Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466154
• Subject: XR_001742148.1
• Aligned Length: 2198
• Identities: 1876
• Gaps: 317

Alignment

Query    1  ATGGCGCGGGCTGGCCCTCGGCTGGTGCTGAGCGAGGAGGCGGT--TCGGGCGAAGAGCGGCTTAGGGCCTCAC  72
                                                    ||||  ||          |.||.| ||||     
Sbjct    1  ----------------------------------------CGGTACTC----------CAGCAT-GGGC-----  18

Query   73  CGCGACCTGGCTGAGCTTCAGTCATTGTCTATTCCTGGAACTTACCAAGAGAAGATCACCCACCTGGGACATTC  146
                |.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   19  ----AACAGACTGAGCTTCAGTCATTGTCTATTCCTGGAACTTACCAAGAGAAGATCACCCACCTGGGACATTC  88

Query  147  TCTGATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGT  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  TCTGATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGT  162

Query  221  ACCTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCAC  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  ACCTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCAC  236

Query  295  GCCTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  GCCTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTT  310

Query  369  TGTTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  TGTTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCC  384

Query  443  GACTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCA  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  GACTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCA  458

Query  517  CACCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGT  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  CACCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGT  532

Query  591  CCTGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGC  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  CCTGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGC  606

Query  665  GTGAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607  GTGAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGG  680

Query  739  GACTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  681  GACTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAG  754

Query  813  CCAGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGT  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  CCAGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGT  828

Query  887  ACTTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  ACTTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAA  902

Query  961  ATGGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  ATGGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTT  976

Query 1035  TTCGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGAC  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  TTCGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGAC  1050

Query 1109  AGGACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051  AGGACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCT  1124

Query 1183  CGGGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125  CGGGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCA  1198

Query 1257  GGCGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACG  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199  GGCGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACG  1272

Query 1331  AGGCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  AGGCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCG  1346

Query 1405  ATGGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCA  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1347  ATGGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCA  1420

Query 1479  GCAGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGAC  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421  GCAGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGAC  1494

Query 1553  AACATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAG  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495  AACATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAG  1568

Query 1627  AGTGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGA  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1569  AGTGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGA  1642

Query 1701  GATTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCC  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643  GATTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCC  1716

Query 1775  ACAGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAG  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717  ACAGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAG  1790

Query 1849  GTGGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCA  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791  GTGGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCA  1864

Query 1923  TGGAGGCTGCCAGGCCTGC-------------------------------------------------------  1941
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct 1865  TGGAGGCTGCCAGGCCTGCTGACTCCTGCCGAGAAGCTGGGCCACCCCTTAAGCTTCCTGGTTTACTAGAAATT  1938

Query 1942  --------------------------------------------------------------------------  1941
                                                                                      
Sbjct 1939  CCCAACTGTTCCAAAGTGGTGGTACCCGCAGGCCCGACTGCTAGTTGTGTATGACCACGTCTGCCGGTCCATGT  2012

Query 1942  --------------------------------------------------------------------------  1941
                                                                                      
Sbjct 2013  TTTCAGCACCCATTGCCTGAAGTGTTAGCACCTTCACTCCGGCACTGAACTTCCCAGCCCTGCCGTGGAAGCTG  2086

Query 1942  ----------------------------------------------------  1941
                                                                
Sbjct 2087  CCTGCCAGGTCCTCCCCATCCTCAGGTGGAGGCTTCTCTGTTGAGGGGCCTC  2138