATGATGACGACGCTTTGTCGGACTGG  744

Query 1111  AATTTGAGGAAGTGCTCAGCGGCTGCACTGGACGTCCTCGCCAATGTCTTCCGGGAGGAACTGCTGCCCCACCT  1184
            |||.|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  745  AATCTGAGGAAGTGCTCTGCAGCTGCGCTGGATGTCCTTGCCAATGTCTTCCGGGAGGAACTGTTGCCCCACCT  818

Query 1185  ACTCCCACTACTCAAAGGCCTCCTCTTCCACCCCGAGTGGGTGGTCAAGGAGTCGGGCATCCTGGTGCTGGGCG  1258
            |||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  819  ACTTCCCCTGCTCAAGGGCCTCCTATTCCACCCTGAGTGGGTGGTCAAAGAGTCAGGGATCCTGGTGCTGGGCG  892

Query 1259  CCATTGCTGAGGGCTGCATGCAGGGCATGGTGCCCTACCTGCCTGAGCTGATCCCGCACCTGATCCAGTGCCTG  1332
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  893  CCATCGCTGAGGGCTGCATGCAGGGAATGGTGCCCTATCTACCTGAGCTGATCCCACACCTCATCCAGTGCCTG  966

Query 1333  TCGGATAAGAAGGCCTTGGTCCGCTCCATCGCCTGCTGGACGCTGAGCCGCTATGCCCACTGGGTGGTCAGCCA  1406
            ||.|||||||||||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  967  TCAGATAAGAAGGCTCTAGTACGCTCCATTGCCTGCTGGACGCTGAGCCGCTATGCCCACTGGGTAGTCAGCCA  1040

Query 1407  GCCACCCGACATGCACCTCAAGCCCCTGATGACAGAGCTGCTCAAACGCATCCTGGATGGCAACAAGAGGGTAC  1480
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1041  GCCACCTGACATGCACCTCAAGCCTCTGATGACGGAGCTGCTCAAGCGTATCTTGGATGGCAATAAGCGGGTTC  1114

Query 1481  AGGAGGCGGCCTGCAGTGCTTTTGCCACCCTGGAGGAAGAGGCCTGCACGGAGCTGGTGCCCTACCTCAGCTAC  1554
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1115  AGGAGGCAGCCTGCAGTGCATTTGCTACCCTGGAGGAGGAGGCATGCACGGAGCTGGTGCCCTACCTCAGCTAT  1188

Query 1555  ATCCTGGACACCCTTGTCTTTGCCTTTGGGAAATACCAGCACAAGAACCTGCTCATCCTCTATGACGCCATTGG  1628
            |||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1189  ATCCTTGACACTCTCGTTTTTGCCTTTGGCAAATACCAGCATAAGAACCTGCTCATCCTCTATGATGCCATTGG  1262

Query 1629  CACCCTGGCCGACTCTGTAGGCCACCACCTCAACCAGCCGGAATACATCCAGAAGCTGATGCCCCCACTGATCC  1702
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1263  CACCCTGGCCGACTCTGTGGGCCACCACCTCAATCAGCCGGAGTACATTCAGAAGCTGATGCCTCCGCTGATCC  1336

Query 1703  AGAAGTGGAATGAGCTCAAGGACGAAGACAAGGACCTCTTCCCCCTGCTGGAGTGTCTGTCATCGGTGGCCACC  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1337  AGAAGTGGAATGAGCTCAAGGACGAAGACAAGGACCTCTTCCCCCTGCTGGAGTGCCTATCATCTGTGGCCACT  1410

Query 1777  GCCCTGCAGAGTGGCTTCCTGCCTTACTGTGAGCCCGTCTACCAGCGCTGTGTCACCCTGGTGCAGAAGACACT  1850
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1411  GCCCTGCAGAGTGGCTTCCTGCCCTACTGCGAGCCTGTCTACCAGCGCTGTGTTACCCTGGTACAGAAGACACT  1484

Query 1851  GGCTCAGGCCATGATGTACACCCAGCACCCTGAGCAGTATGAGGCTCCCGACAAGGACTTCATGATCGTAGCAC  1924
            |||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||..
Sbjct 1485  GGCCCAGGCCATGATGTATACACAACACCCCGAACAATATGAGGCCCCAGACAAAGACTTCATGATTGTTGCGT  1558

