Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466165
• Subject: NM_001351019.2
• Aligned Length: 1789
• Identities: 1727
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCACCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTG-TTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCG  73
            |||       |.|||...||||.|             |.||| ||.|.|    ||.|||        |||| ||
Sbjct    1  ATG-------AGCTGGTTTACGTC-------------AGGTGTTTCCTC----CGCTGC--------CTGC-CG  41

Query   74  AGTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATT  147
            ||             ||.|.|||.|   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  AG-------------GCACCGGACG---GGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATT  99

Query  148  GCACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGC  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  GCACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGC  173

Query  222  TGATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  TGATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCA  247

Query  296  GTGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  GTGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAG  321

Query  370  CGGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  CGGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGA  395

Query  444  TGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  TGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGT  469

Query  518  ACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAA  543

Query  592  TGCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  TGCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCC  617

Query  666  TGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  TGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATG  691

Query  740  AAGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  AAGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAG  765

Query  814  AAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  AAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTA  839

Query  888  TGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTCTGCAG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  TGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTCTGCAG  913

Query  962  CATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAG  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAG  987

Query 1036  GCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAAGACTT  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  GCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAAGACTT  1061

Query 1110  TTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGG  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGG  1135

Query 1184  ATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  ATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGG  1209

Query 1258  CTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTT  1283

Query 1332  ACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  ACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAA  1357

Query 1406  CATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  CATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCC  1431

Query 1480  CCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCT  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432  CCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCT  1505

Query 1554  CCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACC  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506  CCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACC  1579

Query 1628  GAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTG  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580  GAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTG  1653

Query 1702  GAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGAT  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1654  GAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGAT  1727

Query 1776  GGAAAAACCTTTC  1788
            |||||||||||||
Sbjct 1728  GGAAAAACCTTTC  1740