Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466074
- Subject:
- XM_017022722.1
- Aligned Length:
- 3354
- Identities:
- 2784
- Gaps:
- 570
Alignment
Query 1 ATGCCTGCTGTGGCTTCAGTTCCTAAAGAACTCTACCTCAGTTCTTCACTAAAAGACCTTAATAAGAAGACAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGTTAAACCAGAGAAAATAAGCACTAAGAGTTATGTGCACAGTGCCCTGAAGATCTTTAAGACAGCAGAAGAAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCAGATTAGATCGTGATGAGGAAAGGGCCTATGTACTATATATGAAATACGTGACTGTTTATAATCTTATCAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAAGACCTGATTTCAAGCAACAGCAGGATTATTTCCATTCAATACTTGGACCTGGAAACATCAAAAAAGCTGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CGAAGAAGCTGAAAGACTCTCTGAAAGCCTTAAATTAAGATATGAAGAAGCTGAAGTCCGGAAAAAACTTGAGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AAAAAGACAGGCAGGAGGAAGCACAGCGGCTACAACAAAAAAGGCAGGAAACAGGAAGAGAGGATGGTGGCACA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTGGCTAAAGGCTCTTTGGAGAATGTTTTGGATTCCAAAGACAAAACCCAAAAGAGCAATGGTGAAAAGAATGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AAAATGTGAGACCAAAGAGAAAGGAGCAATCACAGCAAAGGAACTATACACAATGATGACGGATAAAAACATCA 592
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------ATGATGACGGATAAAAACATCA 22
Query 593 GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 GCTTGATTATAATGGATGCTCGAAGAATGCAGGATTATCAGGATTCCTGTATTTTACATTCTCTCAGTGTTCCT 96
Query 667 GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 GAAGAAGCCATCAGTCCAGGAGTCACTGCTAGTTGGATTGAAGCACACCTGCCAGATGATTCTAAAGACACATG 170
Query 741 GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 GAAGAAGAGGGGGAATGTGGAGTATGTGGTACTTCTTGACTGGTTTAGTTCTGCCAAAGATTTACAGATTGGAA 244
Query 815 CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 CAACTCTCCGGAGTCTGAAAGATGCACTTTTCAAGTGGGAAAGTAAAACTGTCCTGCGCAATGAGCCTTTGGTT 318
Query 889 TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TTAGAGGGAGGCTATGAAAACTGGCTCCTTTGTTATCCCCAGTATACAACAAATGCTAAGGTCACTCCACCCCC 392
Query 963 ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 ACGACGCCAGAATGAAGAGGTGTCTATCTCATTGGATTTTACTTATCCCTCATTGGAAGAATCAATTCCTTCTA 466
Query 1037 AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 AACCTGCTGCCCAGACGCCACCTGCATCTATAGAAGTAGATGAAAATATAGAATTGATAAGTGGTCAAAATGAG 540
Query 1111 AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGAATGGGACCACTGAATATATCAACTCCAGTTGAACCAGTTGCTGCTTCTAAATCTGATGTTTCACCCATAAT 614
Query 1185 TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 TCAGCCAGTGCCTAGTATAAAGAATGTTCCACAGATTGATCGTACTAAAAAACCAGCAGTCAAATTGCCTGAAG 688
Query 1259 AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 689 AGCATAGAATAAAATCTGAAAGTACAAACCATGAGCAACAATCTCCTCAGAGTGGAAAAGTTATTCCTGATCGT 762
Query 1333 TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 TCCACCAAGCCAGTAGTTTTTTCTCCAACTCTCATGTTAACAGATGAAGAAAAGGCTCGTATTCATGCAGAAAC 836
Query 1407 TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TGCTCTTCTAATGGAAAAAAACAAACAAGAAAAAGAACTTCGGGAAAGGCAGCAAGAGGAACAGAAAGAGAAAC 910
Query 1481 TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 TGAGGAAGGAAGAACAAGAACAAAAAGCCAAAAAGAAACAAGAAGCTGAAGAAAATGAAATTACAGAGAAGCAA 984
Query 1555 CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 CAAAAAGCAAAAGAAGAAATGGAGAAGAAAGAAAGTGAACAGGCCAAGAAAGAAGATAAAGAAACCTCAGCAAA 1058
Query 1629 GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059 GAGGGGCAAAGAAATAACAGGAGTAAAAAGACAAAGTAAAAGTGAACATGAAACTTCTGATGCCAAGAAATCTG 1132
