Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466472
- Subject:
- NM_001320316.1
- Aligned Length:
- 2314
- Identities:
- 2222
- Gaps:
- 86
Alignment
Query 1 ATGA------GCCACGCAGTAACCATCGAGGA--GCCCCAGGCC--CAGCCGCAGGTGTCTCAAACTCGGTACC 64
|||| | .||| ||| |||| |||.|||.|| |..|||| |||
Sbjct 1 ATGATTTTCTG-TACG--GTA-------AGGACCGCCGCAGACCTTCCTCCGC----GTC-------------- 46
Query 65 GGGAGAGGTCGCGGGCTGGGAGCCACATCTCCT---CCAATCGAGCGTATGATTTTCTGTACGATCCATTGTTT 135
.||||| ||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 47 ------CGTCGC----------------CTCCTAGGCCA-----------------------GATCCATTGTTT 75
Query 136 ATTGTGTCAAGTGAGAAAGACCATACACAGGCAAATATCCAAGCTACCCTGATTCGCAGCAGACTGAGAAAAGT 209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 ATTGTGTCAAGTGAGAAAGACCATACACAGGCAAATATCCAAGCTACCCTGATTCGCAGCAGACTGAGAAAAGT 149
Query 210 TCCCAGGTTTAAAACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATACTCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATC 283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 TCCCAGGTTTAAAACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATACTCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATC 223
Query 284 CTGTCCCACCATTTATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACC 357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 CTGTCCCACCATTTATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACC 297
Query 358 ACAACTGACGCTTCTTTTCAGATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAA 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 ACAACTGACGCTTCTTTTCAGATGCCTAAAGAAGTTTATGAAGATCCTGAAGTTACTGGAAAGAATCGCTATAA 371
Query 432 ATACTTTGAAAGGCCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAG 505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 ATACTTTGAAAGGCCTTTTCTCCCATTTTTTCAGCAGATGCCATTCAATGTTGTTTATGCCGTATCCAAGGCAG 445
Query 506 AACCATACACTTTTCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACT 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 AACCATACACTTTTCCTCCTACTTCTACTAAGCACCTATCCATCCCTTCAAAGTCTACTGTGGGCACTCAGACT 519
Query 580 GATTATCGGGATGCTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTCCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGA 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 GATTATCGGGATGCTGACGTTCAAACAGATCCATACTCTCCAGAATATGTAGTATGTCAGGACTCAATCCCTGA 593
Query 654 GCTCTTGACCCTGGCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAA 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 GCTCTTGACCCTGGCTACGCTTACTTGGGGTCGGGGTCTCCCAGCAGGACAAGCTGAGGTGGAGATGATAGAAA 667
Query 728 GAGCCCGCGAGAAGCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGG 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 GAGCCCGCGAGAAGCGTGCTTGGGAAGCCTCTCTCCCCGCTCTGAGTGACACCTCCCAGTTTGAGAAGAGGAGG 741
Query 802 AAAATGATGAATGAAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCG 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 AAAATGATGAATGAAATGGAGAGGAAGGAGTGGGCCTTCAGAGAGCAGGAGATTGAAAAACTGCAGGAGATTCG 815
Query 876 CCTGGAAGTTCTAAAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATG 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 CCTGGAAGTTCTAAAAGAGCTGTTGAGGAAGCGTGAAGAGAATCAGAATGAAGTGAATATGAAGCACTTGAATG 889
Query 950 CCCGGTGGTCTAAACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATC 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 CCCGGTGGTCTAAACTGCAGGAGGGAAAAGAGGCAAAAATGGCAAAAATTCAGCGCACGCATGTATCAACAATC 963
Query 1024 AGAAAACTTGTAGGAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGA 1097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 AGAAAACTTGTAGGAAAGAGAAAGAATATAGAAGGGAAGTTGGAGAGAAGAAATATCATCAAGGATTATTCTGA 1037
