Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466133
• Subject: XM_017008427.2
• Aligned Length: 1285
• Identities: 934
• Gaps: 335

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCTCAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTTCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA  296

Query    1  -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG  370

Query   50  ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT  444

Query  124  CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC  518

Query  198  CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC  592

Query  272  TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA  345
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||       |.|||
Sbjct  593  TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAAA  659

Query  346  A-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCAT  412
            |       |.||.|||||.||.|..||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  AGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCAT  733

Query  413  GTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTC  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  GTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTC  807

Query  487  ACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGC  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  ACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGC  881

Query  561  CAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATC  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  CAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATC  955

Query  635  CCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGAT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGAT  1029

Query  709  GAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAA  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  GAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAA  1103

Query  783  AAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  AAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCT  1177

Query  857  CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCC  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  CGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCC  1251

Query  931  TCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  TCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  1278