Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466457
• Subject: XM_011541963.2
• Aligned Length: 1235
• Identities: 1035
• Gaps: 199

Alignment

Query    1  ATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACCTCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTGCTCACGGGTGCCCTCTGAACAGTCTTCTGGTACCTCTCTCTTGCCTAAAGACGGTGCCCCATTTTC  74

Query   75  TTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCTGGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGGGATTCCTTGGATGAGGATGGATTGGATGACTCCTTGCTGGAGCTGTCAGAGGGAGAAGAAGATGATGGTG  148

Query  149  ATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGGAAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTAAATTACACAGAGGAAGAGATTGATGCACTGTTGAAGGAAGATGACCCATCATATGAGCAGTCTTCTGGG  222

Query  223  GAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGTCAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGATGATGGTGGGCATGTTGAGAAGGGAGAAAGAGGGAGTCAAATTCTACTTGATACTCCCCGAGAGAAAAA  296

Query  297  TTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCTCTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCATCGTACAGCCTGGGACCAGTAGCTGAGACTCCTGACCTCTTCAAACTACCTCAGCTAAGTACATCAAGTG  370

Query  371  GTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTGTACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCATGGACCAGCTCATACTAAACCATTAAACAGACGCTCTGTACTAGAAAAGAATCTTATAAAAGTAACTGTT  444

Query  445  GCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAGGACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCACCATTTAATCCAACAGTTTGTGATGCTCTGCTTGATAAGGACGAGACTGATTCGTCCAAAGATACTGAAAA  518

Query  519  ACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAGCCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTCTCTTCCCTTGGAGAAGAGATGAGAGAAGATGGTCTTAGCCCAAATGAAAGCAAACTTTGTACTGAATCTG  592

Query  593  AAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGCTCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGGATCAGCCCCAATAACTCTGCCTGGAATGGGCCCCAGCTCTCTTCTTCAAACAATAACTTTCAACAGACT  666

Query  667  GTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCTGTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCTCTGATAAAAATATGCCTGACAGTGAGAACCCTACGTCTGTATTCTCTCGGATCTCAGACCATTCAGAGAC  740

Query  741  TCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAAGTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTAATATGGAGTTATCCTGCAGAAATGGTGGTTCACACAAGTCAAGTTGTGAAATGAGATCTCTGGTTGTTT  814

Query  815  CCACCTCATCAAACAAACAGGATGTTCTTAACAAGGATTCTGGGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCACCTCATCAAACAAACAGGATGTTCTTAACAAGGATTCTGGGAAGATGAAAGGCCATGAGAGAAGACTAGGC  888

Query  889  AAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTTCCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGTCATTCCTGTTCTACAAACTAAGACCAGGACTAATGTTCCGACGTTTTCACAGTCAAATCTAGAACAGCA  962

Query  963  GAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGACCCAGAGGACACTAACCAAG-------GTATC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       .|| |
Sbjct  963  GAAGCAGCTTTATCTCAGGAGTGTCATTGCTCATATAGAAGACCCAGAGGACACTAACCAAGCCAAAAAATA-C  1035

Query 1030  TCGGGGG----AGCTTTGTGCCTTGATGGATCAAGTTCATCATATGCAGCACTCAAAATGGCAGCATCCTTCGG  1099
            |    ||    |||||                                                          
Sbjct 1036  T----GGAAACAGCTT----------------------------------------------------------  1047

Query 1100  ACCTCACCACGCGAAACTACGCCCGCCGACAGAAACATCTGCAAAGATACAGTCTGACTCAGTGGGTTGACAGG  1173
                                                                                      
Sbjct 1048  --------------------------------------------------------------------------  1047

Query 1174  AACATGCGAAGCCACCATCGGTTCCAGCGTCTCCCAGACTTCTCGTACAGA  1224
                                                               
Sbjct 1048  ---------------------------------------------------  1047