Query 1098 TTATGCATCACAGGTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAG 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 TTATGCATCACAGGTCTATGGACCTCTGTCTCGTCTTGGGTGTTTCCCAGACAACAACTCAGAGGACTTTGTAG 1111
Query 1172 TAAAAAACTACTATCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAA 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 TAAAAAACTACTATCTCAACACCTATGAAGGATTAGTGGAACTTGAGTCATGTCTCCCAGATTTTGTGACACAA 1185
Query 1246 CCCCAAATCAGAGCTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 CCCCAAATCAGAGCTCCAAAACCTAAAGTCATTACCACCAAAGCTGGTTTTCTGAAGAGGGCAGCAAGGTTGGA 1259
Query 1320 CTATGAGTTGGCAGAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTC 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CTATGAGTTGGCAGAGGTTCATAAGGCACTGTTGGATAAGAAGAATAAAGTTCTTGAAGTAAAGAAACCCCCTC 1333
Query 1394 GCTTCCTTCAAAGAAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAA 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 GCTTCCTTCAAAGAAACCCAATACCTCAACCTCGGCTTCCAACTCCAACCTTGGAAATGACGTCCAATGAAGAA 1407
Query 1468 GAAGAAATGGAAATGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGA 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 GAAGAAATGGAAATGGCTGTGATCTACCTTCAAAAGTTACTCCGGGGCAGAGTCGTTCAGAACATGATGTTTGA 1481
Query 1542 AGGGAAAGAAAAGCGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGG 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AGGGAAAGAAAAGCGACTGGAGTTGATCCAGGAGTTGCGCACCTGCCACGCACTACAAGAAGATGAAAAGCTGG 1555
Query 1616 TGAAAAAAGCCGAGAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTG 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 TGAAAAAAGCCGAGAAGCAAGTGACCCTGGCCTTACAGCGGCAGAGGAACTTGCATGAGCACAAGGTGTCACTG 1629
Query 1690 GTTGAAAACCATTTGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGT 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 GTTGAAAACCATTTGGCCGGACTGGAAGGAAGGGCACTAGCAGACATGTTTGACTTCCTGTCCAAAGAGCTGGT 1703
Query 1764 GAGACTGCAGGAGGAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTG 1837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 GAGACTGCAGGAGGAGAGGAGGATCCATGCCTTTGTCATGCTGGCTGAGCGCCAGCGGCGGGTACGAGAGGCTG 1777
Query 1838 AAGAGAGTGGTCGGCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 AAGAGAGTGGTCGGCGCCAGGTGGAAAAACAGCGCCTGCGGGAGGAGGACGAGATATTTAAGGAGGTGGTTAAA 1851
Query 1912 GTTCACCATAGTACTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACA 1985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 GTTCACCATAGTACTATAAGCTCCTACCTAGAAGACATAATACTGAATACCGAAGCGAATACTGCAGAAGAACA 1925
Query 1986 AGCCAGGGCAGAAATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCT 2059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 AGCCAGGGCAGAAATAGAGAAGATGGCTGAGAAAATCAATGACATTGCTTATGAAATGGAAAGCCGCCGAACCT 1999
Query 2060 ATCTTCAGTCAGAGGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTC 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 ATCTTCAGTCAGAGGAGATTGTTGCTGAGTTGGTTTATAGTTTTCTGATCCCAGAGGTGCAAAAATACTTTGTC 2073
Query 2134 AAAGAAAAAGTGAGGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAG 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 AAAGAAAAAGTGAGGAACGCACAGCGGAAACATATTCTTGCAGCCCATCAGATCATCCACAGTTACACGGAAAG 2147
Query 2208 CATGGTTCAAAAGAAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAA 2281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 CATGGTTCAAAAGAAATTAACTGAGGGAGAGCAAGATGAGGCCTCAAATGCTGCCATGTTACTTGAGAAAGAAA 2221
Query 2282 CTCAAAATGAGAACAACAGC 2301
||||||||||||||||||||
Sbjct 2222 CTCAAAATGAGAACAACAGC 2241