Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466306
- Subject:
- XM_011243289.2
- Aligned Length:
- 1336
- Identities:
- 1084
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCTCCTCGGTCCCACCAGCCACGGTATCGGCGGCGACAGCAGGCCCCGGCCCAGGTTTCGGCTTCGC 74
||||||||||||||.|||||.||.|||||.|.|.|.|||||..|.|.||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCTCCTCCGTCCCTCCCGCCACCGCACCCGCGGCAGCTGGAGGCCCCGGCCCGGGATTCGGCTTCGC 74
Query 75 CTCCAAGACCAAGAAGAAGCATTTCGTGCAGCAGAAGGTGAAGGTGTTCCGGGCGGCCGACCCGCTGGTGGGTG 148
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 75 CTCCAAAACCAAGAAGAAGCATTTCGTACAGCAGAAAGTGAAGGTGTTCCGGGCCGCGGACCCGCTGGTGGGCG 148
Query 149 TGTTCCTGTGGGGCGTAGCCCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTGCCTCCCCCGGTGATGCTGCTGCCAGAT 222
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 149 TGTTCCTGTGGGGCGTCGCTCACTCGATCAATGAGCTCAGCCAGGTACCGCCCCCAGTGATGTTGCTGCCAGAT 222
Query 223 GACTTTAAGGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACCTTTTCCACAGGGAAAATCTGCCCAGTCATTTCAA 296
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GACTTTAAAGCCAGCTCCAAGATCAAGGTCAACAATCACTTTTTCCATAGAGAAAATCTTCCCAGTCATTTCAA 296
Query 297 GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTCCGTGATCGATTTGGCATTGATGACCAAGATTACTTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||.|||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 297 GTTCAAGGAGTATTGTCCCCAGGTCTTCAGGAACCTGAGAGATCGGTTTGCCATCGATGATCACGATTACTTGG 370
Query 371 TGTCCCTTACCCGAAACCCCCCCAGCGAAAGTGAAGGCAGTGATGGTCGCTTCCTTATCTCCTACGATCGGACT 444
||||||||||.||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 371 TGTCCCTTACTCGAAGCCCCCCAAGCGAAACTGAAGGCAGTGATGGCCGTTTCCTTATCTCCTATGACCGCACT 444
Query 445 CTGGTCATCAAAGAAGTATCCAGTGAGNACATTGNTGACATNCATAGCAACNTNNCCAACTATCACCAGTACAT 518
|||||||||||.|||||.||.||.||..|.||||..||.||.||.||||||.|..|||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CTGGTCATCAAGGAAGTGTCGAGCGAAGATATTGCGGATATGCACAGCAACCTCTCCAACTACCACCAGTACAT 518
Query 519 TGTGAAGTGCCATGGCAACACGCNTNTGCCCCAGTTCNTGGGGATGTACCGAGTCAGTGTGGACAACGAAGACA 592
.|||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 519 AGTGAAATGTCATGGCAACACGCTTCTGCCCCAGTTCCTGGGCATGTACCGAGTCAGTGTAGAAAATGAAGACA 592
Query 593 GCTACATGCTTGTGATGCGCAATATGTTTAGCCACCGTCTTCCTGTGCACAGGAAGTATGACCTCAAGGGTTCC 666
||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 593 GCTACATGCTCGTGATGCGCAATATGTTTAGTCATCGTCTTCCTGTGCATAGGAAGTATGACCTCAAGGGCTCT 666
Query 667 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAATTGCCCACCCTTAANGATATGGACTTTCTCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 CTAGTGTCCCGGGAAGCCAGCGATAAGGAAAAGGTTAAAGAACTGCCAACACTAAAGGATATGGACTTTCTTAA 740
Query 741 CAAGAACCAGAAAGTATATATTGGTGANNNGNAGAAGAAAA-----TATTTCTGGAGAAGCTGAA--GAAGNNG 807
|||||||||||||||.||||||||||| ||||||||| ||||.|||||||||||||| || |
Sbjct 741 CAAGAACCAGAAAGTGTATATTGGTGA-----AGAAGAAAAGAAAGTATTCCTGGAGAAGCTGAAGCGA----G 805
Query 808 ATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTTCTGCTAGGCATCCACGACATCATTCGGGGC 881
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 806 ATGTGGAGTTTCTAGTGCAGCTGAAGATCATGGACTACAGCCTCCTGTTGGGCATCCACGACATCATCCGGGGC 879
Query 882 TCTGAACCAGAGGAGGAAGCGCCCGTGCGGGAGGATGAGTCAGAGGTGGATGGGGACTGCAGCCTGACTGGACC 955
||||||||.|||||.||.|.|||.|||.|||||||.|||||.|||..||||||||||||.|.||||.|||||||
Sbjct 880 TCTGAACCCGAGGAAGAGGGGCCTGTGAGGGAGGAGGAGTCTGAGTGGGATGGGGACTGTAACCTGGCTGGACC 953
Query 956 TCCTGCTCTGGTGGGCTCCTATGGCACCTCCCCAGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCATCGGCCCCTGG 1029
|||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 954 TCCCGCCCTGGTGGGCTCCTATGGTACCTCCCCTGAGGGTATCGGAGGCTACATCCATTCCCACCGGCCACTGG 1027
Query 1030 GCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATTGATGTCTATGCCATCCGGAGTGCTGAAGGAGCCCCCCAGAAGGAGGTC 1103
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1028 GCCCAGGAGAGTTTGAGTCCTTCATCGATGTCTATGCTATCCGGAGTGCGGAGGGGGCCCCCCAGAAGGAGGTG 1101
Query 1104 TACTTCATGGGCCTCATTGATATCCTTACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAAACTGT 1177
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1102 TATTTCATGGGCCTCATTGACATTCTGACACAGTATGATGCCAAGAAGAAAGCAGCTCATGCAGCCAAGACTGT 1175
Query 1178 CAAGCA----------------------------------------------------------------TGGG 1187
|||||| ||||
Sbjct 1176 CAAGCACGGGGTGAGGGTTCCCCACAGCCTTTCCTCTCCTGGCCTGACTGTTCTCTGGAAAGAACGCTTCTGGG 1249
Query 1188 GCTGGGGCAGAGATCTCTACTGTCCATCCGGAGCAGTATGCTAAGCGATTCCTGGATTTTATTACCAACATCTT 1261
||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1250 GCGGGGGCAGAGATCTCCACTGTCCATCC--------------------------------------------- 1278
Query 1262 TGCC 1265
Sbjct 1279 ---- 1278