Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466186
• Subject: XM_006503413.2
• Aligned Length: 1188
• Identities: 1110
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGTTTGCCAAAGGCAAAGGCTCGGCGGTGCCCTCGGATGGGCAGGCTCGGGAAAAGTTAGCTTTATACGTCTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGCCAAAGGCAAAGGCTCGGCGGTGCCCTCGGACGGGCAGGCTCGGGAAAAGTTAGCTTTATACGTCTA  74

Query   75  CGAATATTTACTGCACGTAGGAGCACAGAAATCTGCACAGACCTTCTTATCGGAGATTCGATGGGAAAAAAACA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAATATTTACTGCACGTAGGAGCACAGAAATCTGCACAGACCTTCTTATCAGAGATTCGATGGGAAAAAAACA  148

Query  149  TCACGTTGGGAGAACCGCCTGGGTTTTTGCACTCGTGGTGGTGTGTATTTTGGGACCTTTACTGTGCAGCTCCT  222
            ||||..||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACACTGGGTGAACCGCCTGGGTTCCTGCACTCGTGGTGGTGTGTATTTTGGGACCTTTACTGTGCAGCTCCT  222

Query  223  GAAAGGAGAGACACTTGTGAACATTCAAGTGAAGCAAAAGCCTTTCATGATTATAGTGCAGCAGCTGCCCCGAG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GAAAGGAGAGACACTTGTGAACATTCAAGTGAAGCAAAAGCCTTTCATGATTATAGTGCAGCAGCTGCCCCAAG  296

Query  297  CCCCGTGCTTGGCAACATTCCCCCCAACGATGGGATGCCGGGAGGCCCCATCCCGCCAGGTTTCTTTCAGGGTC  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTGTGCTTGGCAACATTCCCCCCAATGATGGGATGCCCGGAGGCCCCATCCCGCCAGGTTTCTTTCAGGGTC  370

Query  371  CTCCGGGGTCACAGCCCTCGCCGCACGCACAGCCTCCACCTCACAATCCTAGCAGCATGATGGGACCCCACAGT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCGGGGTCACAGCCCTCGCCGCACGCACAGCCTCCACCTCACAATCCCAGCAGCATGATGGGACCCCACAGT  444

Query  445  CAGCCTTTTATGTCACCGCGATACGCAGGCGGCCCCAGGCCCCCGATCAGAATGGGAAACCAGCCTCCGGGAGG  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CAGCCTTTTATGTCACCGCGATATGCAGGCGGCCCCAGGCCCCCGATCAGAATGGGAAACCAGCCTCCAGGAGG  518

Query  519  AGTTCCTGGGACACAGCCATTGCTGCCCAATTCTATGGATCCCACACGACAACAAGGCCACCCCAACATGGGAG  592
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTCCTGGGACACAGCCACTGCTGCCCAATTCCATGGATCCCACACGACAACAAGGTCACCCCAACATGGGAG  592

Query  593  GATCAATGCAGAGAATGAACCCTCCCCGAGGCATGGGGCCCATGGGTCCCGGCCCA------------------  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||                  
Sbjct  593  GATCAATGCAGAGAATGAACCCTCCCCGAGGCATGGGGCCCATGGGGCCTGGCCCACAGACTGACCCTTGGTTA  666

Query  649  ------CAGAATTACGGCAGCGGCATGAGACCACCACCCAACTCCCTCGGCCCCGCCATGCCCGGGATTAACAT  716
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  TCGTTGCAGAATTACGGCAGCGGCATGAGACCACCACCCAACTCCCTCGGCCCCGCCATGCCTGGGATTAACAT  740

Query  717  GGGCCCGGGAGCTGGCAGACCCTGGCCCAATCCTAACAGTGCTAACTCAATTCCATACTCCTCCTCATCACCTG  790
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  GGGCCCAGGAGCTGGCAGACCCTGGCCCAATCCCAACAGTGCTAACTCAATCCCGTACTCCTCATCATCACCCG  814

Query  791  GTACCTATGTGGGACCCCCTGGTGGTGGCGGTCCTCCAGGAACACCCATTATGCCCAGTCCCGCAGATTCAACA  864
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  815  GAACCTATGTGGGACCCCCTGGTGGTGGTGGCCCTCCAGGAACCCCCATCATGCCTAGTCCTGCAGATTCAACA  888

Query  865  AATTCCAGTGACAACATCTACACAATGATTAATCCAGTGCCGCCTGGAGGCAGCCGGTCCAACTTCCCGATGGG  938
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  889  AATTCCAGTGACAACATCTACACAATGATTAATCCTGTGCCGCCTGGAGGCAGCCGGTCTAACTTTCCAATGGG  962

Query  939  TCCCGGCTCGGACGGTCCGATGGGCGGCATGGGTGGCATGGAGCCACACCACATGAATGGATCATTAGGGTCAG  1012
            |||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||||
Sbjct  963  TCCTGGCTCAGACGGCCCAATGGGAGGCATGGGCGGCATGGAGCCCCACCACATGAATGGATCCCTAGGATCAG  1036

Query 1013  GCGACATAGACGGACTTCCAAAAAATTCTCCTAACAACATAAGTGGCATTAGCAATCCTCCAGGCACCCCTCGA  1086
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  GTGACATAGATGGACTTCCAAAAAATTCTCCTAACAACATAAGTGGCATTAGCAATCCTCCAGGCACCCCTCGC  1110

Query 1087  GATGACGGCGAGCTAGGAGGGAACTTCCTCCACTCCTTTCAGAACGACAATTATTCTCCAAGCATGACGATGAG  1160
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGACGGCGAGCTAGGGGGGAACTTCCTCCACTCCTTCCAGAACGACAATTATTCTCCGAGCATGACGATGAG  1184

Query 1161  TGTG  1164
            .|||
Sbjct 1185  CGTG  1188