Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466300
• Subject: XM_011512419.2
• Aligned Length: 2367
• Identities: 1957
• Gaps: 408

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGAGCCGGGCGGTGGTGAGAGCCAGGCGCTGCCCGCAGTGTCCCCAAGTCCGGGCCGCGGCCGCCGCCCC  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGCCTCTGT  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct   75  CGCCTGGGCCGCGCTCCCCCTCTCCCGCTCCCTCCCTCCCTGCTCCAACTCCTCCTCCTTCTCCATGCCTCTGT  148

Query   11  TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTGCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC  84
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  149  TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTCCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCA-------------------  203

Query   85  ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG  158
                                                                                      
Sbjct  204  --------------------------------------------------------------------------  203

Query  159  TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG  232
                                                                                      
Sbjct  204  --------------------------------------------------------------------------  203

Query  233  ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT  306
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  204  -------------------------------------------------------------AGGCAAATACTGT  216

Query  307  GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT  380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT  290

Query  381  CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA  364

Query  455  CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA  438

Query  529  TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC  602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC  512

Query  603  AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA  586

Query  677  ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG  750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG  660

Query  751  GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG  824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG  734

Query  825  GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG  898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG  808

Query  899  ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC  882

Query  973  ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA  1046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA  956

Query 1047  CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT  1120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT  1030

Query 1121  TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG  1194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG  1104

Query 1195  GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG  1268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG  1178

Query 1269  CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC  1342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC  1252

Query 1343  AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC  1416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC  1326

Query 1417  GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC  1490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC  1400

Query 1491  TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC  1564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC  1474

Query 1565  CTTACTGGGACCGGGCAGGTTTTTATTTAATGGTCTCTTTGGCTTGCCGTCACAATGAAGGTTGGTGGAAAGGA  1638
            ||||||||||||||||                                          ||||||||||||||||
Sbjct 1475  CTTACTGGGACCGGGC------------------------------------------AGGTTGGTGGAAAGGA  1506

Query 1639  ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGTGAAGTTAA  1712
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1507  ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGCGAAGTTAA  1580

Query 1713  TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG  1786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG  1654

Query 1787  GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA  1860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA  1728

Query 1861  GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA  1934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729  GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA  1802

Query 1935  TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA  2008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803  TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA  1876

Query 2009  AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC  2082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC  1950

Query 2083  TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA  2156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951  TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA  2024

Query 2157  GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT  2229
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025  GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT  2097