Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466074
• Subject: NM_001283049.2
• Aligned Length: 3354
• Identities: 3036
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA  74

Query   75  AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct   75  AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAG----------------------------------------------  102

Query  149  GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA  222
                                                                                      
Sbjct  103  --------------------------------------------------------------------------  102

Query  223  AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT  296
                                                                                      
Sbjct  103  --------------------------------------------------------------------------  102

Query  297  CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG  370
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  -------------------------------------AGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG  139

Query  371  AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA  213

Query  445  TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA  287

Query  519  AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA  361

Query  593  GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT  435

Query  667  GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG  509

Query  741  GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA  583

Query  815  CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT  657

Query  889  TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC  731

Query  963  ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA  805

Query 1037  AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG  879

Query 1111  AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT  953

Query 1185  TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG  1027

Query 1259  AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT  1101

Query 1333  TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC  1175

Query 1407  TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC  1249

Query 1481  TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA  1323

Query 1555  CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA  1397

Query 1629  GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG  1471

Query 1703  TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT  1545

Query 1777  GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGCCATTTAAGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGG  1850
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct 1546  GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAG-----------------------------------------------  1572

Query 1851  AACTTTTAGAGAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG  1924
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1573  ----------------------------------------GCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG  1606

Query 1925  AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT  1680

Query 1999  CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC  1754

Query 2073  CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT  1828

Query 2147  CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829  CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT  1902

Query 2221  AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903  AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT  1976

Query 2295  CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977  CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT  2050

Query 2369  CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051  CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT  2124

Query 2443  AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125  AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC  2198

Query 2517  AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199  AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT  2272

Query 2591  ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273  ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT  2346

Query 2665  AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347  AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA  2420

Query 2739  ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421  ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA  2494

Query 2813  CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495  CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT  2568

Query 2887  ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569  ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA  2642

Query 2961  TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643  TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA  2716

Query 3035  AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717  AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC  2790

Query 3109  TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791  TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG  2864

Query 3183  TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2865  TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC  2938

Query 3257  ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939  ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA  3012

Query 3331  CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA  3354
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013  CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA  3036