Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466268
- Subject:
- XM_006511370.2
- Aligned Length:
- 1627
- Identities:
- 1312
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGGC-ATTA-----CGGGTGGCGGCGGTCGGGGCAAGGCTCAGCGTTCTGGCGAGCGGTCTCCGCGC 68
||||||||||| |||| ||||.||.|||||..||.||.|||||||||||||||....||||.|||.||..
Sbjct 1 ATGGCGGCGGCGATTAGGATTCGGGCGGTGGCGGCTGGAGCGAGGCTCAGCGTTCTGAATTGCGGCCTCGGCAT 74
Query 69 CGCGGTCCGCAGCCTTTGCAGCCAGGCCACC----TCTGTTAACGAACGCATCGAAAACAAGCGCCGGACCGCG 138
|.||..||||.|||||||||||||| || ||.|||||.||.||||||||.||||||||||...|.|||
Sbjct 75 CACGACCCGCGGCCTTTGCAGCCAG----CCGGTTTCAGTTAAAGAGCGCATCGACAACAAGCGCCATGCAGCG 144
Query 139 CTGCTGGGAGGGGGCCAACGCCGTATTGACGCGCAGCACAAGCGAGGAAAGCTAACAGCCAGGGAGAGGATCAG 212
.||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 145 TTGCTGGGAGGAGGCCAGCGCCGCATCGACGCGCAGCACAAGCGA----------------------------- 189
Query 213 TCTCTTGCTGGACCCTGGCAGCTTTGTTGAGAGCGACATGTTTGTGGAACACAGATGTGCAGATTTTGGAATGG 286
Sbjct 190 -------------------------------------------------------------------------- 189
Query 287 CTGCTGATAAGAATAAGTTTCCTGGAGACAGCGTGGTCACTGGACGAGGCCGAATCAATGGAAGATTGGTTTAT 360
|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 190 -----------------TTTCCCGGAGATAGTGTGGTCACTGGACGGGGCCGAATCAATGGACGATTGGTTTAT 246
Query 361 GTCTTCAGTCAGGATTTTACAGTTTTTGGAGGCAGTCTGTCAGGAGCACATGCCCAAAAGATCTGCAAAATCAT 434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 247 GTCTTCAGTCAGGATTTTACAGTTTTTGGAGGCAGTCTGTCAGGAGCACATGCTCAAAAGATCTGCAAAATCAT 320
Query 435 GGACCAGGCCATAACGGTGGGGGCTCCAGTGATTGGGCTGAATGACTCTGGGGGAGCACGGATCCAAGAAGGAG 508
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||..|.|||||.||.||.|
Sbjct 321 GGACCAGGCCATAACAGTGGGGGCTCCAGTGATCGGGCTCAATGACTCCGGGGGCGCCAGAATCCAGGAGGGGG 394
Query 509 TGGAGTCTTTGGCTGGCTATGCAGACATCTTTCTGAGGAATGTTACGGCATCCGGAGTCATCCCTCAGATTTCT 582
|||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 395 TGGAGTCCTTGGCTGGCTACGCGGACATCTTCCTGAGGAATGTCACAGCGTCTGGAGTCATCCCGCAGATTTCT 468
Query 583 CTGATCATGGGCCCATGTGCTGGTGGGGCCGTCTACTCCCCAGCCCTAACAGACTTCACGTTCATGGTAAAGGA 656
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 469 CTGATCATGGGCCCGTGTGCTGGTGGGGCCGTCTACTCCCCTGCCCTAACAGACTTCACATTCATGGTGAAGGA 542
Query 657 CACCTCCTACCTGTTCATCACTGGCCCTGATGTTGTGAAGTCTGTCACCAATGAGGATGTTACCCAGGAGGAGC 730
|||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||.|||
Sbjct 543 CACATCTTACCTGTTTATCACTGGCCCTGAAGTTGTGAAGTCTGTTACCAATGAGGATGTCACTCAAGAGCAGC 616
Query 731 TCGGTGGTGCCAAGACCCACACCACCATGTCAGGTGTGGCCCACAGAGCTTTTGAAAATGATGTTGATGCCTTG 804
|.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||..||
Sbjct 617 TGGGTGGTGCCAAGACCCACACCACTGTGTCAGGTGTGGCCCATAGAGCTTTCGACAATGATGTTGATGCTCTG 690
