Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466154
• Subject: XM_005248322.3
• Aligned Length: 1941
• Identities: 1791
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGCGCGGGCTGGCCCTCGGCTGGTGCTGAGCGAGGAGGCGGTTCGGGCGAAGAGCGGCTTAGGGCCTCACCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACCTGGCTGAGCTTCAGTCATTGTCTATTCCTGGAACTTACCAAGAGAAGATCACCCACCTGGGACATTCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGTAC  222
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --ATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGTAC  72

Query  223  CTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCACGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  CTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCACGC  146

Query  297  CTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTTTG  220

Query  371  TTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCCGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  TTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCCGA  294

Query  445  CTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  CTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCACA  368

Query  519  CCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  CCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC  442

Query  593  TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT  516

Query  667  GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA  590

Query  741  CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC  664

Query  815  AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC  738

Query  889  TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT  812

Query  963  GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT  886

Query 1037  CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG  960

Query 1111  GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG  1034

Query 1185  GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG  1108

Query 1259  CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG  1182

Query 1333  GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT  1256

Query 1407  GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC  1330

Query 1481  AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA  1404

Query 1555  CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG  1478

Query 1629  TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA  1552

Query 1703  TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC  1626

Query 1777  AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT  1700

Query 1851  GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG  1774

Query 1925  GAGGCTGCCAGGCCTGC  1941
            |||||||||||||||||
Sbjct 1775  GAGGCTGCCAGGCCTGC  1791