Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466288
- Subject:
- XM_006514511.2
- Aligned Length:
- 1988
- Identities:
- 977
- Gaps:
- 928
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGTCAAGCTGCAGCCCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCTACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACTCAGGCTCAGACCACTGCCACCTACGGGCAGACTGCATATGCAACTTCTTACGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACT------------------GGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTA 278
||| |||||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 ACTGTAGAAGGGACCAGTACAGGTTATAGCACTCCAACTGCCCCGCAGGCGTACAGCCAGCCTGTGCAGGGATA 296
Query 279 TGGCACTGGTGCTTATGATACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCAT 352
|||||||||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.||||||
Sbjct 297 TGGCACTGGGACTTATGACAGCACCACTGCTACAGTCACCACAACGCAGGCCTCTTACGCAGCTCAGACTGCAT 370
Query 353 ATGGCACTCAGCCTGCTTATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGA 426
|||||||.||||||||.||.||..|||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 371 ATGGCACCCAGCCTGCCTACCCCACCTATGGCCAGCAGCCAACAGCCACCGCACCTACCAGACCACAGGATGGT 444
Query 427 AACAAGCCCACTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACA 500
||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACAAGCCTGCTGAGACTAGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTATAACCAACCCAGCCTAGGATATGGACA 518
Query 501 GAGTAACTACAGTTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTC 574
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 519 GAGTAACTACAGCTATCCCCAGGTACCTGGGAGCTACCCAATGCAGCCAGTCACCGCACCTCCATCTTATCCTC 592
Query 575 CTACCAGCTATTCCTCTACACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAA 648
||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 CTACCAGCTACTCCTCTTCACAGCCGACTAGTTACGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAG 666
Query 649 CCGAGCAGCTATGGACAGCAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCC 722
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CCGAGCAGCTATGGACAACAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCTACTAGTTACCC 740
Query 723 ACCCCAAACTGGATCCTACAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 796
.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCTCAGACTGGATCCTACAGCCAGGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTT 814
Query 797 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATTCCGACAGGACCACCCCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAG 888
Query 871 AACCGGAGCATGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 944
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AACCGGAGCTTGAGTGGCCCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGG 962
Query 945 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGTAATGGG----GTTACAAAGTGAG------------AGCCTTGTATACACT 1002
|||||||||||||||||||||||.|.|||| |.|..|.||.||| |||||.||..||.|.
Sbjct 963 TGGGCGGGGAGGAGGACGCGGTGGACTGGGCAGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCA 1036
Query 1003 T-----------CA-ATACTTAA-------------AAAGTACCCG-----TACT-------CAGT---ACTCA 1036
| || || |||.| |.||..|||| .||| |||| |.|.|
Sbjct 1037 TGGATGAAGGACCAGAT-CTTGATCTAGGCCTTCCTATAGATCCCGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTA 1109
Query 1037 GCCGGCAGCAT--AATGAAAAGTGGGAC---------------------------------------------- 1062
...|..||.|| |||||.|| ||.|||
Sbjct 1110 TGTGCAAGGATTAAATGACAA-TGTGACTCTGGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTCAAG 1182
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1183 ATGAACAAGAGAACTGGACAACCCATGATCCATATCTACCTGGATAAGGAGACAGGAAAGCCTAAAGGGGACGC 1256
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1257 CACAGTGTCCTATGAAGATCCACCAACTGCAAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGAA 1330
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1331 GCAAACTTAAAGTGTCTCTTGCCCGAAAGAAGCCTCCAATGAACAGCATGCGGGGAGGCATGCCACCTCGTGAG 1404
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1405 GGCAGGGGGATGCCACCACCACTTCGTGGAGGTCCTGGTGGCCCAGGAGGCCCTGGAGGACCCATGGGTCGCAT 1478
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1479 GGGAGGCCGTGGAGGAGACAGAGGGGGCTTCCCTCCAAGAGGGCCCCGAGGCTCCAGAGGAAACCCCTCTGGAG 1552
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1553 GAGGAAATGTCCAGCACCGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCGGGCTGTGGAAACCAGAACTTCGCTTGG 1626
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1627 AGAACAGAATGCAACCAGTGTAAGGCCCCTAAGCCCGAGGGCTTCCTCCCGCCACCCTTTCCACCTCCGGGTGG 1700
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1701 TGATCGTGGACGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGAGGAGGAAGAGGAGGACTCATGGACCGTGGTGGTCCTGGAG 1774
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1775 GAATGTTCAGAGGTGGCAGAGGTGGAGACAGAGGAGGCTTCCGAGGTGGCCGTGGAATGGACCGAGGTGGCTTT 1848
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1849 GGTGGAGGAAGACGAGGTGGTCCTGGGGGGCCTCCTGGACCTTTAATGGAACAGATGGGAGGAAGAAGAGGCGG 1922
Query 1063 ---------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1923 ACGTGGAGGACCTGGGAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAACGCAGAGACCGGCCCTAC 1986
