Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466154
- Subject:
- XM_017009626.1
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 567
Alignment
Query 1 ATGGCGCGGGCTGGCCCTCGGCTGGTGCTGAGCGAGGAGGCGGTTCGGGCGAAGAGCGGCTTAGGGCCTCACCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGACCTGGCTGAGCTTCAGTCATTGTCTATTCCTGGAACTTACCAAGAGAAGATCACCCACCTGGGACATTCTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGTAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCACGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTTTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCCGA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCACA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC 592
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------ATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC 25
Query 593 TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT 99
Query 667 GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA 173
Query 741 CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC 247
Query 815 AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC 321
Query 889 TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT 395
Query 963 GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT 469
Query 1037 CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG 543
Query 1111 GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG 617
Query 1185 GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG 691
Query 1259 CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG 765
Query 1333 GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT 839
Query 1407 GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC 913
Query 1481 AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA 987
Query 1555 CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG 1061
Query 1629 TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA 1135
Query 1703 TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC 1209
Query 1777 AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT 1283
Query 1851 GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG 1357
Query 1925 GAGGCTGCCAGGCCTGC 1941
|||||||||||||||||
Sbjct 1358 GAGGCTGCCAGGCCTGC 1374
