Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466165
• Subject: XM_006530503.3
• Aligned Length: 1794
• Identities: 1445
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCACCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGA  74
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGCACCTGTCGTACGGGCGAGTGAACCTGAACGTGCTGCGCGAGGCGGTGCGTCGGGAGCTGCGCGA  74

Query   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATTG  148
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCTGGGAGCAAGGCAATAGTGTGGGATGAGTACTTAACAGGACCATTTGGACTGATCG  148

Query  149  CACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCT  222
            |||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.||||||
Sbjct  149  CACAGTACTCACTACTAAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAGTCGTCTGCCCGCAGCT  222

Query  223  GATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCAG  296
            |||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct  223  GATGTCAAGAACATCATTTTTTTGGTCAGACCCAGGCTAGAGCTGATGGACATAATTGCTGAGAATGTACTCAG  296

Query  297  TGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGC  370
            |||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||..||||.||.||||
Sbjct  297  TGAGGACAGGCGTGGCCCTACCAGGGATTTCCATATTTTGTTTGTGCCTCGCCGGAGCCTACTGTGTGAGCAGC  370

Query  371  GGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGAT  444
            ||.|||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GGCTGAAGGACCTGGGGGTTTTGGGATCCTTTATTCATCGAGAAGAATACAGCTTGGATCTCATTCCATTTGAT  444

Query  445  GGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGTA  518
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGGGACCTCTTATCCATGGAGTCAGAGGGCGCTTTCAAAGAGTGCTACCTGGAAGGCGACCAGACCAGCCTGTA  518

Query  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAGGCGCTGTATGGAACTATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAGT  592

Query  593  GCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCCT  666
            |.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||.
Sbjct  593  GTGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGGTCAGGATGAAGAGGGAGTTCACAGGAAGCCAGAACTCAGTGTTCCCC  666

Query  667  GTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGA  740
            ||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|..|.||.||.||.|||.|.|||||.||.|||||
Sbjct  667  GTGTTTGATAACCTCTTGCTGCTTGATCGCAATGTGGATCTCCTGACGCCACTCGCCTCCCAGCTCACGTATGA  740

Query  741  AGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAGA  814
            |||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  741  AGGCCTCATCGATGAGATTTACGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAGTTGCCTCCAGAGAAGTTTGCACCCAAGA  814

Query  815  AACAG------GGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAG  882
            |.|||      |||..||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct  815  AGCAGGGTGGCGGCAGTGGTGGGAAGGACCTTCCCACGGAGGCCAAGAAGCTTCAGCTCAACTCCGCAGAGGAG  888

Query  883  CTCTATGCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTC  956
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  CTCTACGCCGAGATCCGAGACAAGAACTTCAACGCTGTGGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAGGCGAAGATCATCTC  962

Query  957  TGCAGCATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACA  1030
            ||||||.||||||||..|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct  963  TGCAGCGTTCGAGGAGCGACACAACGCTAAGACAGTCGGGGAGATCAAGCAGTTTGTGTCCCAGCTACCCCACA  1036

Query 1031  TGCAGGCAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAA  1104
            ||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  TGCAGGCAGCCAGGGGATCGCTCGCCAACCACACCTCAATTGCAGAGTTAATCAAAGACGTCACCACTTCTGAA  1110

Query 1105  GACTTTTTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACAT  1178
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||                
Sbjct 1111  GACTTCTTTGATAAGTTGACAGTGGAGCAGGAGTTCATGTCCGGGATAGACACTGATA----------------  1168

Query 1179  TGAGGATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATA  1252
                                                                                      
Sbjct 1169  --------------------------------------------------------------------------  1168

Query 1253  GTGGGCTCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTG  1326
                                                            ||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 1169  ------------------------------------------------AGACCTACGGCTATGAGCACATACTG  1194

Query 1327  ACCTTACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACG  1400
            |||||..|||||||||||||||||||||||||.||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1195  ACCTTGAACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTCAAGGCTCAGACAGGGGGCAGAAACAATTACCCAACAATCCG  1268

Query 1401  GAAAACATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGT  1474
            |||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1269  GAAAACACTGCGCCTCTGGATGGACGATGTCAATGAACAAAACCCCACAGACATATCCTATGTGTACAGCGGTT  1342

Query 1475  ATGCCCCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGC  1548
            ||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1343  ATGCTCCACTCAGCGTGCGACTGGCTCAGCTCCTTTCCCGGCCAGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTTCTCCGC  1416

Query 1549  ATCCTCCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGA  1622
            ||.||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1417  ATTCTCCCAGGGCCCCACTTTGAAGAAAGACAGCCACTGCCCACCGGGCTGCAGAAGAAACGCCAGCCAGGAGA  1490

Query 1623  AAACCGAGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCC  1696
            ||||.||||.||.|||.||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 1491  AAACAGAGTCACACTGGTATTTTTCCTCGGGGGCGTCACCTTTGCGGAAATAGCCGCCCTGCGATTTTTGTCCC  1564

Query 1697  AGTTGGAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCT  1770
            ||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct 1565  AGCTGGAAGATGGAGGCACCGAGTATGTCATTGCGACCACTAAACTGATGAATGGAAACAGCTGGATAGAAGCT  1638

Query 1771  CTGATGGAAAAACCTTTC  1788
            ||.||||||||.||||||
Sbjct 1639  CTCATGGAAAAGCCTTTC  1656