Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466223
- Subject:
- XR_001781538.1
- Aligned Length:
- 2365
- Identities:
- 1379
- Gaps:
- 844
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTTCACCCCCTTAGCATATGTTAGTTACACATTTTAATGGGTTTCACTGTTACATTTTCATACGTGTGTGTAAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTACTTGATCACCCATATTCCCCATAACTCTGGTTCCATCGTTCCCATAGCCTCCTTGTCTCCTTACATTGTCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TATCGGTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGTGACCCACAGAGTTTAACTAGGTTTGCAAATAGGATCAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAATGAGGGTTAATTTACAGTATCACTAGCACCTTATCAATGGCTATACCATCAAAGAAAATGGCTTTCCTTCT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CCCCAGCAACCATTAGCTGCATGTATAGTCTCAACAATAGAGGACCAGAGGGAGGGAAGAGGTGATGTGGTGTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGCCCTCCATATCTCAGGATTGCATGTTCACATATCCAATATGTGATAATCACTATATTTTATGCTGATAATCA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTATATCCCTAGAGTTTATGGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTAAGACAAACTTTCACTCTATAGCCTAG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GCTGGCCTGAAACTCACTATGAAGCCAGAGATGACCTTGAACTTCTGATCCTCTCACCTCCATCCCTGAGTGCT 592
Query 1 --------------------------------------------ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCC 30
|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 GGGACTGCTGGGCCCGCTGCTCAGCACACCTGGCTCCAGAGGCCATGGCCTGCCTCCATGAAACCCGAACACCC 666
Query 31 TCTCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATCCATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTTCTGA 104
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 TCCCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACTCTAAGTGAGGCTTCTATGCGAAAGCTGGATCCAGACACTTCAGA 740
Query 105 CTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCAGTGTGTACTTCGAGATGTGGTACCCCTTGGTGGGCAGGGTG 178
||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 741 CTGCACCCCCGAGAAAGACCTGACGCCCACCCAATGTGTACTTCGAGATGTTGTGCCTCTCGGTGGGCAGGGTG 814
Query 179 GGGGAGGGCCCAGCCCCTCCCCAGGTGGAGAGCCGCCCCCTGAGCCTTTTGCCAACAGTGTCCTGCAGCTACAT 252
|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815 GAGGAGGACCCAGCCCCTCCCCAGGTGGAGAGCCTCCCCCAGAGCCTTTTGCCAATAGTGTCCTCCAGCTACAT 888
Query 253 GAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTCACCTGAGAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGA 326
|||||||||.||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 889 GAGCAGGATACAGGTGGGCCAGGGGGAGCCACTGGGTCACCTGAGAGTCGAGCATCTAGAGTTCGAGCTGATGA 962
Query 327 GGTGCGACTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCCTCTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACCA 400
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 GGTACGTCTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAAGGTCTTTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACAA 1036
Query 401 TGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCAGGAAGACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATC 474
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGATTGGCAAAGCCTACTCCACAGAACACAAGCAACAGCAGGAAGACCTTTGGGAAGTCCCCTTTGAGGAAATC 1110
Query 475 CTGGACCTGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTTCCTGGGGCGCTTCCACGGGGAGGAGGTGGC 548
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CTGGACCTGCAGTGGGTAGGCTCAGGGGCTCAGGGTGCTGTTTTCCTGGGACGCTTCCACGGGGAGGAGGTAGC 1184
Query 549 TGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGACATCAAGCA-CTTGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATC 621
||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTGAAGAAGGTTCGAGATCTCAAGGAGACTGACATCAAGCATCTT-CGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATC 1257
Query 622 ACTTTCAAGGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCTCATGGAGTTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTA 695
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1258 ACTTTCAAGGGTGTTTGCACACAGGCCCCCTGCTACTGCATCCTTATGGAATTCTGCGCTCAAGGACAGCTATA 1331
Query 696 TGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTACTGGTTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCA 769
||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGAGGTGCTCAGAGCCGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTGCTGGTTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCA 1405
Query 770 TGAACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAGTCACCCAACATGCTAATCACCTACGACGAT 843
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1406 TGAATTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGAGACCTGAAGTCACCCAACATGCTAATCACATACGACGAT 1479
Query 844 GTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGACAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGGAC 917
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1480 GTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGACAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGAAC 1553
Query 918 AGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGTCTGAGAAGGTCGACATCTGGTCCTTTGGCG 991
|||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1554 AGTAGCCTGGATGGCTCCTGAAGTGATCAGAAATGAACCTGTGTCTGAGAAGGTTGACATCTGGTCCTTTGGGG 1627
Query 992 TGGTGCTATGGGAACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGACGTAGATTCCTCAGCCATTATCTGGGGTGTG 1065
||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1628 TGGTGCTATGGGAACTACTGACTGGAGAGATTCCCTACAAAGATGTAGATTCCTCAGCCATCATCTGGGGTGTG 1701
Query 1066 GGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGCCCAGATGGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTG 1139
|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1702 GGAAGCAACAGTCTCCACCTGCCTGTACCCTCCAGCTGCCCAGATGGTTTTAAAATTCTACTTCGCCAGTGCTG 1775
Query 1140 GAATAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGCTGCATCTGGACATTGCCTCAGCTGATGTAC 1213
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1776 GAACAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCTTGCTGCACCTGGACATCGCCTCCGCTGATGTGC 1849
Query 1214 TCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGG-------CAGAGTGGCGGGAAGAAGTAAAACTGCACTT 1280
||||.||||||||||||||||||||||||||||||| ||...||| ||| |||..
Sbjct 1850 TCTCTACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGGAACCATTCATCATGG--------AGT-------CACAG 1908
Query 1281 TGAAAAG------ATTAAGTCAGAAGGGA--CCTGTCTGCACCGCCT-AGAAGAGGAACTGGTGATGAGGAGGA 1345
.|||.|| .||..|.||.|||.|| ||.| || ||||| | .|||.|..|.||
Sbjct 1909 AGAACAGGGTCCATTTCGGCCACAAGCGAACCCAG-CT-CACCG--TGGGAAAATCATCT-------------- 1964
Query 1346 GGGAGGAGC----TCAGACACGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAGCCAACAACCT 1415
|| |||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1965 -------GCCCTTTCAGACATGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAACGGAAGTTGGAGAGAGCCAACAACCT 2031
Query 1416 GTATATGGAACTTAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAGGCGAGAGCAAGCTT 1489
|||.||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||..||||||||||||||||.||||
Sbjct 2032 GTACATGGAACTGAATGCCCTCATGCTGCAACTAGAACTCAAAGAGAGGGAATTGCTCAGGCGAGAGCAGGCTT 2105
Query 1490 TAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAGCCACACCCTTCCCGGGGCCCCCAGCTTCCCTCCCTCCAT-GAAAG 1562
||||..||.||||.||.||.||.||.|||.||||||||||.||||||| .|||.||| ||||
Sbjct 2106 TAGAAAGGCGGTGTCCTGGTCTACTAAAGTCACACCCTTCTCGGGGCC------------TCCTACATGGAAA- 2166
Query 1563 CCACTCGTATTCCTTGTACATAGAGAA----ATATTTATATAAATTATATATATATATACATATATATATATAT 1632
|||| ||.||||| |
Sbjct 2167 -CACT--------------ATGGAGAAGCTCA------------------------------------------ 2183
Query 1633 ATGCGCCACATAATCAACAGAAAGATGGGGCTGTCCCAGCCGTAAGTCAGGCTCGAGGGAGACTGATCCCC 1703
Sbjct 2184 ----------------------------------------------------------------------- 2183
