Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466133
- Subject:
- XM_030254518.1
- Aligned Length:
- 1177
- Identities:
- 848
- Gaps:
- 227
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAACACCTGGAGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 148
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGGAACTG 9
|||||||||
Sbjct 149 TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG 222
Query 10 ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT 83
|||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct 223 ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT 296
Query 84 GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA 157
|.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA 370
Query 158 AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA 231
||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG 444
Query 232 TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG 305
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||
Sbjct 445 TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTG 518
Query 306 GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT 372
|||.||.||.|||||.|||||||||||||| |||| |.||.||.||.||.|..||..|||||
Sbjct 519 GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATT 585
Query 373 GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT 446
|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 586 GACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGT 659
Query 447 AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC 520
.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 660 CAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCC 733
Query 521 CAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC 594
|||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 734 CAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGAC 807
Query 595 CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT 668
|||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 808 CCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGT 881
Query 669 GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC 742
||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 882 GGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAAC 955
Query 743 TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA 816
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 956 TTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCA 1029
Query 817 GGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGA 1103
Query 891 CCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1104 CCAGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG 1170