Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466325
• Subject: XM_006524197.2
• Aligned Length: 2619
• Identities: 2317
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGAGACGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||.|||||||||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  371  TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  741  TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCA  1110
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..
Sbjct 1037  CAGAGCCACATCACGAACTTGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGC  1110

Query 1111  AACAAGAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGA  1184
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  AACAAGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGA  1184

Query 1185  AGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGT  1258
            |||.||.|||||.||.|||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  AGGCGACGATGACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAAT  1258

Query 1259  CTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCA  1332
            |.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||
Sbjct 1259  CCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCA  1332

Query 1333  GGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGC  1406
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||.
Sbjct 1333  GGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGT  1406

Query 1407  CTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAAC  1480
            .||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.|
Sbjct 1407  TTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGC  1480

Query 1481  ATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACA  1554
            |.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  AAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACA  1554

Query 1555  CCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATC  1628
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||
Sbjct 1555  CCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATC  1628

Query 1629  ATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTA  1702
            .||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1629  CTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCA  1702

Query 1703  ATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGC  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1703  ATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGC  1776

Query 1777  TTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACA  1850
            .||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACA  1850

Query 1851  AATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTAT  1924
            .|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1851  GATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTAT  1924

Query 1925  CAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATAC  1998
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925  CAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTAC  1998

Query 1999  CTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAA  2072
            ||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAA  2072

Query 2073  GCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTT  2146
            |||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.
Sbjct 2073  GCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTC  2146

Query 2147  TAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCACCGGCTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCT  2220
            |.||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||...|.||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  TGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCT  2220

Query 2221  ACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATAC  2294
            |||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 2221  ACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACAC  2294

Query 2295  CATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGT  2368
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2295  CATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGT  2368

Query 2369  CATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAA  2442
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2369  CATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAA  2442

Query 2443  CATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAG  2516
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 2443  CACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAG  2516

Query 2517  GCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGT  2590
            .||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2517  ACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTAT  2590

Query 2591  ACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC  2619
            |||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2591  ACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC  2619