Query 805 TGTAATCTCCGGGATTTCTTCAACTACCTGCCCCTGAGCAGTCAGGACCCGGCTCCCGTCCGTGAGTGCCACGA 878
|||||.||.||.||.||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 691 TGTAACCTGCGTGAATTCTTCAATTTCCTGCCCCTCAGCAGCCAGGACCCGGCTCCCATCCGAGAGTGCCATGA 764
Query 879 TCCCAGTGACCGTCTGGTTCCTGAGCTTGACACAATTGTCCCTTTGGAATCAACCAAAGCCTACAACATGGTGG 952
.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 765 CCCCAGTGACCGTCTGGTTCCTGAGCTGGACACAGTTGTCCCTTTGGAGTCAAGCAAAGCCTACAACATGCTGG 838
Query 953 ACATCATACACTCTGTTGTTGATGAGCGTGAATTTTTTGAGATCATGCCCAATTATGCCAAGAACATCATTGTT 1026
|||||||.|||.|.||..||||.|||.|.||.|||||||||||.|||||||.|||.||.||.||.||..|.|||
Sbjct 839 ACATCATCCACGCAGTGATTGACGAGAGAGAGTTTTTTGAGATAATGCCCAGTTACGCAAAAAATATTGTCGTT 912
Query 1027 GGTTTTGCAAGAATGAATGGGAGGACTGTTGGAATTGTTGGCAACCAACCTAAGGTGGCCTCAGGATGCTTGGA 1100
||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 913 GGCTTCGCAAGAATGAATGGGAGGACCGTTGGAATTGTCGGCAACCAGCCCAATGTGGCCTCAGGGTGCTTGGA 986
Query 1101 TATTAATTCATCTGTGAAAGGGGCTCGTTTTGTCAGATTCTGTGATGCATTCAATATTCCACTCATCACTTTTG 1174
.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 987 CATTAATTCATCCGTGAAGGGGGCTCGTTTTGTCAGATTCTGTGACGCATTCAACATTCCCCTCATCACTTTCG 1060
Query 1175 TTGATGTCCCTGGCTTTCTACCTGGCACAGCACAGGAATACGGGGGCATCATCCGGCATGGTGCCAAGCTTCTC 1248
||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1061 TTGACGTCCCTGGCTTCCTGCCTGGCACGGCGCAGGAGTATGGGGGCATCATCAGGCATGGTGCCAAGCTGCTC 1134
Query 1249 TACGCATTTGCTGAGGCAACTGTACCCAAAGTCACAGTCATCACCAGGAAGGCCTATGGAGGTGCCTATGATGT 1322
|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 TACGCGTTCGCCGAGGCAACTGTGCCCAAAATCACAGTCATCACCAGGAAGGCCTATGGAGGTGCCTATGATGT 1208
Query 1323 CATGAGCTCTAAGCACCTTTGTGGTGATACCAACTATGCCTGGCCCACCGCAGAGATTGCAGTCATGGGAGCAA 1396
|||||||||.||.||||||..||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1209 CATGAGCTCCAAACACCTTCTTGGTGACACCAACTATGCCTGGCCCACAGCTGAGATTGCGGTCATGGGAGCAA 1282
Query 1397 AGGGCGCTGTGGAGATCATCTTCAAAGGGCATGAGAATGTGGAAGCTGCTCAGGCAGAGTACATCGAGAAGTTT 1470
||||.|||||||||||||||||||||||.||..|..||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.
Sbjct 1283 AGGGTGCTGTGGAGATCATCTTCAAAGGACACCAAGATGTGGAAGCCGCCCAGGCAGAGTATGTGGAGAAGTTC 1356
Query 1471 GCCAACCCTTTCCCTGCAGCAGTGCGAGGGTTTGTGGATGACATCATCCAACCTTCTTCCACACGTGCCCGAAT 1544
||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1357 GCCAACCCTTTCCCAGCAGCCGTGAGAGGGTTTGTGGATGACATCATCCAGCCATCCTCTACTCGTGCTCGGAT 1430
Query 1545 CTGCTGTGACCTGGATGTCTTGGCCAGCAAGAAGGTACAACGTCCTTGGAGAAAACATGCAAATATTCCATTG 1617
.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 1431 ATGCTGTGACCTGGAAGTCCTGGCCAGCAAGAAGGTCCATCGTCCCTGGAGGAAACATGCAAATATCCCACTG 1503