Query 1925  TGGATCTGCTCAGCGGCCTGGCCGAGGGCCTGGGTGGTCACGTGGAGCAGCTGGTGGCCCGCAGCAACATCATG  1998
            ||||.|||||.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1559  TGGACCTGCTTAGTGGCTTGGCTGAGGGCCTGGGTGGCCACGTGGAGCAGCTGGTAGCTCGGAGTAACATCATG  1632

Query 1999  ACATTGCTGTTCCAGTGCATGCAGGACTCGATGCCTGAGGTCCGGCAGAGCTCCTTTGCCCTCCTGGGAGACCT  2072
            ||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1633  ACATTGCTCTTCCAGTGTATGCAGGATTCCATGCCTGAGGTCCGGCAGAGCTCCTTTGCCCTTCTGGGAGACCT  1706

Query 2073  CACCAAAGCCTGCTTCATCCATGTCAAGCCCTGTATCGCCGAGTTCATGCCCATTCTGGGCACCAACCTGAACC  2146
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1707  TACCAAAGCCTGCTTTATCCACGTCAAGCCCTGTATCGCTGAGTTCATGCCTATTCTGGGTACCAACCTGAACC  1780

Query 2147  CAGAGTTCATCTCCGTCTGCAACAACGCCACCTGGGCCATTGGTGAAATCTGCATGCAGATGGGGGCAGAGATG  2220
            |.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  CTGAGTTCATCTCTGTCTGCAACAATGCTACCTGGGCCATTGGGGAGATCTGCATGCAGATGGGGGCAGAGATG  1854

Query 2221  CAGCCTTATGTGCAGATGGTCCTCAACAACCTGGTGGAAATCATTAACCGACCCAACACACCCAAGACACTGCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1855  CAGCCTTATGTGCAGATGGTCCTCAACAACCTGGTGGAGATCATTAACAGGCCCAACACACCCAAGACGCTGCT  1928

Query 2295  GGAAAACA------------------------------CAGCCATCACCATCGGCCGCTTGGGCTACGTGTGCC  2338
            ||||||||                              ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1929  GGAAAACACAGGTCGCCTGACGAGTCCCTCTGCCATTCCAGCCATCACCATCGGCCGCCTGGGCTACGTGTGCC  2002

Query 2339  CCCAGGAGGTGGCACCCATGCTGCAGCAGTTCATCCGGCCTTGGTGCACGTCCCTCAGGAACATCAGGGACAAC  2412
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||
Sbjct 2003  CGCAGGAGGTGGCACCCATGCTGCAGCAGTTCATCCGGCCTTGGTGCACGTCCCTTAGGAACATCCGGGACAAC  2076

Query 2413  GAGGAGAAGGACTCAGCCTTCCGCGGCATCTGCATGATGATCGGTGTCAACCCGGGGGGCGTTGTGCAGGACTT  2486
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2077  GAGGAGAAGGATTCTGCCTTCCGAGGCATCTGCATGATGATTGGTGTCAATCCTGGGGGTGTTGTGCAGGACTT  2150

Query 2487  TATTTTCTTCTGCGATGCTGTAGCCTCCTGGGTGAGCCCGAAGGATGACCTTCGGGACATGTTTTATAAGATTC  2560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2151  TATTTTCTTCTGCGATGCTGTAGCCTCCTGGGTGAGCCCGAAGGATGACCTTCGGGACATGTTTTATAAGATCC  2224

Query 2561  TCCACGGCTTCAAAGACCAAGTTGGGGAAGATAACTGGCAGCAGTTCTCTGAGCAATTCCCGCCGCTGCTCAAG  2634
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 2225  TCCATGGCTTCAAAGACCAAGTTGGGGAGGAGAACTGGCAACAGTTCTCAGAGCAGTTCCCACCTCTGCTCAAG  2298

Query 2635  GAGAGGCTGGCGGCTTTCTATGGGGTC  2661
            |||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2299  GAGAGGCTGGCAGCCTTCTATGGGGTC  2325