Query 1703 TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 TAGAAGATAGGGGGAAAAGGTGTCCAACCCCAGAAATACAGAAAAAGTCAACAGGAGATGTGCCCCATACATCT 1206
Query 1777 GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGCCATTTAAGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 GTGACAGGGGATTCAGGTTCAGGCAAGCCATTTAAGATTAAAGGACAACCAGAAAGTGGAATTCTAAGGACAGG 1280
Query 1851 AACTTTTAGAGAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 AACTTTTAGAGAGGATACAGACGATACCGAAAGAAATAAAGCTCAACGAGAACCTTTGACAAGAGCACGAAGTG 1354
Query 1925 AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 AAGAAATGGGGAGGATCGTACCAGGACTGCCTTCAGGCTGGGCCAAGTTTCTTGACCCAATCACTGGAACCTTT 1428
Query 1999 CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 CGTTATTATCATTCACCCACCAACACTGTTCATATGTACCCACCGGAAATGGCTCCTTCATCTGCACCTCCTTC 1502
Query 2073 CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503 CACCCCTCCAACTCATAAAGCCAAGCCACAGATTCCTGCTGAGCGGGATAGGGAACCTTCCAAACTGAAGCGCT 1576
Query 2147 CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 CCTACTCCTCCCCAGATATAACCCAGGCTATTCAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGCCAACAGTAACTCCAACAGTT 1650
Query 2221 AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 AATCGGGAAAACAAGCCAACATGTTATCCTAAAGCTGAGATCTCAAGGCTTTCTGCTTCTCAGATTCGGAACCT 1724
Query 2295 CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 CAATCCTGTTTTTGGAGGTTCTGGACCAGCTCTTACTGGACTTCGTAACTTAGGAAATACTTGTTATATGAACT 1798
Query 2369 CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 CAATATTGCAGTGCCTATGTAACGCTCCACATTTGGCTGATTATTTCAACCGAAACTGTTATCAGGATGATATT 1872
Query 2443 AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 AACAGGTCAAATTTGTTGGGGCATAAAGGTGAAGTGGCAGAAGAATTTGGTATAATCATGAAAGCCCTGTGGAC 1946
Query 2517 AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1947 AGGACAGTATAGATATATCAGTCCAAAGGACTTTAAAATCACCATTGGGAAGATCAATGACCAGTTTGCAGGAT 2020
Query 2591 ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021 ACAGTCAGCAAGATTCACAAGAATTGCTTCTGTTCCTAATGGATGGTCTCCATGAAGATCTAAATAAAGCTGAT 2094
Query 2665 AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 AATCGGAAGAGATATAAAGAAGAAAATAATGATCATCTCGATGACTTTAAAGCTGCAGAACATGCCTGGCAGAA 2168
Query 2739 ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2169 ACACAAGCAGCTCAATGAGTCTATTATTGTTGCACTTTTTCAGGGTCAATTCAAATCTACAGTACAGTGCCTCA 2242
Query 2813 CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 CATGTCACAAAAAGTCTAGGACATTTGAGGCCTTCATGTATTTGTCTCTACCACTAGCATCCACAAGTAAATGT 2316
Query 2887 ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2317 ACATTACAGGATTGCCTTAGATTATTTTCCAAAGAAGAAAAACTCACAGATAACAACAGATTTTACTGCAGTCA 2390
Query 2961 TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TTGCAGAGCTCGACGGGATTCTCTAAAAAAGATAGAAATCTGGAAGTTACCACCTGTGCTTTTAGTGCATCTGA 2464
Query 3035 AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 AACGTTTTTCCTACGATGGCAGGTGGAAACAAAAATTACAGACATCTGTGGACTTCCCGTTAGAAAATCTTGAC 2538
Query 3109 TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2539 TTGTCACAGTATGTTATTGGTCCAAAGAACAATTTGAAGAAATATAATTTGTTTTCTGTTTCAAATCACTACGG 2612
Query 3183 TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2613 TGGGCTGGATGGAGGCCACTACACAGCCTATTGTAAAAATGCAGCAAGACAACGGTGGTTTAAGTTTGATGATC 2686
Query 3257 ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 ATGAAGTTTCTGATATCTCCGTTTCTTCTGTGAAATCTTCAGCAGCTTATATCCTCTTTTATACTTCATTGGGA 2760
Query 3331 CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA 3354
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 CCACGAGTAACTGATGTAGCCACA 2784