Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466264
- Subject:
- NM_006001.3
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG 74
|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCGTGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCAGGAGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGATTCCTTCA 148
|||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 75 CCTGGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAGATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGTGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGGGCTGGCAAGCATGTGCCCCGGGCAGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC 222
||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAACTTATCACAGGCAAAGAAGATGC 296
.|.||||||||.|||||.||.|||||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGAACCTATAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC 296
Query 297 TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTCGTGTTGGACCGAATTCGCA 370
.||||||||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 297 GGCCAATAATTACGCCAGAGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATCGTCGACCTGGTCCTGGACCGGATCCGCA 370
Query 371 AGCTGGCCGACCAGTGCACGGGTCTCCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG 444
|.|||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||.|..|.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AACTGGCGGATCTGTGCACGGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGTTTTGGGGGTGGCACTGGCTCTGGG 444
Query 445 TTCACCTCGCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCTATTTACCC 518
|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..|.||||||||
Sbjct 445 TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACGGCAAGAAGTCCAAGCTAGAATTTGCCATTTACCC 518
Query 519 GGCGCCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT 592
.||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AGCCCCCCAGGTCTCCACGGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTGACCACCCACACGACCCTGGAACATT 592
Query 593 CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATTGAGCGTCCA 666
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct 593 CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATCGAGCGTCCC 666
Query 667 ACCTATACTAACCTGAATAGGTTAATAGGTCAAATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC 740
||.||.||.|||||.|||.|..|.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.||.||
Sbjct 667 ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGACGGGGC 740
Query 741 CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTATCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT 814
|||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTAGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT 814
Query 815 ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT 888
|.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 ACGCCCCGGTCATCTCAGCCGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCCGTGGCTGAGATCACCAATGCCTGCTTC 888
Query 889 GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG 962
|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct 889 GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCACGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG 962
Query 963 TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAGACCAAGCGTACCATCCAGTTTGTGGATT 1036
.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GGATGTGGTCCCGAAAGATGTCAACGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACCATCCAGTTTGTAGATT 1036
Query 1037 GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTGCCCAACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACGGTGGTCCCTGGGGGAGACCTGGCCAAG 1110
Query 1111 GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT 1184
||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAGCGGGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATCGCGGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCATAAGTT 1184
Query 1185 TGACCTGATGTATGCCAAACGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTTGGGGAGGGGATGGAGGAAGGTGAGTTTTCAG 1258
.||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CGATCTCATGTATGCCAAGCGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGAGAAGGCATGGAGGAGGGGGAGTTCTCTG 1258
Query 1259 AGGCCCGTGAGGACATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT 1332
|||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259 AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTGGAGAAGGATTATGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCCGAGGCT 1332
Query 1333 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC 1353
||||||||.||.||||||
Sbjct 1333 ---GAAGAAGGTGAAGAATAC 1350