Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466123
• Subject: XM_006505398.2
• Aligned Length: 963
• Identities: 770
• Gaps: 72

Alignment

Query   1  ATGGCCATGGCAACCAAAGGAGGTACTGTCAAAGCTGCTTCAGGATTCAATGCCATGGAAGATGCCCAGACCCT  74
                 ||||.|.||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||||
Sbjct   1  ------ATGGAAGCCAAAGGAGGAACCGTGAAAGCTGCTTCAGGATTCAACGCAACTGAAGATGCCCAGACCCT  68

Query  75  GAGGAAGGCCATGAAAGGGCTCGGCACCGATGAAGACGCCATTATTAGCGTCCTTGCCTACCGCAACACCGCCC  148
           ||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||..|..||.|.||||||.|.||||||||||
Sbjct  69  GAGGAAGGCCATGAAAGGCCTCGGTACTGATGAAGATGCCATTATCGGAATCTTAGCCTACAGAAACACCGCCC  142

Query 149  AGCGCCAGGAGATCAGGACAGCCTACAAGAGCACCATCGGCAGGGACTTGATAGACGACCTGAAGTCAGAACTG  222
           ||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||.|||||||.||.|||
Sbjct 143  AGCGCCAGGAGATCAGGAGTGCCTACAAGAGCACCATTGGCAGGGACCTGATTGAGGACTTGAAGTCGGAGCTG  216

Query 223  AGTGGCAACTTCGAGC----------------------------------------------------------  238
           ||..|||||||.||||                                                          
Sbjct 217  AGCAGCAACTTTGAGCAGGTGATCCTGGGGCTGATGACACCCACAGTGCTGTATGACGTACAGGAGCTGCGGAG  290

Query 239  --------AGGGAGCCGGCACTGATGAGGGCTGCCTAATTGAGATCCTGGCCTCCCGGACCCCTGAGGAGATCC  304
                   |||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 291  GGCCATGAAGGGAGCTGGCACGGACGAGGGCTGTCTGATTGAGATCCTGGCCTCTCGTACCCCTGAGGAGATCC  364

Query 305  GGCGCATAAGCCAAACCTACCAGCAGCAATATGGACGGAGCCTTGAAGATGACATTCGCTCTGACACATCGTTC  378
           |.||.||.|.|||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||
Sbjct 365  GTCGAATCAACCAGACATACCAGCAGCAATATGGAAGGAGCCTTGAAGAGGACATCTGCTCTGACACATCCTTC  438

Query 379  ATGTTCCAGCGAGTGCTGGTGTCTCTGTCAGCTGGTGGGAGGGATGAAGGAAATTATCTGGACGATGCTCTCGT  452
           ||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|.|||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||..|
Sbjct 439  ATGTTCCAGCGAGTACTGGTGTCCCTGTCGGCGGCTGGCAGGGATGAAGGAAATTACCTTGATGATGCTCTTAT  512

Query 453  GAGACAGGATGCCCAGGACCTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAAATGGGGGACAGATGAGGTGAAATTTCTAACTG  526
           ||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||...
Sbjct 513  GAAGCAGGACGCCCAGGAACTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAGATGGGGGACAGACGAGGTGAAATTCCTAAGCA  586

Query 527  TTCTCTGTTCCCGGAACCGAAATCACCTGTTGCATGTGTTTGATGAATACAAAAGGATATCACAGAAGGATATT  600
           |||||||||||||||||||.||.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 587  TTCTCTGTTCCCGGAACCGGAACCATCTGCTCCACGTGTTTGATGAATACAAAAGAATCTCACAGAAGGACATT  660

Query 601  GAACAGAGTATTAAATCTGAAACATCTGGTAGCTTTGAAGATGCTCTGCTGGCTATAGTAAAGTGCATGAGGAA  674
           ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||.
Sbjct 661  GAACAGAGCATTAAGTCTGAGACATCTGGAAGCTTTGAAGATGCCCTGTTGGCTATAGTGAAGTGCATGCGGAG  734

Query 675  CAAATCTGCATATTTTGCTGAAAAGCTCTATAAATCGATGAAGGGCTTGGGCACCGATGATAACACCCTCATCA  748
           .|||.||.|||||||.|||||.|..||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 735  TAAACCTTCATATTTCGCTGAGAGACTTTATAAATCCATGAAGGGCTTAGGCACTGATGACAACACCCTCATCA  808

Query 749  GAGTGATGGTTTCTCGAGCAGAAATTGACATGTTGGATATCCGGGCACACTTCAAGAGACTCTATGGAAAGTCT  822
           ||||||||||.||..|||||||.|||||||||.||||.||||||||...|||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 809  GAGTGATGGTCTCAAGAGCAGAGATTGACATGCTGGACATCCGGGCGAGCTTCAAGAGGCTCTACGGGAAGTCT  882

Query 823  CTGTACTCGTTCATCAAGGGTGACACATCTGGAGACTACAGGAAAGTACTGCTTGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  896
           .|||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 883  TTGTACTCTTTCATCAAGGGTGACACTTCCGGAGACTACAGGAAGGTTCTGCTCGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  956

Query 897  T  897
           |
Sbjct 957  T  957